小肠蛋白质组学结合血清代谢组学分析中国地鼠自发性2型糖尿病动物模型的分子生物学特征

发布时间：2021-10-29 15:42

　　目的:通过对初步建立的中国地鼠自发性2型糖尿病（T2DM）动物模型进行血糖监测,建立稳定的中国地鼠自发性T2DM动物模型群体,然后应用蛋白质组学和代谢组学分析筛选糖尿病地鼠小肠组织中的差异表达蛋白及血清样本中的差异代谢物,从蛋白质组学层面和代谢角度分析中国地鼠自发性T2DM的分子生物学特征,为中国地鼠模型在T2DM机制研究中的应用提供科学依据。方法:在初步建立中国地鼠自发性T2DM动物模型的基础上,继续对该模型中用于扩群的地鼠进行近亲繁殖产生后代,从地鼠3月龄开始对其空腹血糖值（FBG）进行监测,将FBG≥6 mmol/L的地鼠作为糖尿病组,选择地鼠群体中FBG≤4.5 mmol/L的地鼠作为正常对照组。应用基于质谱的蛋白质组学和代谢组学分析构建糖尿病中国地鼠小肠组织差异表达蛋白谱及血清差异代谢物谱图,通过基因本论（GO）和KEGG通路富集对筛选出的差异表达蛋白进行功能富集分析,在系统水平上通过代谢通路富集分析（MPEA）对筛选出的差异代谢物进行可视化的生物学解释,然后对蛋白质组学和代谢组学结果进行联合分析,并且利用Western Blotting实验验证候选差异表达蛋白PGAM1、P... 

【文章来源】：山西医科大学山西省

【文章页数】：74 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

糖尿病中国地鼠空腹血糖、葡萄糖耐量测定

山西医科大学硕士学位论文92.2质谱质控检测图1-2展示了中国地鼠小肠组织质谱质控检测结果，图1-2A中大部分肽段为7~20个氨基酸，符合基于trypsin酶解和HCD碎裂方式的一般规律（小于5个氨基酸的肽段产生的碎片离子过少，不能产生有效的序列鉴定，而大于20个氨基酸的肽段质量和电荷数较高，不适合HCD的碎裂方式）。图1-2B中蛋白的分子量与覆盖度呈现负相关关系，图1-2C中绝大多数谱图的一级质量误差在10ppm以内，符合轨道阱质谱的高精度特性。以上结果说明质谱鉴定到的肽段长度的分布符合质控要求，蛋白的定性定量分析结果可靠。注：（A）图为质谱鉴定到肽段的长度分布。（B）图为质谱鉴定到的蛋白分子量与覆盖度的关系。（C）图为质谱仪的质量精度分布图图1-2中国地鼠小肠组织质谱质控检测

山西医科大学硕士学位论文12性。图1-4A为所有样本的蛋白定量PCA分析结果展示图，红色的点代表正常对照组样本，蓝色的点代表糖尿病组样本，图中两组重复样本之间的聚集程度均比较好，说明8例中国地鼠小肠组织蛋白定量重复性较好。图1-4B为各重复样本间蛋白定量值的RSD箱线图，如图所示对照组和糖尿病组整体RSD值都比较小，也进一步说明定量重复性较好。图1-4C为利用所有样本两两之间计算皮尔森相关系数的热图，该系数是度量两组数据线性相关程度的值：当皮尔森系数越接近-1为负相关，越接近1为正相关，越接近0为不相关。注：（A）图为蛋白定量PCA得分图，图中红色的点代表正常对照组，蓝色的点代表糖尿病组。（B）图为蛋白定量值的RSD箱线图。（C）图为皮尔森相关系数图。图1-4重复样品间蛋白定量分析2.5差异表达蛋白的功能分类2.5.1GO注释结果蛋白GO注释的数据库为UniProt-GOA（http://www.ebi.ac.uk/GOA/），差异表达蛋白的功能分类如图1-5所示，BP本体类别中有9个子类，其中包含的差异表达蛋


本文编号：3464934