小麦F-box基因TaPP2-A13和TaSKIP27的胁迫应答模式及互作蛋白鉴定
发布时间：2020-12-18 23:59
F-box是真核生物中普遍存在的最大的蛋白质家族之一,主要在SCF复合体中负责待降解底物的特异性识别。在拟南芥中已揭示该家族部分成员的功能,但其在小麦中的功能研究报道较少。本研究在筛选小麦逆境相关转录组数据库的基础上,利用生物信息学、qRT-PCR、酵母双杂交、BiFC和Co-IP等技术,借助于荧光显微观察、超表达分析和亚细胞定位等手段,对F-box基因TaPP2-A13和TaSKIP27参与小麦TcLr15的逆境响应过程及与其互作的蛋白进行了分析和鉴定。取得的主要研究结果如下:1.获得了小麦F-box基因TaPP2-A13和TaSKIP27的全长编码区,预测其编码蛋白分别为 298 aa 和 164 aa。其中TaPP2-A13属于 F-box/PP2 亚家族（FBP）,TaSKIP27属于未知功能结构域亚家族（FBU）。两个基因所编码的蛋白在小麦近缘种属中进化比较保守。2.在小麦TcLr15中,经MeJA、SA和ABA三种激素处理后,TaPP2-A13基因均明显地上调,其中ABA诱发表达最早,而SA诱导表达最强;TaSKIP27基因在MeJA处理后变化不明显,而在ABA和SA处理后...
【文章来源】：河北农业大学河北省
【文章页数】：79 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
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【参考文献】：
期刊论文
[1]小麦F-box/Kelch类基因TaFKOR23的抗逆相关表达模式及分子互作蛋白鉴定[J]. 魏春茹,孟钰玉,范润侨,赵梦伊,于秀梅,赵伟全,康振生,刘大群. 植物遗传资源学报. 2020(03)
[2]PP2C相关基因在砂梨休眠进程中的表达分析[J]. 王会全,李亮,余志雄,袁亚芳,吴少华. 亚热带植物科学. 2018(04)
[3]小麦F-box基因TaFBL14的克隆及表达分析[J]. 李铃仙,魏春茹,李虎滢,魏新燕,于秀梅. 西北植物学报. 2017(02)
[4]小麦叶锈病成株抗性研究进展与展望[J]. 张小辉,畅志坚,乔麟轶,郭慧娟,詹海仙,李欣,任永康,张晓军. 山西农业科学. 2016(04)
[5]谷子F-box家族基因的鉴定、分类及干旱响应[J]. 霍冬英,郑炜君,李盼松,徐兆师,周永斌,陈明,马有志,闵东红,张小红. 作物学报. 2014(09)
[6]CRL E3泛素连接酶复合体研究进展[J]. 刘相元,胡弘历,欧阳华芳,高大明. 中国细胞生物学学报. 2014(02)
[7]论小麦叶锈病的防治方法[J]. 常红. 农民致富之友. 2013(07)
[8]植物泛素结合酶E2功能研究进展[J]. 王金利,史胜青,贾利强,江泽平. 生物技术通报. 2010(04)
[9]查尔酮合酶超家族(chalcone synthase superfamily)基因重复和分化的式样[J]. 杨继,顾红雅. 科学通报. 2006(07)
[10]植物中几丁质酶的作用[J]. 欧阳石文,赵开军,冯兰香. 生物学通报. 2002(06)
博士论文
[1]拟南芥F-box基因AtPP2-B11调节盐胁迫抗性的分子机理[D]. 贾凤娟.山东农业大学 2015
硕士论文
[1]小麦抗叶锈防卫反应相关基因TaNRH的克隆与功能分析[D]. 李楠楠.河北农业大学 2019
[2]小麦F-box家族的全基因组鉴定及TaFBL14和TaSKP2A的抗逆相关表达分析[D]. 李虎滢.河北农业大学 2019
[3]棉花赤霉素信号途径重要组分GhFB1，GhFB2和GhGID1基因的克隆和表达分析[D]. 于海川.海南大学 2008
[4]精氨酸脱亚氨基酶基因克隆及在大肠杆菌中表达[D]. 茅立华.南京理工大学 2005
本文编号：2924847
【文章来源】：河北农业大学河北省
【文章页数】：79 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２?和７Ｖ／ＳＡ：／Ｐ２７ｃ：ＤＮＡ全长序列扩增结果??：ａｒｅｒ：７？（１：
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应答模式及互作蛋白鉴定???３．２．２?ＴａＳＫＩＰ２７?为?ＦＢＵ?类?Ｆ－ｂｏｘ?蛋白??由ＷｈｅａｔＥｘｐ中的编号ＴｒａｅｓＣＳ２Ｄ０２Ｇ２１１０００．１可知，基因位于小麦２Ｄ染色体上。??使用ＤＮＡｓｔａｒ等软件对ｒａＳＡ７Ｐ２７基因编码的蛋白序列进行分析，发现７ｂＳＡ７尸２７基因ＯＲＦ大小??为４９５?ｂｐ，编码蛋白大小为１６４个氨基酸，其预测分子量大小为１７．６０?ｋＤ，理论等电点是９．６０。??结构域分析表明，ＴａＳＫＩＰ２７蛋白第６６？１００位是Ｆ－ｂｏｘ结构域（图６Ａ），除了?Ｆ－ｂｏｘ结构域外，??该蛋白序列中再无其他结构域，因此７ｂ从７Ｐ２７属于Ｆ－ｂｏｘ蛋白家族ＦＢＵ亚家族。经预测，??ＴａＳＫｌＰ２７蛋白不含信号肽序列和跨膜结构域。该蛋白二级结构中ａ－螺旋占４３．２９％，?ｐ－转角占??１．８３％，无规则卷曲和延伸链分别为４２．６８％和１２．２％?（图６Ｂ），蛋白亲疏水性预测显示ＴａＳＫＩＰ２７??为亲水性蛋白。由－：维结构预测可见，该蛋白主要由ａ－螺旋、无规则卷曲和延伸链构成（图６Ｃ），??４?级预测结果基本一致，且三维结构趋近于圆球形，符合其蛋白的亲水性特征。??Ａ?Ｃ??１６４??Ｉ?????＂＂＇＂－？＂ｉ?Ｆ－ｂｏｘ?ｒ…ｖ＇？．．．＇一巧＇ｒ?????Ｉ?！?：?ｉ?；?Ｉ?）：！ｌｉ！ｉｒｉ！＇?ｉ?！；：?■?｜｜！?Ｕ?Ｍ?Ｍｌｉ：丨，ｌｌ“：??２８?４６?６ｆｌ?０８?１０８?１２８??图６小麦ＴａＳＫｌＰ２７序列特征分析??Ａ：?ＴａＳＫＩＰ２７结构域Ｍ测；Ｂ：?ＴａＳＭＰ２７?：级结构预测；Ｃ：?ＴａＳＫＩＰ２７?维校吧Ｍ测??Ｆｉｇｕｒｅ
【参考文献】：
期刊论文
[1]小麦F-box/Kelch类基因TaFKOR23的抗逆相关表达模式及分子互作蛋白鉴定[J]. 魏春茹,孟钰玉,范润侨,赵梦伊,于秀梅,赵伟全,康振生,刘大群. 植物遗传资源学报. 2020(03)
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[4]小麦叶锈病成株抗性研究进展与展望[J]. 张小辉,畅志坚,乔麟轶,郭慧娟,詹海仙,李欣,任永康,张晓军. 山西农业科学. 2016(04)
[5]谷子F-box家族基因的鉴定、分类及干旱响应[J]. 霍冬英,郑炜君,李盼松,徐兆师,周永斌,陈明,马有志,闵东红,张小红. 作物学报. 2014(09)
[6]CRL E3泛素连接酶复合体研究进展[J]. 刘相元,胡弘历,欧阳华芳,高大明. 中国细胞生物学学报. 2014(02)
[7]论小麦叶锈病的防治方法[J]. 常红. 农民致富之友. 2013(07)
[8]植物泛素结合酶E2功能研究进展[J]. 王金利,史胜青,贾利强,江泽平. 生物技术通报. 2010(04)
[9]查尔酮合酶超家族(chalcone synthase superfamily)基因重复和分化的式样[J]. 杨继,顾红雅. 科学通报. 2006(07)
[10]植物中几丁质酶的作用[J]. 欧阳石文,赵开军,冯兰香. 生物学通报. 2002(06)
博士论文
[1]拟南芥F-box基因AtPP2-B11调节盐胁迫抗性的分子机理[D]. 贾凤娟.山东农业大学 2015
硕士论文
[1]小麦抗叶锈防卫反应相关基因TaNRH的克隆与功能分析[D]. 李楠楠.河北农业大学 2019
[2]小麦F-box家族的全基因组鉴定及TaFBL14和TaSKP2A的抗逆相关表达分析[D]. 李虎滢.河北农业大学 2019
[3]棉花赤霉素信号途径重要组分GhFB1，GhFB2和GhGID1基因的克隆和表达分析[D]. 于海川.海南大学 2008
[4]精氨酸脱亚氨基酶基因克隆及在大肠杆菌中表达[D]. 茅立华.南京理工大学 2005
本文编号：2924847
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