玉米大斑病菌交配型分离频率和突变体转录组分析
发布时间:2021-04-09 08:33
玉米大斑病是玉米上的重要叶部病害,其病原菌为大斑刚毛座腔菌(Setosphaeria turcica),病菌为异宗配合真菌,其具有StMAT1-1和StMAT1-2交配型基因。玉米大斑病菌基因组中仅带有StMAT1-1基因的菌株被定名为A交配型菌株,仅含有StMAT1-2基因的菌株被定名为a交配型菌株,两个交配型基因都有的菌株被定名为Aa菌株。前期研究发现,不同年份中我国不同省份的玉米大斑病菌交配型组成规律难以掌握,并且缺失了交配型基因的玉米大斑病菌失去了有性生殖的能力,同时无性繁殖能力下降,表明交配型基因对玉米大斑病菌的有性和无性生殖具有重要意义。本文在前期研究基础上,首先系统分析了 2016-2018年我国不同玉米产区玉米大斑病菌交配型的组成情况,对不同年份各省份的交配型组成有一个初步的认识,对野生型菌株、StMAT1-1基因缺失突变体ΔStmat1-1和StMA T1-2基因缺失突变体ΔStmat1-2进行转录组分析,通过生物信息学分析方法进行GO和KEGG富集分析,并筛选出与有性生殖相关的差异表达基因,为玉米大斑病菌有性生殖过程中交配型基因调控机制研究提供了前期基础。主要结果如...
【文章来源】:河北农业大学河北省
【文章页数】:44 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图3样本间表达基因Venn分析??16??
component?of?membrane)和膜的固有成分(intrinsic??component?of?membrane)与细胞膜成分相关的富集显著。在分子功能(Molecular??Function)分类中,跨膜转运蛋白活性(transmembrane?transporter?activity)、转运蛋??白活性(transporter?activity)、辅因子结合(cofactor?binding)、氧化还原酶活性??(oxidoreductase?activity)富集显著(图8)〇??(30?enrichment?ana}ysis(WT—\/s_StIV1AT1_G)??翻cc??m?ivjf??m?bp??alpha-amino?a-cKl?metaboHc?p-rocsss??-cciiular?amino?aci<3?meta&olic?process??organic?aciti?process?難靈警??lnt?Qral?component?of?membrane??intrinsic?compooent?of?membrane??part??trj>osm?mt>ranA?transporter?activity??tiansportai?activity??colactor?bindino??oxiUureductase?activity??tetrapyrrote?binding??rtttmfi?r>indinq??catalytic?activity??c?en^yt!>e?trinding??transition?metal?ion?transmem£>ran??
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【参考文献】:
期刊论文
[1]RNA-Seq在AM真菌研究中的应用[J]. 邓杰,李芳,张伟珍,段廷玉. 生态学杂志. 2019(11)
[2]玉米大斑病抗性育种研究进展与展望[J]. 郑飞,崔亚坤,王森,袁建华. 安徽农业科学. 2018(04)
[3]转录组分析揭示玉米大斑病菌对解淀粉芽孢杆菌胁迫响应机制[J]. 田雪亮,张恺,王国梁,刘文德. 中国科学:生命科学. 2016(05)
[4]玉米大斑病菌两性交配型菌株的出现频率及其育性分析[J]. 杨阳,马双新,贾慧,刘微微,曹志艳,董金皋. 植物保护学报. 2015(06)
[5]真菌有性生殖调控与进化[J]. 郑鹏,王成树. 中国科学:生命科学. 2013(12)
[6]河北省玉米大斑病菌生理小种组成研究[J]. 纪莉景,栗秋生,王连生,李聪聪,孔令晓. 玉米科学. 2013(01)
[7]黑龙江省玉米大斑病菌小种生理分化的研究[J]. 石凤梅,马立功. 黑龙江农业科学. 2013(02)
[8]东北春玉米区玉米栽培品种对大斑病抗性水平研究[J]. 苏前富,闫守荣,王巍巍,李红,孟玲敏,张伟,刘影,晋齐鸣. 玉米科学. 2012(05)
[9]西南地区玉米大斑病菌生理小种鉴定[J]. 张小飞,李晓,崔丽娜,邹成佳,杨晓蓉,钟尧,黄芸. 玉米科学. 2012(04)
[10]东北地区玉米大斑病菌生理分化研究[J]. 张秀霞,高增贵,周晓锟,张硕,周艳波. 华北农学报. 2012(03)
硕士论文
[1]铁离子对新月弯孢菌(Curvularia lunata)有性世代发育的影响[D]. 刘克心.沈阳农业大学 2018
[2]玉米大斑病菌有性生殖的影响因素及StMAT1-1基因功能分析[D]. 戴冬青.河北农业大学 2018
[3]基于RNA-Seq技术的Undifilum oxytropis中苦马豆素含量相关基因的分析[D]. 张峰华.西北农林科技大学 2017
[4]中国玉米大斑病菌的遗传多样性及交配型组成分析[D]. 郭丽婕.河北农业大学 2015
[5]雅安地区玉米大斑病菌生物学特性和时空流行动态的研究[D]. 陈雪飞.四川农业大学 2013
[6]核盘菌交配型相关基因mat1-1的功能验证[D]. 安乐.吉林大学 2007
本文编号:3127294
【文章来源】:河北农业大学河北省
【文章页数】:44 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图3样本间表达基因Venn分析??16??
component?of?membrane)和膜的固有成分(intrinsic??component?of?membrane)与细胞膜成分相关的富集显著。在分子功能(Molecular??Function)分类中,跨膜转运蛋白活性(transmembrane?transporter?activity)、转运蛋??白活性(transporter?activity)、辅因子结合(cofactor?binding)、氧化还原酶活性??(oxidoreductase?activity)富集显著(图8)〇??(30?enrichment?ana}ysis(WT—\/s_StIV1AT1_G)??翻cc??m?ivjf??m?bp??alpha-amino?a-cKl?metaboHc?p-rocsss??-cciiular?amino?aci<3?meta&olic?process??organic?aciti?process?難靈警??lnt?Qral?component?of?membrane??intrinsic?compooent?of?membrane??part??trj>osm?mt>ranA?transporter?activity??tiansportai?activity??colactor?bindino??oxiUureductase?activity??tetrapyrrote?binding??rtttmfi?r>indinq??catalytic?activity??c?en^yt!>e?trinding??transition?metal?ion?transmem£>ran??
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【参考文献】:
期刊论文
[1]RNA-Seq在AM真菌研究中的应用[J]. 邓杰,李芳,张伟珍,段廷玉. 生态学杂志. 2019(11)
[2]玉米大斑病抗性育种研究进展与展望[J]. 郑飞,崔亚坤,王森,袁建华. 安徽农业科学. 2018(04)
[3]转录组分析揭示玉米大斑病菌对解淀粉芽孢杆菌胁迫响应机制[J]. 田雪亮,张恺,王国梁,刘文德. 中国科学:生命科学. 2016(05)
[4]玉米大斑病菌两性交配型菌株的出现频率及其育性分析[J]. 杨阳,马双新,贾慧,刘微微,曹志艳,董金皋. 植物保护学报. 2015(06)
[5]真菌有性生殖调控与进化[J]. 郑鹏,王成树. 中国科学:生命科学. 2013(12)
[6]河北省玉米大斑病菌生理小种组成研究[J]. 纪莉景,栗秋生,王连生,李聪聪,孔令晓. 玉米科学. 2013(01)
[7]黑龙江省玉米大斑病菌小种生理分化的研究[J]. 石凤梅,马立功. 黑龙江农业科学. 2013(02)
[8]东北春玉米区玉米栽培品种对大斑病抗性水平研究[J]. 苏前富,闫守荣,王巍巍,李红,孟玲敏,张伟,刘影,晋齐鸣. 玉米科学. 2012(05)
[9]西南地区玉米大斑病菌生理小种鉴定[J]. 张小飞,李晓,崔丽娜,邹成佳,杨晓蓉,钟尧,黄芸. 玉米科学. 2012(04)
[10]东北地区玉米大斑病菌生理分化研究[J]. 张秀霞,高增贵,周晓锟,张硕,周艳波. 华北农学报. 2012(03)
硕士论文
[1]铁离子对新月弯孢菌(Curvularia lunata)有性世代发育的影响[D]. 刘克心.沈阳农业大学 2018
[2]玉米大斑病菌有性生殖的影响因素及StMAT1-1基因功能分析[D]. 戴冬青.河北农业大学 2018
[3]基于RNA-Seq技术的Undifilum oxytropis中苦马豆素含量相关基因的分析[D]. 张峰华.西北农林科技大学 2017
[4]中国玉米大斑病菌的遗传多样性及交配型组成分析[D]. 郭丽婕.河北农业大学 2015
[5]雅安地区玉米大斑病菌生物学特性和时空流行动态的研究[D]. 陈雪飞.四川农业大学 2013
[6]核盘菌交配型相关基因mat1-1的功能验证[D]. 安乐.吉林大学 2007
本文编号:3127294
本文链接:https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/zaizhiyanjiusheng/3127294.html
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