西南地区稻瘟病菌群体遗传多样性分析及其毒性相关基因分布频率初步预测

发布时间：2022-01-10 10:14

　　由稻瘟病菌（Magnapothe oryzae）引起的稻瘟病是世界水稻生产中三大毁灭性病害之一,也是西南地区一季稻常见的流行性病害之一。该病害在贵州南部、四川盆地中西部和云南西南部等地发生率非常高。因此,致力于稻瘟病菌群体遗传结构及其多样性的研究、掌握其毒性相关基因的出现频率,对于品种选育、合理布局和延长抗病品种的使用寿命等方面都具有重要的意义。本研究通过对西南地区8个县（市）所采集到的穗颈瘟标样进行病菌分离,选用13对SSR引物和16对毒性相关基因特异性引物对病原菌基因组DNA进行PCR扩增。根据反应的结果,建立基于SSR序列和毒性相关基因序列的0-1数据库,通过一系列软件对病原菌群体遗传结构及遗传多样性进行分析,并根据扩增结果初步预测毒性相关基因的分布频率,得到如下结论：1、通过分离得到200个单孢分离菌株。其中四川雅安52株,温江37株,南充33株,自贡6株；重庆永川25株,垫江24株,梁平15株；贵州湄潭8株。2、8对SSR引物都能扩增出特异性条带,扩增频率较高,大部分在95.00%以上；16对毒性相关基因特异性引物均能扩增出目的条带,扩增频率差异较大。3、西南地区稻瘟病菌群体... 

【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校

【文章页数】：62 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 文献综述
    1 稻瘟病菌的多样性
        1.1 稻瘟病菌寄主多样性
        1.2 稻瘟病菌生理小种多样性
            1.2.1 致病型及生理小种研究
            1.2.2 生理小种多样性
            1.2.3 生理小种多样性产生的原因
        1.3 稻瘟病菌遗传多样性研究
    2 稻瘟病菌致病相关基因研究
        2.1 稻瘟病菌致病相关基因研究概况
        2.2 稻瘟病菌致病相关基因
            2.2.1 参与产孢过程的基因
            2.2.2 参与附着胞分化的功能基因
            2.2.3 参与附着胞成熟过程中的功能基因
            2.2.4 参与侵入栓形成及侵入相关基因
            2.2.5 参与侵入后菌丝分化及扩展相关的基因
            2.2.6 其他稻瘟病菌致病相关基因
    3 稻瘟病菌无毒基因研究
        3.1 稻瘟病菌无毒基因研究概况
        3.2 稻瘟病菌无毒基因的遗传分析
        3.3 稻瘟病菌无毒基因的的结构与功能
    4 本研究的目的意义
第二章 材料与方法
    1 实验材料
        1.1 稻瘟病样本
        1.2 仪器设备
        1.3 试验试剂
        1.4 培养基
    2 实验方法
        2.1 稻瘟病菌菌株的分离与培养
            2.1.1 稻瘟病标样保湿培养
            2.1.2 病菌的单孢分离
            2.1.3 菌种的制备与保存
            2.1.4 菌丝体培养
        2.2 病菌DNA提取
        2.3 引物设计
        2.4 PCR扩增条件及电泳
        2.5 数据统计与分析
第三章 结果与分析
    1 菌株的分离结果
    2 全基因组DNA提取效果检测
    3 供试菌株的PCR扩增结果
        3.1 SSR引物扩增结果
        3.2 致病基因特异性引物扩增结果
        3.3 无毒基因特异性引物扩增结果
    4 西南地区稻瘟病菌群体遗传结构及其多样性分析
        4.1 西南地区稻瘟病菌群体遗传结构
            4.1.1 西南地区稻瘟病菌群体单元型分析
            4.1.2 西南地区稻瘟病菌群体遗传宗谱分析
        4.2 稻瘟病菌遗传结构的地理分布特点
        4.3 西南地区稻瘟病菌自然种群的遗传参数分析
            4.3.1 稻瘟病菌遗传多样性水平
            4.3.2 稻瘟病菌群体遗传分化
        4.4 西南地区稻瘟病菌群体间的遗传距离与聚类分析
            4.4.1 群体间的遗传距离
            4.4.2 群体间的聚类分析
    5 西南地区稻瘟病菌群体间毒性相关基因分布频率的初步预测
        5.1 致病基因分布频率的初步预测
        5.2 无毒基因分布频率的初步预测
第四章 结论与讨论
    1 结论
    2 讨论
        2.1 研究背景
        2.2 稻瘟病菌群体遗传结构研究方法的选择
        2.3 加强田间监测,掌握动态变化规律
        2.4 毒性相关基因分布频率的初步预测
    3 后续实验展望
        3.1 加强田间监测,扩大病原菌群体
        3.2 西南地区稻瘟病菌群体遗传结构与病原菌致病型的关系
        3.3 西南地区稻瘟病菌致病性测定
        3.4 探究毒性相关基因在西南地区稻瘟病菌群体中的分布频率
参考文献
致谢
硕士期间发表文章


【参考文献】：
期刊论文
[1]辽宁省稻瘟病菌无毒基因型鉴定及分析[J]. 王世维,郑文静,赵家铭,魏松红,王妍,赵宝海,刘志恒.  中国农业科学. 2014(03)
[2]稻瘟病菌无毒基因研究进展[J]. 姚琳,王剑,卢代华,张欢,陈宇,龚学书,毛建辉.  中国农学通报. 2014(04)
[3]研究稻瘟病菌群体遗传多态性的分子标记方法[J]. 穆慧敏,姜华,王艳丽,孙国昌.  中国水稻科学. 2013(05)
[4]中国稻瘟病菌种群分布及优势生理小种的研究进展[J]. 肖丹凤,张佩胜,王玲,黄世文.  中国水稻科学. 2013(03)
[5]黑龙江省稻瘟病菌无毒基因分析及抗病种质资源筛选[J]. 李祥晓,王倩,罗生香,何云霞,朱苓华,周永力,黎志康.  作物学报. 2012(12)
[6]湖南稻瘟病菌遗传多样性分析[J]. 童建新,任佐华,刘毅雄,俞海,刘二明.  杂交水稻. 2012(03)
[7]云南省稻瘟病菌群体对稻瘟病抗性单基因系的致病性分析[J]. 董丽英,王群,刘树芳,郑凤萍,李迅东,杨勤忠.  西南农业学报. 2012(02)
[8]长蛸（Octopus variabilis）不同地理群体遗传多样性的ISSR分析[J]. 郭宝英,周超,吕振明,李继姬,吴常文.  海洋与湖沼. 2011(06)
[9]稻瘟菌无毒基因研究进展[J]. 张哲,姜华,王艳丽,孙国昌.  遗传. 2011(06)
[10]用SSR标记法对黑龙江省稻瘟菌无毒基因的检测[J]. 张崎峰,靳学慧,蔡鑫鑫,巩双印,刘显元.  中国农学通报. 2010(10)

硕士论文
[1]湖北省稻瘟病菌群体遗传多样性及水稻品种（系）抗瘟性研究[D]. 王永崇.华中农业大学 2009



本文编号：3580531