基于高通量测序方法研究腌制麻竹笋发酵过程中细菌群落的动态演替

发布时间：2024-04-22 03:53

　　采用高通量测序方法对盐质量浓度为5 g/100mL和15 g/100mL的腌制麻竹笋自然发酵过程中的细菌群落的动态演替进行研究。结果表明,2种盐浓度样本均以厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和蓝藻细菌门(Cyanobacteria)为主要优势菌门(平均相对丰度> 1%)。发酵前28 d两种盐浓度样本中细菌群落丰富度差异较小,低盐质量浓度(5 g/100mL)样本中的优势菌属有乳酸杆菌属(Lactobacillus)、乳球菌属(Lactococcus)、魏斯氏菌属(Weissella)和蓝藻细菌属(Cyanobacteria_norank),高盐质量浓度(15 g/100mL)样本则以乳酸杆菌属、气球菌属(Aerococcus)、蓝藻细菌属和海细菌属(Marinobacterium)为优势菌属。发酵35 d时菌群丰富度均大幅提升,低盐浓度样本菌群丰富度及均匀度均显著高于高盐浓度样本,并且前者菌群结构发生较大改变,而后者菌群结构变化幅度较小。该研究结果将为腌制竹笋的品质调控提供理论依据。

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【部分图文】：

图1不同盐浓度腌制麻竹笋细菌群落的OTU维恩图

OTU与物种呈现对应关系，可通过分析OTU分布情况了解样本中微生物的多样性与存在量[13]。基于16SrRNA基因测序所获得的细菌群落OTU维恩图如图1所示，共得到2417个OTU。不同盐浓度样本中OTU分布具有较大差异。部分OTU是两种盐浓度样本所共有的(575例，23.7....

图2不同盐浓度腌制麻竹笋细菌群落α多样性分析

Chao指数反映群落丰富度，Shannon指数反映群落多样性[14]。由图2-a可知，发酵前28d不同盐浓度样本Chao指数变化趋势均不明显，集中在250左右，并且均在发酵第10天达到最低值，第35天达到最高值。具体来看，5g/100mL盐质量浓度腌制麻竹笋在第35天Cha....

图4不同盐浓度腌制麻竹笋中细菌微生物区系UPGMA聚类分析和主成分分析

图3不同盐浓度腌制麻竹笋中细菌在门水平和属水平的高通量相对丰度2.5腌制麻竹笋细菌进化分析

图3不同盐浓度腌制麻竹笋中细菌在门水平和属水平的高通量相对丰度

采用非加权组平均法(unweightedpairgroupmethodwitharithmeticmean,UPGMA)构建树状结构进行层聚类分析，树枝的长短可直观呈现不同盐浓度下麻竹笋腌制过程中群落组成的相似或差异程度。如图4-a所示，15g/100mL盐质量浓度....

本文编号：3961890