生物品系特异性遗传标记的可视化及应用
发布时间：2020-12-28 12:10
当今,农作物本身的遗传信息,结合栽培环境,决定了其品质特征和营养价值,农作物品系遗传物质的一致性、稳定性,也关系到重大的食品安全问题。生物学发展越来越迅速,遗传标记在现代生物研究方面具有重要的研究价值,在农作物育种、品种改良的鉴定中,也具有重要价值。遗传标记比较容易测定,而研究生物特异性遗传标记最关键的是将其进行可视化研究,结合当今互联网的发展,将生物学与计算机科学的知识进行结合,能让更多的人对生物从分子层次有一个更好的认识。如何能让人们对优良品种进行识别与选择,是一个具有挑战的事情。目前,人们对生物品种从分子层次认识比较欠缺,对优良品质的认识更是停留在形态上。因此,需要将计算机与生物信息知识结合,提供一个优良品系鉴别的方法与平台。本文主要从农作物产品小麦品系实例进行研究,选择它的遗传标记SNP分子标记,将下载的数据运用Python技术进行过滤和筛选,获得具有品系代表性的分子标记。构建映射关系f,将分子标记数据映射成flame函数的参数序列,并结合当下流行的分形软件Apophysis对小麦优良品种的特异性遗传标记进行可视化,最终生成可视化的分形图案,体现品系的特异性特征。最后,将生物品...
【文章来源】：青海师范大学青海省
【文章页数】：57 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
曼德博集合（2）迭代函数系统（IFS）
生物品系特异性遗传标记的可视化及应用11图2-2随机分形图案2.5分形图形可视化应用平台遗传标记分形图形应用平台为微信小程序。信息化时代，许多诸如社交和手机应用等平台相继出现，微信小程序是当前比较火热的一款手机应用，很多小程序通过二维码扫一扫或者直接搜索小程序名称就可以打开应用[40]，之后只要将手机主页面往下拖动便可以再一次看到需要的小程序，如果不想要，直接拖动删除即可。微信小程序是微信公众平台的小程序，它占用手机内存很小[41]，不需要安装。微信小程序的优势：（1）开发门槛成本低，微信小程序适用于不同类型的手机，兼容性比较好，相比于传统的APP，系统的维护成本更低；（2）用户体验较好，小程序可以随用随时打开，用完可以直接删除的应用，不需要用户再去一步一步的实现安装，节省了手机的内存空间。微信小程序现在用的领域比较广阔，包含了售卖产品的商城，许多城市还应用在了地铁、公交等服务，给日常生活带来了许多方便[42]。微信小程序架构图如图2-3所示。
青海师范大学硕士学位论文12图2-3微信小程序架构图2.6本章小结本章主要介绍了本文研究的相关基本知识。第一节主要介绍了遗传标记的概念以及分类，第二节介绍了遗传标记分子的种类以及本文选择SNP分子标记的优势，第三节介绍了常用的生物数据可视化工具，第四节介绍了几种基于迭代函数的分形软件以及遗传标记分形可视化的软件Apophysis，最后介绍了品系遗传信息交易的平台。基础知识的介绍为后面工作的开展作了铺垫。
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于python语言的图像分割方法研究[J]. 李家乐,谢凯,姜宏屏. 电子世界. 2019(24)
[2]Python语言特点及其在机器学习中的应用[J]. 徐玉芳,苏斌. 计算机产品与流通. 2019(12)
[3]利用重测序技术开发高粱多态性SSR分子标记[J]. 王平,王春语,张丽霞,丛玲,朱振兴,陆晓春. 生物技术通报. 2019(11)
[4]DNA分子标记技术在甘草属植物鉴定中的应用研究进展[J]. 郝杰,刘刚,刘育辰,安兰兰,金文渊,袁思文. 中国现代应用药学. 2019(19)
[5]基于微信小程序与云开发的成绩查询系统实现[J]. 张利香,甘发旺,薄建国. 内蒙古科技与经济. 2019(13)
[6]浅谈R语言在大数据处理中的运用[J]. 周红林. 计算机产品与流通. 2019(07)
[7]微信小程序“轻应用”平台满意度研究[J]. 刘卓,罗志. 合作经济与科技. 2019(10)
[8]R语言在生物科学研究绘图中的应用[J]. 蓝洋,何秀,朱诚勖,张玉娟. 华东师范大学学报(自然科学版). 2019(01)
[9]单核苷酸多态性(SNP)分子标记在小麦遗传育种中的研究进展[J]. 吴澎,刘娟,田纪春. 农学学报. 2019(01)
[10]智慧校园微信小程序云服务开发与构建[J]. 柏超宇,顾怡,杨丽雯,张建波. 电子技术与软件工程. 2018(19)
博士论文
[1]大麦成株叶锈病抗性基因的发掘、分子标记及遗传研究[D]. 刘凤楼.西北农林科技大学 2010
[2]我国小麦生产发展及其科技支撑研究[D]. 杨建仓.中国农业科学院 2008
硕士论文
[1]大数据环境下相似重复记录数据清洗关键技术研究[D]. 李蕾.南京邮电大学 2019
[2]基于Java的双学位招生管理系统的设计[D]. 闫雄.内蒙古科技大学 2019
[3]面向中职信息技术师资培训的微信小程序课程开发与研究[D]. 许智超.广东技术师范大学 2019
[4]小麦育种亲本材料抗条锈病基因的分子检测[D]. 杨媛.西北农林科技大学 2019
[5]常用品系大鼠的基因组及SNP遗传标记分析[D]. 曾玉琳.华南理工大学 2018
[6]基于微信小程序的个人电台系统的设计与实现[D]. 金莹.吉林大学 2017
[7]基于高原高血压下的生物大数据可视化研究[D]. 卢沛良.青海师范大学 2017
[8]基于SNP标记的小麦钾效率性状的关联分析[D]. 赵艳艳.山东农业大学 2016
[9]基于D3.js的数据可视化系统框架设计与实现[D]. 权鑫.北京交通大学 2016
[10]基于D3的可视化组件开发及其在研讨系统中的应用[D]. 朱建军.湖北工业大学 2015
本文编号：2943729
【文章来源】：青海师范大学青海省
【文章页数】：57 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
曼德博集合（2）迭代函数系统（IFS）
生物品系特异性遗传标记的可视化及应用11图2-2随机分形图案2.5分形图形可视化应用平台遗传标记分形图形应用平台为微信小程序。信息化时代，许多诸如社交和手机应用等平台相继出现，微信小程序是当前比较火热的一款手机应用，很多小程序通过二维码扫一扫或者直接搜索小程序名称就可以打开应用[40]，之后只要将手机主页面往下拖动便可以再一次看到需要的小程序，如果不想要，直接拖动删除即可。微信小程序是微信公众平台的小程序，它占用手机内存很小[41]，不需要安装。微信小程序的优势：（1）开发门槛成本低，微信小程序适用于不同类型的手机，兼容性比较好，相比于传统的APP，系统的维护成本更低；（2）用户体验较好，小程序可以随用随时打开，用完可以直接删除的应用，不需要用户再去一步一步的实现安装，节省了手机的内存空间。微信小程序现在用的领域比较广阔，包含了售卖产品的商城，许多城市还应用在了地铁、公交等服务，给日常生活带来了许多方便[42]。微信小程序架构图如图2-3所示。
青海师范大学硕士学位论文12图2-3微信小程序架构图2.6本章小结本章主要介绍了本文研究的相关基本知识。第一节主要介绍了遗传标记的概念以及分类，第二节介绍了遗传标记分子的种类以及本文选择SNP分子标记的优势，第三节介绍了常用的生物数据可视化工具，第四节介绍了几种基于迭代函数的分形软件以及遗传标记分形可视化的软件Apophysis，最后介绍了品系遗传信息交易的平台。基础知识的介绍为后面工作的开展作了铺垫。
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于python语言的图像分割方法研究[J]. 李家乐,谢凯,姜宏屏. 电子世界. 2019(24)
[2]Python语言特点及其在机器学习中的应用[J]. 徐玉芳,苏斌. 计算机产品与流通. 2019(12)
[3]利用重测序技术开发高粱多态性SSR分子标记[J]. 王平,王春语,张丽霞,丛玲,朱振兴,陆晓春. 生物技术通报. 2019(11)
[4]DNA分子标记技术在甘草属植物鉴定中的应用研究进展[J]. 郝杰,刘刚,刘育辰,安兰兰,金文渊,袁思文. 中国现代应用药学. 2019(19)
[5]基于微信小程序与云开发的成绩查询系统实现[J]. 张利香,甘发旺,薄建国. 内蒙古科技与经济. 2019(13)
[6]浅谈R语言在大数据处理中的运用[J]. 周红林. 计算机产品与流通. 2019(07)
[7]微信小程序“轻应用”平台满意度研究[J]. 刘卓,罗志. 合作经济与科技. 2019(10)
[8]R语言在生物科学研究绘图中的应用[J]. 蓝洋,何秀,朱诚勖,张玉娟. 华东师范大学学报(自然科学版). 2019(01)
[9]单核苷酸多态性(SNP)分子标记在小麦遗传育种中的研究进展[J]. 吴澎,刘娟,田纪春. 农学学报. 2019(01)
[10]智慧校园微信小程序云服务开发与构建[J]. 柏超宇,顾怡,杨丽雯,张建波. 电子技术与软件工程. 2018(19)
博士论文
[1]大麦成株叶锈病抗性基因的发掘、分子标记及遗传研究[D]. 刘凤楼.西北农林科技大学 2010
[2]我国小麦生产发展及其科技支撑研究[D]. 杨建仓.中国农业科学院 2008
硕士论文
[1]大数据环境下相似重复记录数据清洗关键技术研究[D]. 李蕾.南京邮电大学 2019
[2]基于Java的双学位招生管理系统的设计[D]. 闫雄.内蒙古科技大学 2019
[3]面向中职信息技术师资培训的微信小程序课程开发与研究[D]. 许智超.广东技术师范大学 2019
[4]小麦育种亲本材料抗条锈病基因的分子检测[D]. 杨媛.西北农林科技大学 2019
[5]常用品系大鼠的基因组及SNP遗传标记分析[D]. 曾玉琳.华南理工大学 2018
[6]基于微信小程序的个人电台系统的设计与实现[D]. 金莹.吉林大学 2017
[7]基于高原高血压下的生物大数据可视化研究[D]. 卢沛良.青海师范大学 2017
[8]基于SNP标记的小麦钾效率性状的关联分析[D]. 赵艳艳.山东农业大学 2016
[9]基于D3.js的数据可视化系统框架设计与实现[D]. 权鑫.北京交通大学 2016
[10]基于D3的可视化组件开发及其在研讨系统中的应用[D]. 朱建军.湖北工业大学 2015
本文编号：2943729
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