KIF20A通过PI3K-AKT信号通路促进纤维肉瘤发生发展的研究

发布时间：2021-10-23 17:13

　　软组织肉瘤是一组少见的恶性肿瘤,约占成人恶性肿瘤的1%,儿童恶性肿瘤的10%。软组织肉瘤约有50种不同亚型,它们的临床、病理以及分子学特征均有所不同。目前,软组织肉瘤的治疗仍以手术治疗与化疗为主。但存在术后复发转移、预后差以及化疗效果差等问题。随着分子病理学研究的深入,多个基因被证实与软组织肉瘤的进展相关,但是目前临床上还没有任何一种生物标志物被用于指导预后。加权共表达网络分析（Weighted Gene Co-expression Network Analysis,WGCNA）通过动态剪切树的方法,将表达相似的基因归类于同一个模块,通过临床性状和基因模块间的关联性分析,探究模块与临床性状的相关性,并通过对模块进行网络分析以及功能分析,解释基因模块的功能,筛选出具有生物学意义的核心基因。WGCNA已经在多种实体瘤中用于发现与临床性状或预后相关的基因模块和核心基因,并在实验和临床中得到较好的验证。但是,关于WGCNA在软组织肉瘤中应用的报道较为少见。驱动蛋白家族成员20A（Kinesin Family Member 20A,KIF20A）在细胞有丝分裂、细胞迁移和胞内转运中发挥作用。已有... 

【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：143 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

技术路线图

KIF20A的结构

吉林大学博士学位论文本表达数据和临床生存信息，用于模块核心基因的生存相关性验证。以上两个GEO数据集，均在GEO数据库上下载MINiML格式文件，此系列文件是xml文件的集合包含有数据集完整的芯片表达数据以及临床信息。癌症和肿瘤基因图谱（TheCancerGenomeAtlas，TCGA）是一项始于2005年的项目，其利用基因测序和生物信息学对导致癌症的基因突变进行分类。TCGA采用高通量基因组分析技术，通过更好地了解癌症的遗传基础，提高我们诊断、治疗和预防癌症的能力。BroadGDACFirehose平台是哈佛大学和麻省理工大学共同维护的TCGA数据存储平台，其包含了所有TCGA的项目数据。TCGA软组织肉瘤项目[140]包含261个软组织肉瘤的各种类型测序数据以及临床信息。本课题中我们下载此项目的基因测序数据和临床信息，用于对WGCNA模块进行保守性分析检验以及验证核心基因的生存相关性。17图3.1BroadGDACFirehose数据存储平台Figure3.1BroadGDACFirehosedatastorageplatform


本文编号：3453574