中华乌塘鳢四个Caspase家族基因及在副溶血弧菌和病毒拟似物Poly（I:C）胁迫下的表达分析

发布时间：2021-05-07 21:33

　　细胞凋亡（Apoptosis）是一个主动、高度有序且由基因决定的自动使细胞生命终止的过程,在保证多细胞生物健康发育的过程中扮演者重要的角色。它对生物体进化、维持细胞内环境稳定和维持组织中细胞数量起着关键性作用。在生物免疫学领域,细胞凋亡的过程有同一系列的蛋白家族的参与。其中,半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶家族（Cysteine aspartic acid specific protease,Caspases）是可以直接触发细胞凋亡被解体的蛋白酶体系,并在细胞凋亡的进程中发挥着重要的作用。本研究主要对中华乌塘鳢的Bscasp-1、Bscasp-7、Bscasp-8和Bscasp-9基因进行了序列鉴定、进化分析和表达分析。其中,Bscasp-1,Bscasp-7,Bscasp-8和Bscasp-9基因蛋白序列分别编码390bp,314bp,478bp和435bp个氨基酸。Bscasp-1和Bscasp-9基因包含三个结构域,一个caspase募集结构域（CARD）和CASc结构域,其中CASc结构域包含一个P20大亚基结构域和一个P10小亚基结构域。Bscasp-8基因具有两个死亡效应域（Deat... 

【文章来源】：浙江海洋大学浙江省

【文章页数】：92 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文献综述
    1.1 中华乌塘鳢简介
        1.1.1 生活习性
        1.1.2 养殖现状
    1.2 细胞凋亡概述
        1.2.1 细胞凋亡激活的方式
    1.3 Caspase家族基因研究概述
        1.3.1 Caspase家族结构特征
        1.3.2 Caspase家族分类
    1.4 Caspase家族在哺乳类的研究
    1.5 Caspase家族在鱼类的研究
    1.6 研究目的和意义
第二章 中华乌塘鳢Caspase家族细胞凋亡炎症组基因的克隆与表达分析
    2.1 实验材料
        2.1.1 实验动物
        2.1.2 菌种
        2.1.3 引物
        2.1.4 实验试剂与配制方法
    2.2 实验方法
        2.2.1 病原菌感染和病原刺激实验
        2.2.2 总RNA提取实验
        2.2.3 cDNA合成
        2.2.4 中华乌塘鳢Caspase-1 基因的CDS序列克隆
        2.2.5 中华乌塘鳢Caspase-1 基因的序列分析方法
        2.2.6 实时荧光定量PCR实验
    2.3 实验结果
        2.3.1 中华乌塘鳢caspase-1 基因的ORF序列及推导氨基酸序列的特征
        2.3.2 中华乌塘鳢与其他脊椎动物的caspase-1基因氨基酸序列同源性分析
        2.3.3 中华乌塘鳢caspase-1 基因系统进化关系分析
    2.4 中华乌塘鳢caspase-1 基因的组织表达分析
        2.4.1 中华乌塘鳢caspase-1 基因在不同组织中的表达结果
        2.4.2 感染副溶血弧菌后中华乌塘鳢caspase-1 基因的表达变化
        2.4.3 Poly(I:C)刺激后中华乌塘鳢caspase-1 基因的表达变化
    2.5 讨论
第三章 中华乌塘鳢Caspase家族细胞凋亡起始组基因的克隆与表达分析
    3.1 实验材料
        3.1.1 实验动物
        3.1.2 菌种
        3.1.3 引物
        3.1.4 实验试剂与配制方法
    3.2 实验方法
        3.2.1 病原菌感染和病原刺激实验
        3.2.2 总RNA提取实验
        3.2.3 cDNA合成
        3.2.4 中华乌塘鳢Caspase-8,-9 基因的CDS序列克隆
        3.2.5 中华乌塘鳢Caspase-8,-9 基因的序列分析方法
        3.2.6 实时荧光定量PCR实验
    3.3 实验结果
        3.3.1 中华乌塘鳢caspase-8 基因的ORF序列及推导氨基酸序列的特征
        3.3.2 中华乌塘鳢与其他脊椎动物的caspase-8 基因氨基酸序列同源性分析
        3.3.3 中华乌塘鳢caspase-8 基因系统进化关系分析
        3.3.4 中华乌塘鳢caspase-9 基因的ORF序列及推导氨基酸序列的特征
        3.3.5 中华乌塘鳢与其他脊椎动物的caspase-9 基因氨基酸序列同源性分析
        3.3.6 中华乌塘鳢caspase-9 基因系统进化关系分析
    3.4 中华乌塘鳢caspase-8,-9 基因的组织表达分析
        3.4.1 中华乌塘鳢caspase-8,-9 基因在不同组织中的表达结果
        3.4.2 感染副溶血弧菌后中华乌塘鳢caspase-8,-9 基因的表达变化
        3.4.3 Poly(I:C)刺激后中华乌塘鳢caspase-8,-9 基因的表达变化
    3.5 讨论
第四章 中华乌塘鳢Caspase家族细胞凋亡效应组基因的克隆与表达分析
    4.1 实验材料
        4.1.1 实验动物
        4.1.2 菌种
        4.1.3 引物
        4.1.4 实验试剂与配制方法
    4.2 实验方法
        4.2.1 病原菌感染和病原刺激实验
        4.2.2 总RNA提取实验
        4.2.3 cDNA合成
        4.2.4 中华乌塘鳢Caspase-7 基因的CDS序列克隆
        4.2.5 中华乌塘鳢Caspase-7 基因的序列分析方法
        4.2.6 实时荧光定量PCR实验
    4.3 实验结果
        4.3.1 中华乌塘鳢caspase-7 基因的ORF序列及推导氨基酸序列的特征
        4.3.2 中华乌塘鳢与其他脊椎动物的caspase-7 基因氨基酸序列同源性分析
        4.3.3 中华乌塘鳢caspase-7 基因系统进化关系分析
    4.4 中华乌塘鳢caspase-7 基因的组织表达分析
        4.4.1 中华乌塘鳢caspase-7 基因在不同组织中的表达结果
        4.4.2 感染副溶血弧菌后中华乌塘鳢caspase-7 基因的表达变化
        4.4.3 Poly(I:C)刺激后中华乌塘鳢caspase-7 基因的表达变化
    4.5 讨论
结论
参考文献
致谢
在读期间发表的学术论文及研究成果


【参考文献】：
期刊论文
[1]牙龈卟啉单胞菌感染通过激活NLRP3小体诱导牙周膜细胞炎症反应及凋亡效应[J]. 苏阳.  中国微生态学杂志. 2020(01)
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[8]中华乌塘鳢养殖方法[J]. 冼康强.  农家科技. 2012(03)
[9]东部沿海贝类中副溶血弧菌的分布及特征[J]. 赵峰,周德庆,于维森,王伟栋,李毅财,刘帅帅.  食品与生物技术学报. 2011(05)
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硕士论文
[1]大黄鱼HSP及caspase家族部分基因对温度胁迫的响应[D]. 杨启莲.集美大学 2011



本文编号：3174093