整合谱系地理学与景观遗传学揭示短花针茅遗传变异及空间分布格局形成机制
发布时间：2020-12-07 07:12
遗传多样性是生物多样性的基础,是物种长期生存、进化和适应的结果,对生物多样性保护具有重要意义。当代遗传多样性和遗传结构是历史和现代微进化过程共同作用的结果。短花针茅（Stipa breviflora）,隶属于禾本科（Poaceae）针茅族（Stipeae Dum）针茅属（Stipa L）,是一种暖温型多年生旱生丛生禾草,是我国荒漠草原的主要建群种。开展短花针茅的谱系地理学与景观遗传学研究有助于推断地史环境演变对短花针茅谱系分化的影响,阐明区域尺度下当代短花针茅群体遗传变异空间分布特征及其分化机制,揭示人类活动对短花针茅遗传多样性与遗传结构的影响。本研究利用2个叶绿体DNA（cpDNA）片段和14对EST-SSR引物分析了区域尺度下27个短花针茅群体的谱系地理结构、遗传多样性和遗传结构;利用12对EST-SSR引物分析了局地尺度下52个短花针茅群体的遗传多样性和遗传分化。通过整合谱系地理学和景观遗传学的分析方法,揭示了短花针茅遗传变异及其空间分布格局形成的机制。主要结果如下:（1）基于短花针茅转录组数据,首次开发了21对多态性EST-SSR引物,且21对引物在其他6个短花针茅的近缘种中具...
【文章来源】：内蒙古大学内蒙古自治区 211工程院校
【文章页数】：120 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１．４短花针茅中国分布图??Ｆｉｇ．?１．４?Ｔｈｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?Ｓ．?ｂｒｅｖｉｆｌｏｒａ?ｉｎ?Ｃｈｉｎａ??１４??
整合谱系地理学与景＿遗传学揭示短花针茅遗传变异及空间分布格局形成机制??１．５．５技术路线??本研宄的技术路线如图１．５所禾。??野外样品采集?｜?气象数据提取?土地利用／覆盖数据获取??／Ｉ?＿?｜??ＤＮＡ提取?一１?转录组测序?／??＾Ｉ，??叶绿体ＤＮＡ??！?Ｔ４?ＳＳＲ分子标记开发??＾—ｐ、＇?—／￣￣￣ｔ?＾??、??｛?？?单倍型?ｌ?ｉ?／?ＳＳＲ多态性?思、??Ｈ?Ｌ＿＿＾＾－－－岱」－??／！??＾??！?！?￣￣外?＼??！、??１１?单倍型多样性?丨区丨?遗传多样性?Ｉ?Ｉ?遗传多样性?丨局??１１?谱系地理结构?丨域Ｉ?遗传结构与分化?Ｉ?ｊ空间遗传结构丨地■??谱系分化时间?ｉ?Ｇ?Ｉ?ＩＢＢ、丨ＢＤ?ｖｓ．?ＩＢＥ?＊?￣［＂遗传分化?｜尺｜??Ｉ！?！度?丨丨?！度??．＼?种群动态历史?丨?（?适应机制?丨?丨ＩＢＤ、ＩＢＲｖｓ．ＩＢＥ丨?■??Ｉ、、、」?１—－…一Ｕ’??Ｌ，……Ｃ?—■）’?Ｉ???Ｙ???ｉｙ＾???ｗ??????地史环境滨变对短?区域尺度下，当代短花针?不同空间尺度下，地理
内蒙宵太竽博士学位论文?整合谱系地理学与景＿遗传学揭示短花针茅遗传变异及空间分布格局形成机制??２．２．２?定义?ＥＳＴ－ＳＳＲ??本研宄中一共查找到２９８１７个ＳＳＲｓ位点，其中￡核苷酸重复最多（１６８７５，６２．７６％），??其次是二核苷酸重复（７４８９，?２８．００％），单核苷酸重复（３０７１，１０．３０％），．六核苷酸童复（９５８，??３．５８％），五核苷酸重复（９２３，３．４５％）和四核香酸童复（５９１，２．２１％）。通过比较这些转??录组序列，共计获得．１９５４条可能包＇含多态性ＳＳＲ位：点的ｕｎｉｇｅｎｅｓ２．１）。??１８０００?－１
【参考文献】：
期刊论文
[1]裸果木种群遗传多样性及其与土壤因子的关联性研究[J]. 徐振朋,宛涛,蔡萍,张晓明,伊卫东,宛诣超. 生态环境学报. 2017(09)
[2]未来气候变化情景下中国北方农牧交错带脆弱性评估[J]. 周一敏,张昂,赵昕奕. 北京大学学报(自然科学版). 2017(06)
[3]景观破碎化对植物种群的遗传学效应及其研究方法进展[J]. 丁兆红,卢君婷,卢剑波. 杭州师范大学学报(自然科学版). 2016(05)
[4]中国针茅属植物系统发育与空间分异研究进展[J]. 彭江涛,朱宗元,梁存柱,刘钟龄. 干旱区资源与环境. 2016(09)
[5]不同恢复演替阶段大针茅与克氏针茅种群遗传多样性分析[J]. 马保连,彭江涛,牛永梅,梁存柱,刘小平. 内蒙古大学学报(自然科学版). 2016(04)
[6]云南松天然群体遗传变异与生态因子的相关性[J]. 许玉兰,蔡年辉,陈诗,王大玮,何承忠,段安安,康向阳. 生态学杂志. 2016(07)
[7]短花针茅SSR-PCR反应体系的建立及引物筛选[J]. 赵磊,党振华,赵艳宁,张颖,牛建明,任婧,周俊梅. 内蒙古大学学报(自然科学版). 2016(01)
[8]不同放牧强度下垂穗披碱草遗传多样性分析[J]. 陈钊,梁新平,侯扶江,田苗苗,张红瑞,余莹,管永卓,王成章,严学兵. 草业学报. 2015(08)
[9]北方农牧交错带界定的研究进展[J]. 袁宏霞,乌兰图雅,郝强. 内蒙古林业科技. 2014(02)
[10]生物多样性丧失机制研究进展[J]. 魏辅文,聂永刚,苗海霞,路浩,胡义波. 科学通报. 2014(06)
本文编号：2902866
【文章来源】：内蒙古大学内蒙古自治区 211工程院校
【文章页数】：120 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１．４短花针茅中国分布图??Ｆｉｇ．?１．４?Ｔｈｅ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ?ｏｆ?Ｓ．?ｂｒｅｖｉｆｌｏｒａ?ｉｎ?Ｃｈｉｎａ??１４??
整合谱系地理学与景＿遗传学揭示短花针茅遗传变异及空间分布格局形成机制??１．５．５技术路线??本研宄的技术路线如图１．５所禾。??野外样品采集?｜?气象数据提取?土地利用／覆盖数据获取??／Ｉ?＿?｜??ＤＮＡ提取?一１?转录组测序?／??＾Ｉ，??叶绿体ＤＮＡ??！?Ｔ４?ＳＳＲ分子标记开发??＾—ｐ、＇?—／￣￣￣ｔ?＾??、??｛?？?单倍型?ｌ?ｉ?／?ＳＳＲ多态性?思、??Ｈ?Ｌ＿＿＾＾－－－岱」－??／！??＾??！?！?￣￣外?＼??！、??１１?单倍型多样性?丨区丨?遗传多样性?Ｉ?Ｉ?遗传多样性?丨局??１１?谱系地理结构?丨域Ｉ?遗传结构与分化?Ｉ?ｊ空间遗传结构丨地■??谱系分化时间?ｉ?Ｇ?Ｉ?ＩＢＢ、丨ＢＤ?ｖｓ．?ＩＢＥ?＊?￣［＂遗传分化?｜尺｜??Ｉ！?！度?丨丨?！度??．＼?种群动态历史?丨?（?适应机制?丨?丨ＩＢＤ、ＩＢＲｖｓ．ＩＢＥ丨?■??Ｉ、、、」?１—－…一Ｕ’??Ｌ，……Ｃ?—■）’?Ｉ???Ｙ???ｉｙ＾???ｗ??????地史环境滨变对短?区域尺度下，当代短花针?不同空间尺度下，地理
内蒙宵太竽博士学位论文?整合谱系地理学与景＿遗传学揭示短花针茅遗传变异及空间分布格局形成机制??２．２．２?定义?ＥＳＴ－ＳＳＲ??本研宄中一共查找到２９８１７个ＳＳＲｓ位点，其中￡核苷酸重复最多（１６８７５，６２．７６％），??其次是二核苷酸重复（７４８９，?２８．００％），单核苷酸重复（３０７１，１０．３０％），．六核苷酸童复（９５８，??３．５８％），五核苷酸重复（９２３，３．４５％）和四核香酸童复（５９１，２．２１％）。通过比较这些转??录组序列，共计获得．１９５４条可能包＇含多态性ＳＳＲ位：点的ｕｎｉｇｅｎｅｓ２．１）。??１８０００?－１
【参考文献】：
期刊论文
[1]裸果木种群遗传多样性及其与土壤因子的关联性研究[J]. 徐振朋,宛涛,蔡萍,张晓明,伊卫东,宛诣超. 生态环境学报. 2017(09)
[2]未来气候变化情景下中国北方农牧交错带脆弱性评估[J]. 周一敏,张昂,赵昕奕. 北京大学学报(自然科学版). 2017(06)
[3]景观破碎化对植物种群的遗传学效应及其研究方法进展[J]. 丁兆红,卢君婷,卢剑波. 杭州师范大学学报(自然科学版). 2016(05)
[4]中国针茅属植物系统发育与空间分异研究进展[J]. 彭江涛,朱宗元,梁存柱,刘钟龄. 干旱区资源与环境. 2016(09)
[5]不同恢复演替阶段大针茅与克氏针茅种群遗传多样性分析[J]. 马保连,彭江涛,牛永梅,梁存柱,刘小平. 内蒙古大学学报(自然科学版). 2016(04)
[6]云南松天然群体遗传变异与生态因子的相关性[J]. 许玉兰,蔡年辉,陈诗,王大玮,何承忠,段安安,康向阳. 生态学杂志. 2016(07)
[7]短花针茅SSR-PCR反应体系的建立及引物筛选[J]. 赵磊,党振华,赵艳宁,张颖,牛建明,任婧,周俊梅. 内蒙古大学学报(自然科学版). 2016(01)
[8]不同放牧强度下垂穗披碱草遗传多样性分析[J]. 陈钊,梁新平,侯扶江,田苗苗,张红瑞,余莹,管永卓,王成章,严学兵. 草业学报. 2015(08)
[9]北方农牧交错带界定的研究进展[J]. 袁宏霞,乌兰图雅,郝强. 内蒙古林业科技. 2014(02)
[10]生物多样性丧失机制研究进展[J]. 魏辅文,聂永刚,苗海霞,路浩,胡义波. 科学通报. 2014(06)
本文编号：2902866
本文链接：https://www.wllwen.com/wenyilunwen/huanjingshejilunwen/2902866.html
