circFBXL5在乳腺癌肺转移中的作用及机制研究

发布时间：2021-10-05 02:52

　　研究背景乳腺癌是全球范围内最常见的恶性肿瘤之一,其发病率高居所有女性恶性肿瘤的首位。同样,我国女性乳腺癌发病率仍居女性恶性肿瘤的第一位,死亡率排第五位,且发病呈现上升及年轻化趋势。乳腺癌的死因90%系肿瘤远处转移所致,其中尤以肺转移预后较差。乳腺癌肺转移的机制尚未阐明,多项研究表明可能与上皮间质化（Epithelial-mesenchymal transition,EMT）、乳腺癌干细胞、肿瘤微环境、循环肿瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞、非编码RNA等有关。环状RNA（circular RNA,circRNA）是一类具有5’端的帽和3’端的尾的单链共价环状结构的非编码RNA。研究发现,circRNAs在乳腺癌中表达失调可能参与乳腺癌的发生、发展、细胞增殖与凋亡、转移及耐药等调控。乳腺癌的转移具有明显的器官选择特性,有研究者采用RNA测序,筛选与鉴定出乳腺癌脑转移相关的circRNAs,但原发癌与肺转移癌circRNAs差异表达的确切机制仍待研究。目的与意义本课题选取原发乳腺癌及肺转移癌组织,筛选出差异表达circRNAs,挑选表达水平差异最大的circRNAs,进行功能及机制分析,探讨cir... 

【文章来源】：南华大学湖南省

【文章页数】：162 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

人类环状RNA芯片V2表达谱芯片筛选乳腺癌组织及同一患者肺转移组织中表达差异的circRNA

南华大学博士学位论文162归一化原始数据然后扫描结果的tiff格式图用FeatureExtraction软件分析，得到原始数据文件，格式为.txt。然后采用GeneSpringGX软件对每个样品的数据归一化和质量分析。结果显示，归一化后不同样本总体基因的表达水平趋于同一水平（见图1.2）。图1.2人类环状RNA表达谱芯片结果归一化及数据质量分析红色为primarytumor组，蓝色为lungmetastasistumor组，左侧图为原始数据，右侧图为经GeneSpringGX软件对每个样品的数据归一化和质量分析后的结果，归一化后不同样本总体基因的表达水平趋于同一水平。3比对乳腺癌原位组织与肺转移组织中circRNA表达差异通过分析归一化后的原始数据，比对乳腺癌原位组织与肺转移组织中circRNA表达差异，并采用散点图分析两组间差异表达的circRNA的量及差异情况。结果发现差异表达的circRNA477个，其中表达上调的circRNA268个，表达下调的209个。（见图1.3）。

第一部分筛选乳腺癌组织及肺转移组织中表达差异的circRNA17图1.3乳腺癌原位组织与肺转移组织中circRNA表达差异统计横坐标表示primarytumor组样本平均表达值，纵坐标表示lungmetastasistumor组样本的平均表达值，横坐标和纵坐标均使用进行log2转换后的值。标注为红色的是上调的基因，标注为绿色的是下调的基因，标注为黑色的是无显著差异基因。4分析乳腺癌原位组织与肺转移组织中差异表达circRNA所处基因组位置的差异采用CircosPlot分析两组中差异表达circRNA所处基因组位置的差异，结果显示，两组间差异表达的circRNA均匀分布于基因组（见图1.4）。

【参考文献】：
期刊论文
[1]Noncoding RNAs in gastric cancer: Research progress and prospects[J]. Meng Zhang,Xiang Du.  World Journal of Gastroenterology. 2016(29)



本文编号：3418854