MELK促进子宫内膜癌进展的机制研究
发布时间:2022-02-15 21:04
研究目的:子宫内膜癌(Endometrial carcinoma,EC)是女性生殖系统最常见的恶性肿瘤之一,其发病率逐年增加,并且呈现年轻化趋势。早期EC患者一般预后较好,而复发和转移的EC患者预后明显较差,常规手术及放化疗影响患者生存质量,且年轻患者对保留生育功能具有迫切要求。因此,分子靶向治疗或成为解决上述问题的关键。本课题旨在探究母体胚源性亮氨酸拉链激酶(Maternal embryonic leucine Zipper Kinase,MELK)在EC进展中的作用和功能机制,深化对EC发病机制的认识,寻求新的预后相关标记物及其抑制剂,探索分子靶向治疗EC的新思路。内容和方法:(1)利用TCGA和GEO数据库分析MELK在EC中的表达;分析MELK表达量与数据库中临床病理参数的关系。(2)采用免疫组化技术在组织芯片上进行蛋白水平检测,分析MELK表达情况与临床病理参数的关系。(3)RNAi技术干扰MELK的表达;CCK-8实验及克隆形成实验检测MELK正常及干扰后对EC细胞系HEC1A和AN3CA的增殖作用影响,通过划痕实验检测MELK对两株细胞系迁移的影响,流式细胞术检测HEC1...
【文章来源】:上海交通大学上海市211工程院校985工程院校教育部直属院校
【文章页数】:109 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
TCGA中UCEC的基本信息Figure1.1BasicinformationofTCGA
上海交通大学博士学位论文6Oncolnc:http://www.oncolnc.org/Gepia:http://gepia.cancer-pku.cn/index.htmLUalcan:http://ualcan.path.uab.edu/(4)信号通路分析网站KEGG:https://www.genome.jp/kegg/DAVID:https://david-d.ncifcrf.gov3.结果3.1LncRNASignature用来预测内膜样癌我们尝试数据库分析查找,寻找能够预测内膜样癌(EEC)预后的lncRNASignature,研究最终确立了9个lncRNA组成的Signature,能够有效预测内膜样癌的预后情况[20]。这9种lncRNA分别为:LINC00473、UBXN10-AS1、AP001021.2、AL353194.1、FAM222A-AS1、FUT8‐AS1、AP002761.3、LINC02387和AL731566.2根据风险评分,可将各组患者分为高风险组及低风险组,对Training组进行总生存分析,发现高风险组预后较差(p<0.01)在Testing组和全体患者组中进行验证发现高风险组预后较差,与Tesing组一致(图1.2)。图1.2基于9-lncRNAsignature的总生存预后分析(A)Training组(B)Testing组(C)全体患者组Figure1.2Theoverallsurvivalanalysisof9-lncRNAbasedsignaturetheTrainingset(A),Testingset(B)andentireset(C)进一步通过ROC曲线(图1.3)分析,结果显示,9个lncRNA组成的Signature(AUC=0.8488)在预测总生存率上要比肿瘤分级(AUC=0.7014)、肿瘤分期(AUC=0.5031)、患者年龄(AUC=0.702)及BMI(AUC=0.4758)的AUC(曲
上海交通大学博士学位论文7线下面积)更大,提示此lncRNASignature敏感性和特异性均高于其他临床参数特征,为临床上个体化治疗内膜样癌提供了思路。图1.39-lncRNAsignature与其他临床参数预测总生存率的敏感性比较Figure1.3Comparisonofsensitivityandspecificityforoverallsurvivalpredictionby9lncRNAsignatureandotherclinicalfactors.3.2ARKs在内膜癌中的表达分析通过主成分分析发现ARKs在内膜癌组织中表达与正常及癌旁组织存在差异(图1.4)。通过采用GEPIA网站[21],对于12种ARKs在TCGA中各肿瘤中及正常组织的表达进行分析,内膜癌组织中的ARKs表达如图1.4B。12种ARKs的预后总生存曲线如图1.5所示。结合其在EC中的表达,NUAK2,MELK,SIK2是潜在的预后相关标记物,在子宫内膜癌的进展中发挥巨大作用。
【参考文献】:
期刊论文
[1]E2F transcription factors and digestive system malignancies: How much do we know?[J]. Athanasios Xanthoulis,Dina G Tiniakos. World Journal of Gastroenterology. 2013(21)
本文编号:3627267
【文章来源】:上海交通大学上海市211工程院校985工程院校教育部直属院校
【文章页数】:109 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
TCGA中UCEC的基本信息Figure1.1BasicinformationofTCGA
上海交通大学博士学位论文6Oncolnc:http://www.oncolnc.org/Gepia:http://gepia.cancer-pku.cn/index.htmLUalcan:http://ualcan.path.uab.edu/(4)信号通路分析网站KEGG:https://www.genome.jp/kegg/DAVID:https://david-d.ncifcrf.gov3.结果3.1LncRNASignature用来预测内膜样癌我们尝试数据库分析查找,寻找能够预测内膜样癌(EEC)预后的lncRNASignature,研究最终确立了9个lncRNA组成的Signature,能够有效预测内膜样癌的预后情况[20]。这9种lncRNA分别为:LINC00473、UBXN10-AS1、AP001021.2、AL353194.1、FAM222A-AS1、FUT8‐AS1、AP002761.3、LINC02387和AL731566.2根据风险评分,可将各组患者分为高风险组及低风险组,对Training组进行总生存分析,发现高风险组预后较差(p<0.01)在Testing组和全体患者组中进行验证发现高风险组预后较差,与Tesing组一致(图1.2)。图1.2基于9-lncRNAsignature的总生存预后分析(A)Training组(B)Testing组(C)全体患者组Figure1.2Theoverallsurvivalanalysisof9-lncRNAbasedsignaturetheTrainingset(A),Testingset(B)andentireset(C)进一步通过ROC曲线(图1.3)分析,结果显示,9个lncRNA组成的Signature(AUC=0.8488)在预测总生存率上要比肿瘤分级(AUC=0.7014)、肿瘤分期(AUC=0.5031)、患者年龄(AUC=0.702)及BMI(AUC=0.4758)的AUC(曲
上海交通大学博士学位论文7线下面积)更大,提示此lncRNASignature敏感性和特异性均高于其他临床参数特征,为临床上个体化治疗内膜样癌提供了思路。图1.39-lncRNAsignature与其他临床参数预测总生存率的敏感性比较Figure1.3Comparisonofsensitivityandspecificityforoverallsurvivalpredictionby9lncRNAsignatureandotherclinicalfactors.3.2ARKs在内膜癌中的表达分析通过主成分分析发现ARKs在内膜癌组织中表达与正常及癌旁组织存在差异(图1.4)。通过采用GEPIA网站[21],对于12种ARKs在TCGA中各肿瘤中及正常组织的表达进行分析,内膜癌组织中的ARKs表达如图1.4B。12种ARKs的预后总生存曲线如图1.5所示。结合其在EC中的表达,NUAK2,MELK,SIK2是潜在的预后相关标记物,在子宫内膜癌的进展中发挥巨大作用。
【参考文献】:
期刊论文
[1]E2F transcription factors and digestive system malignancies: How much do we know?[J]. Athanasios Xanthoulis,Dina G Tiniakos. World Journal of Gastroenterology. 2013(21)
本文编号:3627267
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