萧喙扁蝽Brachyrhynchus hsiaoi（Bl（?）te,1965）不同地理种群遗传多样性研究及分歧时间估算

发布时间：2021-05-13 23:34

　　萧喙扁蝽（Brachyrhynchus hsiaoi）隶属于昆虫纲（Insect）半翅目（Hemiptera）扁蝽总科（Aradoidea）扁蝽科（Aradidae）短喙扁蝽属（Brachyrhynchus Laporte,1833）。本文对6个萧喙扁蝽地理种群进行遗传多样性分析,选取2个线粒体基因（COⅠ、16S rRNA）与2个核基因（18S rDNA、28S rDNA）为研究对象,利用种群的单倍型及其网络图、遗传分化系数Fst、AMOVA、中性检验（Tajima’D值和Fu’sFs值）和Mismatch错配分析其种群间的遗传多样性及其种群遗传结构,从而进一步揭示萧喙扁蝽种群的进化规律及历史动态,为研究扁蝽科多样性提供理论依据。此外,本文还测定6个地理种群的萧喙扁蝽线粒体基因组,并利用线粒体基因组数据构建系统发育树（ML,BI）和利用化石标记估算不同地点萧喙扁蝽的种群分歧时间。研究主要得出以下结果:（1）6个样点萧喙扁蝽的线粒体基因组大小介于15,009-15,247bp之间,是一个环状闭合的DNA分子结构,由37个基因和1个AT富集构成,37个基因包括13个蛋白质编码基因、22个... 

【文章来源】：内蒙古师范大学内蒙古自治区

【文章页数】：103 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
中文摘要
abstract
1 前言
    1.1 萧喙扁蝽研究概述
        1.1.1 萧喙扁蝽分类地位
        1.1.2 萧喙扁蝽形态学特征
        1.1.3 萧喙扁蝽研究现状
    1.2 遗传多样性研究概述
        1.2.1 遗传多样性
        1.2.2 遗传多样性研究方法
    1.3 线粒体基因组及分歧时间估算
        1.3.1 线粒体基因组特征
        1.3.2 半翅目昆虫线粒体基因组研究现状
2 基于线粒体基因组对萧喙扁蝽6个地理种群的进化分析
    2.1 实验方法
        2.1.1 样本采集与线粒体基因组测序
        2.1.2 测序方法
        2.1.3 基因注释及分析方法
        2.1.4 基于蛋白质编码基因构建系统发育树
        2.1.5 分歧时间估算
    2.2 结果分析
        2.2.1 线粒体基因组结果分析
        2.2.2 基于PCGs系统发育关系分析
3 萧喙扁蝽不同地理种群多样性研究
    3.1 实验材料及方法
        3.1.1 样本采集
        3.1.2 实验试剂
        3.1.3 实验方法
    3.2 实验结果分析
        3.2.1 序列组成分析
        3.2.2 遗传多样性分析
        3.2.3 单倍型结果分析
        3.2.4 种群遗传结构分析
        3.2.5 碱基错配分布
        3.2.6 不同萧喙扁蝽地理种群系统发育树
4 讨论
    4.1 萧喙扁蝽线粒体基因组
    4.2 系统发育关系
    4.3 分歧时间估算
    4.4 萧喙扁蝽种群的遗传多样性
    4.5 萧喙扁蝽种群的遗传结构
5 结论与展望
参考文献
附录
致谢
攻读学位期间研究成果及奖励
论文资助项目


【参考文献】：
期刊论文
[1]蝎蝽次目线粒体基因组22个tRNA基因的比较研究（半翅目:异翅亚目）[J]. 张丹丽,张苗苗,田菁,李悦锐,张虎芳.  山西农业大学学报(自然科学版). 2019(01)
[2]30种半翅目昆虫线粒体COⅠ基因密码子偏好性聚类分析[J]. 张玉波,周中艳,王廷慧,邓娟.  江苏农业科学. 2018(14)
[3]基于线粒体COI基因序列的大豆食心虫不同地理种群遗传分化[J]. 史树森,崔娟,朱诗禹,徐伟,王小奇.  植物保护学报. 2018(02)
[4]不同地理种群白纹伊蚊线粒体基因COI的遗传多样性分析[J]. 张瑞玲,姚广琴,潘晓倩,马德珍,赵爱华,张忠.  中国人兽共患病学报. 2017(04)
[5]基于线粒体COI基因序列的内蒙古沙葱萤叶甲种群遗传多样性及遗传分化[J]. 张鹏飞,周晓榕,庞保平,谭瑶,田帅.  环境昆虫学报. 2017(02)
[6]鳞翅目昆虫遗传多样性研究进展[J]. 许涛,王钰婷,李瑞雪,王伟.  中国市场. 2015(19)
[7]巨膜长蝽形态特征及生物学特征的初步研究[J]. 白晓拴,杨春旺,李阳梅,史曙光.  内蒙古大学学报(自然科学版). 2013(04)
[8]巨膜长蝽形态结构的研究[J]. 白晓拴,巩寒月,能乃扎布.  内蒙古师范大学学报(自然科学汉文版). 2013(01)
[9]不同气候适应类型果蝇体色黑化可塑性的适应性变化(英文)[J]. Ravi PARKASH,Seema RAMNIWAS,Chanderkala LAMBHOD,Babita KAJLA.  昆虫学报. 2011(10)
[10]中国桃蛀螟不同地理种群的遗传多样性[J]. 张颖,李菁,王振营,何康来.  昆虫学报. 2010(09)

博士论文
[1]异翅亚目昆虫比较线粒体基因组学及系统发育关系研究[D]. 姜培.中国农业大学 2017
[2]中国菜蝽属DNA条形码和线粒体基因组学研究（半翅目：蝽科）[D]. 赵婉清.山西农业大学 2018
[3]我国禾谷缢管蚜种群遗传多样性和遗传结构及农药对其胁迫效应研究[D]. 段辛乐.西北农林科技大学 2015
[4]基于线粒体基因对苹果蠹蛾和梨小食心虫不同地理种群遗传结构的研究[D]. 李亦松.中国农业大学 2015
[5]我国桃树桃蚜不同地理种群遗传多样性分析[D]. 李杰.中国农业大学 2015
[6]不同地理种群二点委夜蛾遗传多样性以及不同世代寄主间转移规律[D]. 陈方.中国农业科学院 2015
[7]中国不同地理种群环棱螺遗传多样性和分类阶元的研究[D]. 顾钱洪.华中农业大学 2013
[8]中国麦红吸浆虫不同地理种群的遗传结构及遗传多样性研究[D]. 段云.中国农业科学院 2013
[9]基于微卫星分子标记的中国疫区内苹果蠹蛾Cydia pomonella（L.）种群遗传多样性和遗传结构研究[D]. 门秋雷.西北农林科技大学 2012
[10]沙棘木蠹蛾地理种群遗传多样性研究[D]. 马超德.北京林业大学 2008

硕士论文
[1]基于mtDNA COI和ND5基因的香梨优斑螟种群遗传结构研究[D]. 尚北晨.塔里木大学 2018
[2]新疆马铃薯甲虫遗传多样性分析及SSR引物筛选[D]. 刘旸.石河子大学 2017
[3]基于线粒体基因的不同地理种群大豆蚜遗传分化研究[D]. 李冉.东北农业大学 2016
[4]岛屿隔离对桔小实蝇种群遗传多样性的影响[D]. 易春燕.华南农业大学 2016
[5]草履蚧不同寄主和地理种群分化及遗传多样性研究[D]. 刘全超.河北农业大学 2012
[6]双钩异翅长蠹不同地理种群遗传多样性研究[D]. 舒骞.西南林业大学 2010



本文编号：3184901