新疆部分规模化猪场毕氏肠微孢子虫的检测与鉴定
发布时间：2021-11-24 22:20
毕氏肠微孢子虫是一种常见的人兽共患肠道病原体,可导致免疫缺陷者和免疫功能低下者急性致死性腹泻。目前,基于毕氏肠微孢子虫核糖体DNA内部转录间隔区（ITS）基因位点,在230多种宿主中鉴定出至少500个基因型,其中,猪源毕氏肠微孢子虫有120多个基因型,多数存在人兽共患性,猪被认为是人感染毕氏肠微孢子虫的主要传染源之一。新疆地理生态环境丰富多样,有关该地区猪毕氏肠微孢子虫的调查研究尚较少。本研究采用PCR法对新疆部分规模化猪场毕氏肠微孢子虫进行检测与鉴定,掌握其流行情况和基因型分布特征。1.收集阿克苏某场香猪粪便样本44份,基于ITS基因位点,采用PCR法检测其DNA样本,发现18份呈毕氏肠微孢子虫阳性,感染率为40.9%（18/44）,断奶前和断奶后仔猪感染率分别为100%（9/9）和32.1%（9/28）,成年母猪未发现感染,不同年龄段猪的毕氏肠微孢子虫感染率统计学差异极显著（P<0.01）。鉴定出5个基因型,分别为EbpA（n=1）、EbpC（n=13）、Peru8（n=2）、MJ12（n=1）和1个新基因型（命名为XJP-I,n=1）。种系发育分析显示,5个基因型均属于组群...
【文章来源】：塔里木大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】：58 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
微孢子虫孢子和其典型的生活史(不同种属之间有差异)，引自FranzenC[13]
塔里木大学硕士学位论文第2章阿克苏某场香猪毕氏肠微孢子虫的分子检测与鉴定20图2-1基于ITS基因检测毕氏肠微孢子虫电泳结果M：DNA标准DL2000泳道1-21：样本编号N：阴性对照P：阳性对照Figure2-1ThePCRamplificationofE.bieneusibasedonITSgeneM:DNAmarkerDL2000Lanes1-21:NumberofsamplesP:PositivecontrolN:Negativecontrol表2-3阿克苏某场香猪毕氏肠微孢子虫感染情况和基因型Table2-3InfectionandgenotypeofE.bieneusifromXiangpiginAksu2.3.2毕氏肠微孢子虫基因型鉴定18个阳性样本均成功双向测序，经序列比对分析，鉴定出4个已知基因型(EbpC、Peru8、EbpA和MJ12)和1个新基因型(命名为XJP-I)，GenBank序列登录号为MK312665，见表2-3。种系发育分析显示，5个基因型均属于组群1，见图2-2。年龄Age样本数No.ofsample阳性数No.ofpositive感染率(%)Infectionrate(%)基因型(个数)Genotype(n)<60d99100EbpC(4)、MJ12(2)、EbpA(1)、Peru8(1)、XJP-I(1)61d-180d28932.1EbpC(9)>360d700-总计441840.9EbpC(13)、MJ12(2)、Peru8(1)、EbpA(1)、XJP-I(1)
塔里木大学硕士学位论文第2章阿克苏某场香猪毕氏肠微孢子虫的分子检测与鉴定21图2-2基于毕氏肠微孢子虫ITS基因序列构建的种系发育进化树Figure2-2PhylogenetictreebasedonE.bieneusiITSgenesequence空心三角形表示已报道的基因型，实心三角形表示新基因型。Knownandnewgenotypesareindicatedbyopentriangleandfilledtriangle,respectively.
【参考文献】：
期刊论文
[1]啮齿动物毕氏肠微孢子虫分子流行病学进展[J]. 赵威,周换换,徐柳莲,马天明,吕刚. 中国人兽共患病学报. 2019(12)
[2]藏香猪毕氏肠微孢子虫感染情况和基因分型[J]. 李蕴慧,张会军,宋军科,伍雪梅,高艺,林青,赵光辉. 中国兽医学报. 2019(09)
[3]云南地区猪毕氏微孢子虫的分子检测及其基因型鉴定[J]. 石莲琴,翟国莲,吴杰,李朝,赵国洪,邹丰才. 南方农业学报. 2018(08)
[4]我国生猪养殖产业现状、模式与区域布局分析[J]. 于洪康,吴建寨,王亚辉,沈辰. 中国猪业. 2018(01)
[5]微孢子虫研究进展[J]. 吴杰,项勋,赵屹钦,邓紫艳,王世玉,常华. 动物医学进展. 2017(06)
[6]我国养猪业污染问题产生的根本原因及三步法整体解决方案[J]. 许道军,唐艳华,黄锋,蔡鹏. 中国猪业. 2016(10)
[7]三十年来我国生猪养殖区域分布变化趋势[J]. 吴霞,陈磊,潘红梅,王金勇. 中国畜牧杂志. 2013(16)
[8]腹泻病人隐孢子虫及其他原虫感染粪样检测分析[J]. 陈韶红,艾琳,田利光,张永年,童小妹,李浩,陈家旭. 中国人兽共患病学报. 2012(08)
[9]微孢子虫检测技术的研究进展[J]. 王永宾,刘吉平. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2009(02)
本文编号：3516862
【文章来源】：塔里木大学新疆维吾尔自治区
【文章页数】：58 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
微孢子虫孢子和其典型的生活史(不同种属之间有差异)，引自FranzenC[13]
塔里木大学硕士学位论文第2章阿克苏某场香猪毕氏肠微孢子虫的分子检测与鉴定20图2-1基于ITS基因检测毕氏肠微孢子虫电泳结果M：DNA标准DL2000泳道1-21：样本编号N：阴性对照P：阳性对照Figure2-1ThePCRamplificationofE.bieneusibasedonITSgeneM:DNAmarkerDL2000Lanes1-21:NumberofsamplesP:PositivecontrolN:Negativecontrol表2-3阿克苏某场香猪毕氏肠微孢子虫感染情况和基因型Table2-3InfectionandgenotypeofE.bieneusifromXiangpiginAksu2.3.2毕氏肠微孢子虫基因型鉴定18个阳性样本均成功双向测序，经序列比对分析，鉴定出4个已知基因型(EbpC、Peru8、EbpA和MJ12)和1个新基因型(命名为XJP-I)，GenBank序列登录号为MK312665，见表2-3。种系发育分析显示，5个基因型均属于组群1，见图2-2。年龄Age样本数No.ofsample阳性数No.ofpositive感染率(%)Infectionrate(%)基因型(个数)Genotype(n)<60d99100EbpC(4)、MJ12(2)、EbpA(1)、Peru8(1)、XJP-I(1)61d-180d28932.1EbpC(9)>360d700-总计441840.9EbpC(13)、MJ12(2)、Peru8(1)、EbpA(1)、XJP-I(1)
塔里木大学硕士学位论文第2章阿克苏某场香猪毕氏肠微孢子虫的分子检测与鉴定21图2-2基于毕氏肠微孢子虫ITS基因序列构建的种系发育进化树Figure2-2PhylogenetictreebasedonE.bieneusiITSgenesequence空心三角形表示已报道的基因型，实心三角形表示新基因型。Knownandnewgenotypesareindicatedbyopentriangleandfilledtriangle,respectively.
【参考文献】：
期刊论文
[1]啮齿动物毕氏肠微孢子虫分子流行病学进展[J]. 赵威,周换换,徐柳莲,马天明,吕刚. 中国人兽共患病学报. 2019(12)
[2]藏香猪毕氏肠微孢子虫感染情况和基因分型[J]. 李蕴慧,张会军,宋军科,伍雪梅,高艺,林青,赵光辉. 中国兽医学报. 2019(09)
[3]云南地区猪毕氏微孢子虫的分子检测及其基因型鉴定[J]. 石莲琴,翟国莲,吴杰,李朝,赵国洪,邹丰才. 南方农业学报. 2018(08)
[4]我国生猪养殖产业现状、模式与区域布局分析[J]. 于洪康,吴建寨,王亚辉,沈辰. 中国猪业. 2018(01)
[5]微孢子虫研究进展[J]. 吴杰,项勋,赵屹钦,邓紫艳,王世玉,常华. 动物医学进展. 2017(06)
[6]我国养猪业污染问题产生的根本原因及三步法整体解决方案[J]. 许道军,唐艳华,黄锋,蔡鹏. 中国猪业. 2016(10)
[7]三十年来我国生猪养殖区域分布变化趋势[J]. 吴霞,陈磊,潘红梅,王金勇. 中国畜牧杂志. 2013(16)
[8]腹泻病人隐孢子虫及其他原虫感染粪样检测分析[J]. 陈韶红,艾琳,田利光,张永年,童小妹,李浩,陈家旭. 中国人兽共患病学报. 2012(08)
[9]微孢子虫检测技术的研究进展[J]. 王永宾,刘吉平. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2009(02)
本文编号：3516862
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