大麦条纹病菌致病性候选基因Pgmiox功能研究
发布时间：2021-06-20 13:33
本研究采用RNA干扰技术,对大麦条纹病菌（Pyrenophora graminea）中的基因Pgmiox进行功能研究。从野生株QWC中克隆该基因,构建其RNA干扰载体,经过PEG介导遗传转化,以潮霉素抗性筛选获得54株转化子,随机选择6个突变菌株进行功能分析,明确Pgmiox基因在大麦条纹病菌中致病性的功能机制,为该病原菌的基因调控机理和致病机制奠定基础。主要结论如下所示:1.本试验克隆到大麦条纹病菌基因Pgmiox,并对其进行生物信息学分析。结果得出:该基因没有内含子,基因全长981bp,Pgmiox基因编码326个氨基酸,将基因提交注册到GenBank,序列号为MK302448;软件分析该基因编码蛋白的等电点约为4.93,得出该蛋白为酸性蛋白;预测其二级结构,以α-螺旋（Alpha helix,Hh）为主占到46.93%;蛋白结构域分析得出该基因有一个Pfam域miox结构域;构建的系统进化树得出,大麦条纹病菌（P.graminea）和小麦褐斑长蠕孢霉菌（Pyrenophora tritici-repentis）的肌醇加氧酶基因蛋白序列聚合在一起。2.运用干扰片段Pgmiox1、片...
【文章来源】：甘肃农业大学甘肃省
【文章页数】：74 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
显微镜观察大麦条纹病菌的分生孢子（何智宏，2014）
Pgmiox基因全长DNA（1）和cDNA（2）扩增结果
大麦条纹病菌致病性候选基因Pgmiox功能研究19图2-2Pgmiox基因的蛋白二级结构预测图Figure2-2PredictionofproteinsecondarystructureofPgmioxgene图2-3Pgmiox基因的蛋白质跨膜区预测图Figure2-3PredictionmapofproteintransmembraneregionofPgmioxgene用ProtScale软件进行亲疏水性分析，如图2-4所示，0以上的峰值表示蛋白为疏水性，以下的峰值表示蛋白为亲水性，同时结合脂肪指数（Aliphaticindex）和亲水性平均值（GRAVY）推断得出，Pgmiox编码的蛋白为亲水性蛋白。NetPhos3.1Server软件预测分析磷酸化位点得出；Pgmiox基因编码蛋白存在络氨酸（Tyrosine，Tyr），苏氨酸（Threonine，Thr）和丝氨酸（Serine，Ser）磷酸化位点，具体的位点如图2-5所示。SMART工具进行蛋白结构域分析得出该基因有一个Pfam域miox结构域（Myo-inositoloxygenase；78AA~326AA）（图2-6）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]谷物及其制品中真菌毒素的前处理及检测技术研究进展[J]. 侯广月,杜营,杨帆,周莉莉,许士明,邹惠玲. 中国果菜. 2019(12)
[2]内生真菌HND5菌株抗香蕉枯萎病菌相关非核糖体多肽合成酶基因簇的鉴定[J]. 杨扬,陈奕鹏,周维,蔡吉苗,王宝,黄贵修. 植物保护学报. 2019(05)
[3]大麦抗条纹病与SSR标记的关联分析[J]. 司二静,孟亚雄,李葆春,马小乐,张宇,王化俊. 植物保护学报. 2019(05)
[4]大麦抗条纹病基因的定位分析[J]. 司二静,张宇,孟亚雄,李葆春,马小乐,王化俊. 植物保护学报. 2019(04)
[5]希金斯刺盘孢T-DNA插入突变体表型筛选及其特性分析[J]. 周鹏,顾琼楠,黄俊斌,郑露. 华中农业大学学报. 2019(04)
[6]甘肃省大麦条纹病菌遗传多样性及致病力差异[J]. 李葆春,司二静,杨淑莲,孟亚雄,马小乐,王化俊. 植物保护. 2019(03)
[7]植物病原真菌毒素的分类、致病机制及应用前景[J]. 王珊珊,乜兰春,李潘,王政. 江苏农业科学. 2019(03)
[8]镰刀菌毒素脱氧雪腐镰刀菌烯醇脱毒菌及脱毒酶研究进展[J]. 何伟杰,刘易科,朱展望,张静柏,高春保,廖玉才. 植物病理学报. 2019(05)
[9]大麦表型多样性分析及优异饲草种质资源筛选[J]. 蔡羽,杨平,冯宗云. 植物遗传资源学报. 2019(04)
[10]谷物及饲料中真菌毒素混合污染及其体外联合毒性研究[J]. 郝旭晨,董燕婕,范丽霞,苑学霞,梁京芸,王磊,李大鹏,赵善仓. 农产品质量与安全. 2018(06)
博士论文
[1]大麦条纹病病原菌及防治研究[D]. 郑果.甘肃农业大学 2011
[2]玉米大斑病菌黑色素合成途径相关基因的克隆及功能分析[D]. 曹志艳.河北农业大学 2009
硕士论文
[1]棉花黄萎病菌致病基因VDAG9119和VdIsc1的功能分析[D]. 李宛霖.南京农业大学 2015
[2]大麦条纹病病原菌遗传多样性及诱导表达相关蛋白的分析[D]. 何智宏.甘肃农业大学 2014
[3]大麦条纹病菌种群遗传结构分析及抗性种质鉴定[D]. 吴宽然.浙江师范大学 2013
[4]大麦条纹病病原生物学及药剂防治研究[D]. 杨瑞.甘肃农业大学 2010
[5]番茄抗坏血酸生物合成酶GME和MIOX的功能分析[D]. 刘军霞.华中农业大学 2009
本文编号：3239292
【文章来源】：甘肃农业大学甘肃省
【文章页数】：74 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
显微镜观察大麦条纹病菌的分生孢子（何智宏，2014）
Pgmiox基因全长DNA（1）和cDNA（2）扩增结果
大麦条纹病菌致病性候选基因Pgmiox功能研究19图2-2Pgmiox基因的蛋白二级结构预测图Figure2-2PredictionofproteinsecondarystructureofPgmioxgene图2-3Pgmiox基因的蛋白质跨膜区预测图Figure2-3PredictionmapofproteintransmembraneregionofPgmioxgene用ProtScale软件进行亲疏水性分析，如图2-4所示，0以上的峰值表示蛋白为疏水性，以下的峰值表示蛋白为亲水性，同时结合脂肪指数（Aliphaticindex）和亲水性平均值（GRAVY）推断得出，Pgmiox编码的蛋白为亲水性蛋白。NetPhos3.1Server软件预测分析磷酸化位点得出；Pgmiox基因编码蛋白存在络氨酸（Tyrosine，Tyr），苏氨酸（Threonine，Thr）和丝氨酸（Serine，Ser）磷酸化位点，具体的位点如图2-5所示。SMART工具进行蛋白结构域分析得出该基因有一个Pfam域miox结构域（Myo-inositoloxygenase；78AA~326AA）（图2-6）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]谷物及其制品中真菌毒素的前处理及检测技术研究进展[J]. 侯广月,杜营,杨帆,周莉莉,许士明,邹惠玲. 中国果菜. 2019(12)
[2]内生真菌HND5菌株抗香蕉枯萎病菌相关非核糖体多肽合成酶基因簇的鉴定[J]. 杨扬,陈奕鹏,周维,蔡吉苗,王宝,黄贵修. 植物保护学报. 2019(05)
[3]大麦抗条纹病与SSR标记的关联分析[J]. 司二静,孟亚雄,李葆春,马小乐,张宇,王化俊. 植物保护学报. 2019(05)
[4]大麦抗条纹病基因的定位分析[J]. 司二静,张宇,孟亚雄,李葆春,马小乐,王化俊. 植物保护学报. 2019(04)
[5]希金斯刺盘孢T-DNA插入突变体表型筛选及其特性分析[J]. 周鹏,顾琼楠,黄俊斌,郑露. 华中农业大学学报. 2019(04)
[6]甘肃省大麦条纹病菌遗传多样性及致病力差异[J]. 李葆春,司二静,杨淑莲,孟亚雄,马小乐,王化俊. 植物保护. 2019(03)
[7]植物病原真菌毒素的分类、致病机制及应用前景[J]. 王珊珊,乜兰春,李潘,王政. 江苏农业科学. 2019(03)
[8]镰刀菌毒素脱氧雪腐镰刀菌烯醇脱毒菌及脱毒酶研究进展[J]. 何伟杰,刘易科,朱展望,张静柏,高春保,廖玉才. 植物病理学报. 2019(05)
[9]大麦表型多样性分析及优异饲草种质资源筛选[J]. 蔡羽,杨平,冯宗云. 植物遗传资源学报. 2019(04)
[10]谷物及饲料中真菌毒素混合污染及其体外联合毒性研究[J]. 郝旭晨,董燕婕,范丽霞,苑学霞,梁京芸,王磊,李大鹏,赵善仓. 农产品质量与安全. 2018(06)
博士论文
[1]大麦条纹病病原菌及防治研究[D]. 郑果.甘肃农业大学 2011
[2]玉米大斑病菌黑色素合成途径相关基因的克隆及功能分析[D]. 曹志艳.河北农业大学 2009
硕士论文
[1]棉花黄萎病菌致病基因VDAG9119和VdIsc1的功能分析[D]. 李宛霖.南京农业大学 2015
[2]大麦条纹病病原菌遗传多样性及诱导表达相关蛋白的分析[D]. 何智宏.甘肃农业大学 2014
[3]大麦条纹病菌种群遗传结构分析及抗性种质鉴定[D]. 吴宽然.浙江师范大学 2013
[4]大麦条纹病病原生物学及药剂防治研究[D]. 杨瑞.甘肃农业大学 2010
[5]番茄抗坏血酸生物合成酶GME和MIOX的功能分析[D]. 刘军霞.华中农业大学 2009
本文编号：3239292
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