肉用牛bHLH转录因子家族成员的鉴定与分析

发布时间：2022-01-17 17:16

　　碱性螺旋环螺旋（bHLH）转录因子属于真核生物蛋白当中的一个大家族,其在细胞增殖与细胞分化,神经元的分化,肌肉组织与器官的发生,肠组织发育以及性别决定等生长发育过程中有重要作用。牛是哺乳类偶蹄目的草食性反刍动物,作为奶,肉以及皮革等的来源,与人类生活密切相关。家牛的基因组中有80%的基因与人类基因达到共享,并且家牛与人类的遗传相似性高于老鼠与人类的遗传相似性,理论上可作为研究人类疾病的动物模型。牦牛能够适应高原环境,表现在其心脏以及肺发达、没有肺动脉高压、觅食能力强且能量代谢高等解剖学和生理学性状,通过将人类基因组与牛等动物的基因组进行比较,便于更加全面与深入地理解人类疾病的基因基础。bHLH转录因子序列大约由60个氨基酸残基组成,是由位于氨基端的碱性结构域（b）和位于羧基端的螺旋环螺旋结构域（HLH）两部分组成的高度保守的蛋白质因子。碱性区域的功能是与特定的六核苷酸DNA序列结合,螺旋环螺旋结构域是通过与其他HLH蛋白形成同源或异缘二聚体进而发挥其功能。根据bHLH蛋白与核心的六核苷酸序列的结合特异性以及蛋白质的保守结构域的特点对bHLH蛋白进行分类,将其划分为A,B,C,D,E,F... 

【文章来源】：阜阳师范大学安徽省

【文章页数】：79 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第1章 绪论
    1 bHLH转录因子的分类
        1.1 动物bHLH转录因子的分类
        1.2 植物和真菌bHLH转录因子的分类
    2 已报道的bHLH转录因子成员鉴定结果
    3 bHLH转录因子的功能
        3.1 动物bHLH转录因子的功能
        3.2 植物与真菌bHLH转录因子的功能
    4 研究目的及意义
    5 研究内容与技术路线
        5.1 研究内容
        5.2 技术路线
第2章 家牛与牦牛bHLH转录因子的鉴定与分类
    1 材料
        1.1 118 条人bHLH基序
        1.2 生物信息学工具
    2 方法与步骤
        2.1 BLASTP和TBLASTN搜索
        2.2 删除冗余和序列核查
        2.3 序列比对
        2.4 系统发生分析
    3 结果与讨论
        3.1 bHLH转录因子成员的鉴定与分类
        3.2 bHLH转录因子成员的命名
    4 本章小结
第3章 家牛与牦牛bHLH转录因子的功能分析
    1 材料
        1.1 家牛和牦牛bHLH转录因子序列
        1.2 生物信息工具
    2 方法与步骤
        2.1 KOBAS对家牛与牦牛bHLH转录因子的分析
        2.2 DAVID对家牛与牦牛bHLH转录因子的分析
        2.3 STRING对家牛与牦牛bHLH转录因子的分析
    3 结果与分析
        3.1 KOBAS对家牛bHLH转录因子的分析
        3.2 KOBAS对牦牛bHLH转录因子的分析
        3.3 DAVID对家牛bHLH转录因子的分析
        3.4 DAVID对牦牛bHLH转录因子的分析
        3.5 STRING对家牛bHLH转录因子的分析
    4 本章小结
第4章 结论和展望
    1 结论
    2 展望
参考文献
附录
后记
在校期间公开发表论文及著作情况


【参考文献】：
期刊论文
[1]植物bHLH转录因子研究进展[J]. 刘文文,李文学.  生物技术进展. 2013(01)
[2]动物bHLH转录因子家族成员及其功能[J]. 王勇,姚勤,陈克平.  遗传. 2010(04)



本文编号：3595121