当前位置:主页 > 硕博论文 > 农业硕士论文 >

蒺藜苜蓿转录因子SSR分子标记的开发与应用及LEA基因家族功能分析

发布时间:2021-03-13 16:30
  作为重要的豆科模式植物,蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)能够为其它豆科作物和牧草提供重要的遗传信息。微卫星分子标记技术是目前最先进的分子标记之一,转录因子在调节动植物生长发育以及响应外界环境胁迫等方面发挥重要作用。截至目前,已对蒺藜苜蓿EST-SSR进行了大量研究,但基于转录因子开发的SSR分子标记尚未见报道。本研究利用在线工具开发蒺藜苜蓿转录因子SSR引物共142对,选取70对引物对蒺藜苜蓿,紫花苜蓿(Medicago sativa),烟草(Nicotiana tabacum),水稻(Oryza sativa),箭(?)豌豆(Vicia sativa)和拟南芥(Arabidopsis thaliana)种内和种间通用性进行了研究。研究结果显示,187条蒺藜苜蓿转录因子家族的编码序列中搜索得到213个SSRs位点,SSR出现频率为14.52%。通用性检测发现,转录因子引物在紫花苜蓿,烟草,水稻,箭(?)豌豆和拟南芥中的通用率分别为77.14%,25.71%,27.14%,38.57%和47.14%。由此可见,新开发的分子标记在不同物种间遗传连锁图谱构建、基因组比较及Q... 

【文章来源】:兰州大学甘肃省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】:60 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

蒺藜苜蓿转录因子SSR分子标记的开发与应用及LEA基因家族功能分析


图1蔡黎首猜转录因子家族??Fig.l?The?transcription?factor?fairdly?in?Me流:口各0?护W7C幻化/幻??

基因,紫花,实验要求,拟南芥


3.3?DNA提取??基因组DNA电泳结果可W反应所提取DNA的质量。如图,是一条集中的??窄带,无弥散和拖带,表明DNA较为完整,符合实验要求(图2);???1?2?3?4?5?6??■H??图2基因組DNA提取??Fig.2?Genomic?DNA?extraction??注:1为蔡藝首猜;2为紫花首蒂;3为烟草;4为水稻;5为箭當就豆;6为拟南芥。??Note:?1?is?i"epresented?fbr?Me成C幻go?/rw灼C幻成/幻,2?is?represented?for?M化//c口go?化说Va,3?is??represented?for?.Vico/i!?幻巧口於A幻cww,?4?is?represented?fbr?Ojz口?s如zV幻,5?is?represented?for??口??sativa,?6?is?represented?for?Arabidopsis?thaliana.??21??

条染,基因,染色体定位,染色体


植物全基因组数据库获得较为准确的i:丘4基因起始位点信息。利用染色体定位??绘图软件Mapdiaxt,得到蔡黎首猜I么4基因家族染色体定位图。??图5中展示了王基因在蔡黎首稻8条染色体上的分布,定位结果可W明??显地看出该类型基因在染色体上的分布极不均匀。23个王丘4基因广泛分布于除??第6条染色体W外的其他7条染色体上。王基因在染色体上的具体分布如下:??第2、4和7条染色体上含有最多的Z色4基因,各有5个LEA成员定位在上面;??其次为第1和第3条染色体上各有3个基因分布;而第5和第8条染色体上分布??最少,仅有一个LEL4基因。??29??

【参考文献】:
期刊论文
[1]番茄LBD基因家族的全基因组序列鉴定及其进化和表达分析[J]. 王小非,刘鑫,苏玲,孙永江,张世忠,郝玉金,由春香.  中国农业科学. 2013(12)
[2]植物胚胎发育晚期丰富蛋白的结构与功能[J]. 周丽,姬向楠,何非,潘秋红,段长青.  热带生物学报. 2012(02)
[3]水稻OsLEA19a基因的克隆、表达及生物信息学分析[J]. 胡廷章,吴应梅,陈再刚,黄小云.  华北农学报. 2011(06)
[4]大豆LEA基因家族全基因组鉴定、分类和表达[J]. 李乐,许红亮,杨兴露,李雅轩,胡英考.  中国农业科学. 2011(19)
[5]苜蓿全基因组WRKY转录因子基因的分析[J]. 江腾,林勇祥,刘雪,江海洋,朱苏文.  草业学报. 2011(03)
[6]蒺藜苜蓿EST-SSRs分布特征及标记的开发[J]. 屠德鹏,魏臻武,武自念,雷艳芳,张栋,邱伟伟.  草业科学. 2011(05)
[7]杨树Genomic-SSR与EST-SSR分子标记遗传差异性分析[J]. 宋跃朋,江锡兵,张曼,王泽亮,薄文浩,安新民,张志毅.  北京林业大学学报. 2010(05)
[8]植物EST-SSR标记开发及其应用[J]. 张利达,唐克轩.  基因组学与应用生物学. 2010(03)
[9]Mining,characterization,and exploitation of EST-derived microsatellites in Gossypium barbadense[J]. Lü YuanDa,CAI CaiPing,WANG Lei,LIN ShaoYan,ZHAO Liang,TIAN LiangLiang,Lü JunHong,ZHANG TianZhen & GUO WangZhen National Key Laboratory of Crop Genetics & Germplasm Enhancement,Cotton Research Institute,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China.  Chinese Science Bulletin. 2010(18)
[10]植物LEA蛋白及其功能[J]. 陈雷,李磊,李金花,李永春.  中国农学通报. 2009(24)



本文编号:3080553

资料下载
论文发表

本文链接:https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/zaizhiyanjiusheng/3080553.html


Copyright(c)文论论文网All Rights Reserved | 网站地图 |

版权申明:资料由用户2a4fb***提供,本站仅收录摘要或目录,作者需要删除请E-mail邮箱bigeng88@qq.com