火地塘林区昆虫和杆状病毒多样性调查

发布时间：2017-05-16 11:27

  本文关键词：火地塘林区昆虫和杆状病毒多样性调查，，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：本文以火地塘地区不同海拔的昆虫种类和土壤杆状病毒种类为研究对象,采用SDS-酚氯仿法提取土壤总DNA,第一次应用PCR-DGGE技术对火地塘地区三个海拔土壤样本的杆状病毒多样性进行研究,分析了不同样品间杆状病毒群落多样性的异同,了解3个海拔杆状病毒多样性,并分析昆虫种类与杆状病毒种类相关性,取得的主要结果如下:1、对火地塘地区高(2344m)、中(1533m)、低(1043m)三个海拔昆虫种类进行调查,中海拔地区(37.6种)低海拔地区(36.2种)高海拔地区(28.7种)。2、高海拔地区土壤样品总共检测杆状病毒种类23种,平均为17.5种,香农-威纳多指数平均数为2.4444,均匀度均数为0.8586;通过比较群落相似度,最高的为QH5与QH7为93.6%,QH2与QH6相似度最低为27.9%,两两样品相比结果相似度超过60%占总数的41.8%。3、中海拔地区土壤样品总共检测杆状病毒种类30种,平均为19.889种,香农-威纳多指数平均数为2.376,均匀度均数为0.797;通过比较群落相似度,QM3与QM4的相似度最高为82%,QM7与QM9相似度最低为49.8%,两两样品相比结果相似度超过60%占总数的95.6%,相似度极高。4、低海拔地区土壤样品总共检测杆状病毒种类29种,平均为20.8种,香农-威纳多指数平均数为2.6329,均匀度均数为0.8704;比较群落相似度,QL2样点与其他相比均偏低,两两样品相比结果相似度超过60%占总数的80%,相似度较高。
【关键词】：昆虫种类 PCR-DGGE 杆状病毒
【学位授予单位】：西北农林科技大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：Q968;S476.13
【目录】：

• 摘要5-6
• 英文摘要6-9
• 第一章 文献综述9-17
• 1.1 秦岭火地塘昆虫物种多样性简介9
• 1.2 土壤微生物种类9-10
• 1.2.1 细菌9
• 1.2.2 真菌9-10
• 1.2.3 放线菌10
• 1.2.4 杆状病毒10
• 1.3 土壤微生物多样性研究方法10-13
• 1.3.1 传统的微生物培养法10-11
• 1.3.2 生物标记法11
• 1.3.3 群落水平生理学指纹（CLPP）或单一碳源利用模式法（SSCU）11-12
• 1.3.4 原位杂交技术（ISH）12
• 1.3.5 基因芯片技术12
• 1.3.6 DNA长度多态性图谱分析12-13
• 1.3.7 DNA单链构象多态性图谱分析（SSCP）13
• 1.4 变性梯度凝胶电泳（DGGE）13-15
• 1.4.1 变性梯度凝胶电泳概述13-14
• 1.4.2 PCR-DGGE技术的优点14-15
• 1.4.3 PCR-DGGE技术的缺点15
• 1.5 研究内容与技术路线15-17
• 1.5.1 研究内容及意义15-16
• 1.5.2 技术路线16-17
• 第二章 材料与方法17-24
• 2.1 实验材料17
• 2.1.1 昆虫种类调查17
• 2.1.2 土壤的采集及保存17
• 2.1.2.1 采样点选取17
• 2.1.2.2 采样17
• 2.2 试剂和仪器17-20
• 2.2.1 实验仪器17-18
• 2.2.2 主要试剂和溶液18-20
• 2.2.2.1 主要试剂18-19
• 2.2.2.2 主要溶液19-20
• 2.3 实验方法20-24
• 2.3.1 土壤总DNA的提取（姚晓华 2005）20
• 2.3.2 引物设计20
• 2.3.3 PCR扩增20-21
• 2.3.4 目的基因片段的纯化21
• 2.3.5 变性凝胶梯度电泳（DGGE）及染色21-22
• 2.3.6 DGGE条带切胶回收22
• 2.3.7 多样性的研究方法22-24
• 第三章 结果与分析24-36
• 3.1 昆虫种类调查结果24
• 3.2 土壤DNA提取结果24-25
• 3.3 特异性引物的PCR扩增25
• 3.4 DGGE电泳25-35
• 3.4.1 高海拔地区25-28
• 3.4.1.1 DGGE电泳结果与图谱分析25-27
• 3.4.1.2 DGGE图谱的多样性分析27-28
• 3.4.1.3 丰度（S）、香农-威纳多指数（H）、均匀度（Eh）28
• 3.4.2 中海拔地区28-31
• 3.4.2.1 DGGE电泳结果与图谱分析28-30
• 3.4.2.2 DGGE图谱的多样性分析30-31
• 3.4.2.3 丰度（S）、香农-威纳多指数（H）、均匀度（Eh）31
• 3.4.3 低海拔地区31-34
• 3.4.3.1 DGGE电泳结果与图谱分析31-33
• 3.4.3.2 DGGE图谱的多样性分析33-34
• 3.4.3.3 丰度（S）、香农-威纳多指数（H）、均匀度（Eh）34
• 3.4.4 DGGE条带的PCR检测34-35
• 3.5 昆虫种类数与杆状病毒种类数的相关性分析35-36
• 第四章 结论36-37
• 第五章 讨论37-38
• 参考文献38-42
• 致谢42-43
• 作者简介43

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前2条

1 宋培勇;马莉莉;王庆容;李黛;魏志琴;;宏基因组技术及其应用研究进展[J];贵州农业科学;2009年10期

2 陈桐生;李建军;岑英华;孙国萍;;DG-DGGE分析除臭生物滤池微生物多样性[J];应用与环境生物学报;2006年01期

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1 接伟光;黄檗（Phellodendron amurense）丛枝菌根真菌鉴定及菌群结构分析[D];黑龙江大学;2008年

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本文编号：370741