UCA1/miR-203/ZEB2轴对胃癌侵袭转移作用及其机制的研究
发布时间：2021-10-09 06:40
背景:胃癌是肿瘤致死率全球排名第二的肿瘤,也是中国人群常发的恶性肿瘤。近年尽管人们在手术、化疗、放疗等治疗手段上做出了很多的改进,然而全球胃癌患者的平均五年存活率仍在10%以下。其中,肿瘤的复发和转移是胃癌治疗的最大障碍。研究者们已经从多个层面阐述胃癌发病的分子机制,包括基因突变、基因拷贝数变异、基因选择性剪切、基因融合、nc RNA以及表观遗传调控异常等等,但对胃癌的发生发展以及转移的具体分子机制仍然不清楚。近年研究发现,长链非编码RNA（long non-coding RNA,lnc RNA）在肿瘤的发生和发展过程中发挥重要的调控作用。随着对lnc RNA结构解析和功能研究的深入,研究者发现lnc RNA在胃癌中以多种机制参与调控胃癌细胞的多种生物学功能,有望成为胃癌诊治的新的候选靶分子。目的:本研究以lnc RNA UCA1为候选分子,探讨UCA1在胃癌进展中的生物学作用及其分子调控网络,以期深入理解lnc RNA在胃癌发生发展中的贡献。方法:1.采用基于R语言的limma包分析GEO数据库中胃癌组织样本lnc RNA芯片表达矩阵,下载The Cancer Genome Atla...
【文章来源】：东南大学江苏省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：124 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
UCA1在芯片和TCGA数据库中的表达分析
A、PAAD 癌组织和正常组织中的表达情况，*p＜我们通过提取胃癌组织和对应的癌旁组织 。同时，为了丰富芯片数据中胃癌病例的数胃癌 lncRNA 表达的芯片数据集，通过综合数最明显的 lncRNA，并且伴随着较高的基据库也得到验证，我们还发现 UCA1 除了在均为高表达，这些都提示 UCA1 在消化道异常高表达 UCA1 可能在胃癌的发生或发展对象。的发现不仅向我们展示了人类疾病分子结构的新靶点。差异表达的 lncRNA 作为一种
图 2-1 UCA1 在胃癌细胞系和胃癌组织中的表达情况UCA1 在临床胃癌病理组织中相对表达水平的检测(paired Student’s t-test)。B：饼图显示 UCA1 在胃织中表达水平高于癌旁组织的例数在所有病例组织例数中占的比重。C：UCA1 的表达水平与胃癌分关系。D：UCA1 在胃癌细胞系中表达水平的检测，实验重复 3 次，数据以平均数±标准差展示。2 lncRNA-UCA1 促进胃癌细胞的侵袭和转移为了研究 UCA1 在胃癌细胞系中的功能，探究其对胃癌细胞表型的影响，我们将稳定 Lv-UCA1-shRNA 和 Lv-UCA1-NC 的胃癌细胞系 BGC-823 细胞提取 RNA，进行 RNA录组测序，发现有 2562 个基因表达下调，2529 个基因表达上调（Fold-change≥2）。通过基因的 GO 分析，可以找到富集差异基因的 GO 分类条目，寻找出不同样品的差异基因和哪些基因功能的改变有关，GO 分析发现，干扰 UCA1 的表达之后，发生最显著变化O 主要富集在 adhesion，adhesion junction，anchoring junction 等细胞通路 (图 2-2 A)，在
【参考文献】：
期刊论文
[1]HOTAIR:an oncogenic long non-coding RNA in different cancers[J]. Mohammadreza Hajjari,Abbas Salavaty. Cancer Biology & Medicine. 2015(01)
[2]Analysis of long non-coding RNA expression profiles in gastric cancer[J]. Wei-Jun Cao,Hai-Lu Wu,Bang-Shun He,Yu-Shu Zhang,Zhen-Yu Zhang. World Journal of Gastroenterology. 2013(23)
本文编号：3425841
【文章来源】：东南大学江苏省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：124 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
UCA1在芯片和TCGA数据库中的表达分析
A、PAAD 癌组织和正常组织中的表达情况，*p＜我们通过提取胃癌组织和对应的癌旁组织 。同时，为了丰富芯片数据中胃癌病例的数胃癌 lncRNA 表达的芯片数据集，通过综合数最明显的 lncRNA，并且伴随着较高的基据库也得到验证，我们还发现 UCA1 除了在均为高表达，这些都提示 UCA1 在消化道异常高表达 UCA1 可能在胃癌的发生或发展对象。的发现不仅向我们展示了人类疾病分子结构的新靶点。差异表达的 lncRNA 作为一种
图 2-1 UCA1 在胃癌细胞系和胃癌组织中的表达情况UCA1 在临床胃癌病理组织中相对表达水平的检测(paired Student’s t-test)。B：饼图显示 UCA1 在胃织中表达水平高于癌旁组织的例数在所有病例组织例数中占的比重。C：UCA1 的表达水平与胃癌分关系。D：UCA1 在胃癌细胞系中表达水平的检测，实验重复 3 次，数据以平均数±标准差展示。2 lncRNA-UCA1 促进胃癌细胞的侵袭和转移为了研究 UCA1 在胃癌细胞系中的功能，探究其对胃癌细胞表型的影响，我们将稳定 Lv-UCA1-shRNA 和 Lv-UCA1-NC 的胃癌细胞系 BGC-823 细胞提取 RNA，进行 RNA录组测序，发现有 2562 个基因表达下调，2529 个基因表达上调（Fold-change≥2）。通过基因的 GO 分析，可以找到富集差异基因的 GO 分类条目，寻找出不同样品的差异基因和哪些基因功能的改变有关，GO 分析发现，干扰 UCA1 的表达之后，发生最显著变化O 主要富集在 adhesion，adhesion junction，anchoring junction 等细胞通路 (图 2-2 A)，在
【参考文献】：
期刊论文
[1]HOTAIR:an oncogenic long non-coding RNA in different cancers[J]. Mohammadreza Hajjari,Abbas Salavaty. Cancer Biology & Medicine. 2015(01)
[2]Analysis of long non-coding RNA expression profiles in gastric cancer[J]. Wei-Jun Cao,Hai-Lu Wu,Bang-Shun He,Yu-Shu Zhang,Zhen-Yu Zhang. World Journal of Gastroenterology. 2013(23)
本文编号：3425841
本文链接：https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/yxlbs/3425841.html
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