新疆部分地区牛羊细粒棘球蚴病分子流行病学调查

发布时间：2021-07-03 03:23

　　为进一步掌握细粒棘球蚴病在新疆阿勒泰、昌吉、伊犁和喀什四个地区（州）牛羊中的流行状况,明确流行株的遗传差异性,本研究通过PCR扩增细粒棘球绦虫线粒体基因组cox1基因片段和nad5基因片段,然后对扩增产物进行测序和基因多态性分析,旨在获取相应遗传学差异信息。对新疆阿勒泰、昌吉、伊犁和喀什四地区（州）的部分牛羊屠宰场进行细粒棘球蚴病流行病学调查,筛查了352头牛和5202只绵羊,共采集4头牛和116只绵羊的疑似感染包囊样本,其中1头牛和35只绵羊可分离原头蚴,喀什绵羊的感染强度最高,最多1只绵羊采集的包囊样本可达到32个包囊。用长度为1649bp的线粒体基因组cox1基因片段对来自3头牛和96只绵羊的156个包囊样本获得PCR扩增。对目的片段进行聚类分析发现,这些包囊样本均为细粒棘球绦虫G1基因型（Echinococcus granulosus G1）,共有53个不同的单倍型,同源性为99.7%～100%;发现57个位点核苷酸发生碱基置换,约占分析位点总数的3.46%,序列间差异值在0%～0.3%之间;分离株核苷酸序列所有突变中只存在转换和颠换,没有缺失或插入,并且转换数明显多于颠换数,... 

【文章来源】：塔里木大学新疆维吾尔自治区

【文章页数】：51 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

羊肝细粒棘球蚴（

塔里木大学硕士学位论文第2章细粒棘球蚴病形态学观察11囊最少，1头牛和1只绵羊的2个包囊可分离到原头（表2-4）。表2-4不同地区棘球蚴包囊分离原头蚴情况Table2-4Separationofprotoscolexfromhydatidcystsindifferentareas地区可育囊（宿主）可育囊（包囊）阿勒泰22昌吉59伊犁33喀什25203总计36217有原头蚴的包囊即是可育囊，无原头蚴的包囊则是不育囊。一个可育囊囊液中有无数的原头蚴，若将囊液在离心管内静置几分钟后，管底可见沉淀物，即棘球沙。棘球蚴显微镜观察呈椭圆形，有向内翻转收缩的头节，顶突和4个吸盘内陷（图2-2）。图2-2细粒棘球蚴原头蚴（10×10）Figure2-2ProtoscolexofEchinococcusgranulosus（10×10）2.3讨论通过对新疆阿勒泰、昌吉、伊犁和喀什等4个地区（州）屠宰场屠宰牛和绵羊细粒棘球蚴感染情况调查，发现绵羊存在棘球蚴病流行状况，牛被棘球蚴病感染很少见。本调查总共对5202只绵羊和352头牛进行检查，其中116只绵羊和4头牛感染棘球蚴玻结合宰后检查结果，发现存在细粒棘球蚴轻度感染或在感染初期的绵羊都不会表现出明显症状，感染严重后，病例会出现营养不良、被毛逆立脱落、呼吸困难伴咳嗽等症状，若病羊的肝脏体积异常增大会眼观右侧腹部膨出。屠宰后可在肝脏、肺脏检查到包虫病包囊。包囊数量和直径与绵羊年龄无明显相关性，可能与绵羊营养状况有关。另外，牛不是细粒棘球蚴病最适宜的宿主，因此很少感染，感染后一般也不会表现临床症状。

塔里木大学硕士学位论文第3章细粒棘球蚴cox1基因序列分析163.2结果3.2.1cox1基因扩增电泳结果PCR扩增产物经电泳，发现共96只羊和3头牛的156个包囊样本利用凝胶成像系统能观察到目的条带（1800bp处）（图3-1）。图3-1cox1基因PCR扩增图片Figure3-1PCRamplificationpictureofcox1gene3.2.2cox1基因测序及序列比对结果将手工拼接的序列经过BLAST比对，新疆昌吉、阿勒泰、伊犁和喀什4个地区（州）所收集的96只绵羊和3头牛的156个包囊样本cox1基因测序结果均为G1基因型（表3-2）。表3-2不同地区的cox1基因扩增情况Table3-2cox1geneamplificationindifferentregions地区屠宰数cox1基因扩增宿主数cox1基因扩增包囊数阿勒泰736510昌吉6232337伊犁14382122喀什27565087总计5554991563.2.3细粒棘球绦虫cox1基因单倍型特征利用Dnasp分析，本试验中PCR扩增成功的156个包囊样本的cox1基因序列可归为53个单倍型，将它们命名为Hap1至Hap53，并将它们连同其它基因型和其它虫种一起构建系统进化树（图3-2）。如图所示，所有的单倍型和G1基因型参考序列在同一树枝上，跟G3基因型为姊妹关系，跟其他基因型和棘球绦虫不在一个树枝上。


本文编号：3261762