基于454高通量测序技术对内蒙古贺兰山青海云杉外生菌根真菌的研究

发布时间：2018-01-07 07:10

  本文关键词：基于454高通量测序技术对内蒙古贺兰山青海云杉外生菌根真菌的研究　出处：《内蒙古农业大学》2017年硕士论文　论文类型：学位论文

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【摘要】：本文在内蒙古阿拉善贺兰山国家自然保护区所采集的青海云杉21个土壤样品中所有类型外生菌根在显微镜下挑出,提取总DNA。并用特定引物扩增对外生菌根真菌rDNA的ITS1和ITS4区段进行PCR扩增并对扩增产物进行纯化及割胶回收。经纯化后的DNA样品采用新一代高通量454测序平台进行上机测序。然后,通过一系列包括序列质量控制、序列比对、操作分类单元划分、多样性分析、分类地位鉴定和系统进化分析等步骤的分析流程对所获得的实验数据进行处理,基于此对青海云杉外生菌根真菌进行研究分析。结果表明:贺兰山地区青海云杉外生菌根真菌非常丰富,隶属于3个门6个纲10个目19个科24个属,外生菌根OTU序列数量达到了 255条,其序列长度平均为241bp。87.1%的OTU可以鉴定到科属水平,其中鉴定到科水平的OTU共96条,火丝菌科、革菌科、蜡壳耳科绝对丰度排序中,位于前三;鉴定到属水平的OTU共127条,丰度排在前三的优势菌属依次为蜡壳耳属、棉革菌属和偶线菌属。从Venn图看,所采集的贺兰山哈拉乌和乱柴沟两地有70.1%的OTU重合,说明两地的外生菌根真菌群落结构相似。和外生菌根的传统研究方式对比来看,454高通量测序法可以更为全面且准确地反映出外生菌根真菌群落结构。
[Abstract]:The total DNA was extracted from 21 soil samples collected from 21 soil samples collected from the National Nature Reserve of Alashan Helan Mountain in Inner Mongolia . The total DNA was extracted by PCR .

【学位授予单位】：内蒙古农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2017
【分类号】：S791.18;S714.3

【参考文献】

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本文编号：1391496