刺参生殖相关神经肽挖掘及特征研究

发布时间：2020-12-19 19:19

　　本论文以刺参生殖发育相关神经肽的功能基因筛选及活性研究为核心,通过生物信息学分析、分子克隆、细胞水平的活性验证及生理功能评价,开展较为系统的研究探索,以期为刺参生殖发育的神经内分泌调控研究奠定基础。具体基于刺参基因组、转录组数据筛选到4条刺参生殖发育相关神经肽编码基因,并重点围绕刺参Kisspeptin神经肽,初步阐明了分子结构、活性特征及生理功能。主要研究成果如下:1、筛选获得4条刺参生殖调控相关的神经肽样蛋白编码基因序列（AjKisspeptin、NPS/CCAP型肽（NG）、F-likeSALMF（FS）、L-likeSALMF（LS））。其中刺参kisspepetin前体肽ORF区长543bp,预测编码180个氨基酸长度的前体肽,包含长23aa信号肽、两段长度分别为32aa（AjKiss1a（AGSLDcEDVERRGRQPNRNAHYRTLPF-NH₂））和18aa（AjKiss1b（SAVKNKNKSRARPPLLPF-NH₂））的成熟肽。预测其前体肽的等电点（pI）为4.90,分子量（Mw）为20.283 kD。通过荧光定量基因... 

【文章来源】：浙江海洋大学浙江省

【文章页数】：66 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

以HPG轴为核心的生殖调控网络模型

技术路线

刺参生殖相关神经肽发掘及功能研究16图2.1AjKisspeptin前体肽编码基因的编码区及预测的氨基酸序列。蓝色表示信号肽，方框表示起始密码子，星号表示终止密码子，绿色方框表示预测到的切割位点，红色方框表示成熟肽，黄色方框表示切割后残留的C端甘氨酸残基Fig2.1TheCDSandpredictedaminoacidsequenceoftheAjKisspeptinprecursorgene.Blueindicatessignalpeptide,boxindicatesstartcodon,asteriskindicatesstopcodon,greenboxindicatespredictedcleavagesite,redboxindicatesmaturepeptide,yellowboxindicatesC-terminalglycineremainingaftercleavageResidues2.3.1.2氨基酸同源性和系统发育分析为了探究新发的AjKisspeptin与其它物种Kisspeptin的近缘关系，从NCBI数据库中筛选到8条不同物种的Kisspeptin氨基酸序列（负鼠（Monodelphisdomestic）、智人（Homosapines）、非洲爪蟾（Xenopuslaevis）、石斑鱼（Epinehelusbruneus）、金鱼（Carassiusauratus）、斑马鱼（Daniorerio）、海星（Ophionotunvictorae））用MEGA5.0软件，以最大似然法（ML），重复1000次，构建系统进化树（图2.2）。结果发现，Kisspeptin在进化中明显的分为两支，一支是脊椎动物分支，另一支为无脊椎动物分支，恰好与这些动物类群的分类阶元和进化地位相一致。

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：2926435