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阿拉善马鹿(Cervus elaphus alashanicus)种群遗传学及遗传分化驱动因素研究

发布时间:2021-01-18 22:09
  在全球范围内,由自然或人为因素造成的野生动物生境破碎化日益加剧。破碎化景观会对物种的遗传分化模式产生影响,阻碍种群的基因流动,而基因流是决定和维持遗传多样性的关键因素,对物种的适合度,特别是对珍稀濒危野生动物的生存至关重要。马鹿阿拉善亚种(Cervus elaphus alashanicus),简称阿拉善马鹿,目前仅分布于贺兰山地区,是我国所有马鹿亚种中数量最少且分布范围最狭窄的一个孤立种群,研究表明位于“大陆岛”的高山有蹄类比分布在连续景观中的种群表现出更显著的遗传分化,目前关于该亚种的遗传多样性缺乏全面分析,且种群内部的遗传分化研究尚属空白,这对该濒危亚种的可持续管理和科学保护造成严重制约。本研究于2016年的7~8月至2017年2~4月,采用样线法和实体观测法对贺兰山地区有阿拉善马鹿分布的区域进行新鲜粪便样本采集,利用母系遗传的线粒体标记和双亲遗传的微卫星标记,以及分子生物学方法对阿拉善马鹿的遗传多样性和遗传结构进行研究,评估该亚种的遗传分化现状。此外,运用分子生态学手段对阿拉善马鹿的扩散模式进行分析,并利用景观遗传学方法探寻对其基因流造成阻碍的环境变量,从物种自身和外界环境两方... 

【文章来源】:东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】:115 页

【学位级别】:博士

【部分图文】:

阿拉善马鹿(Cervus elaphus alashanicus)种群遗传学及遗传分化驱动因素研究


图2-1研宄地区示意图??Fig.?2-1?Study?area?in?Helan?Mountain?National?Nature?Reserve,?China??

序列,马鹿,控制区,线粒体


?东北林业大学博士学位论文???3.3.5基于线粒体序列的种群遗传结构分析??图3-2为线粒体控制区、Cyt?6以及二者的联合序列构建的BI树,3种标记分析得??到的系统发育树具有较为一致的拓扑结构,结果表明,不同地理群并没有形成单独的枝??系,整体上所有阿拉善马鹿的单倍型聚成1个大的遗传簇,没有表现出明显的分化。??■?SBSK?HTL.?■?SDG?■?WBSK?■?DDG?■?FJY?GG?■?HLW?■?LPS?■?KLK?■?MLK?■?XFG??0.82i-?Hap?23?■?—?Hap?8?■?15?■??〇6fT ̄Hap?16?B?〇7〇?〇9?fHap?3??〇?n?L?Hap?7??丨Up?7?■?L?Hap?2??、「Hap?24?_?u?06^lr-?Hap?18?■??Llhp?13?■?Hap?6?■■?〇97^?II?Map?7??Z?〇'76、、「丨6?■?0*2?1??.Hap?27?■?、「Hap?10?■??Map?26?■?Hap?2?■?l?Hap?9?■?_??-H*P?25?■?0?95?'?Hap?28?■??Map?22?■?N?sj-?Hap?10?■?-?Hap?27?■??A?*,,aP?21?_?B? ̄LH;in4?_?C?Hap?26?■??Hap?20?■?Hap?■???Hap?2S?■??;!ap?:?—?Hap?IS?■???M?■??HaP?18?■???Hap?23?■??,-Hap?17?■?-?Hap?14???Hap?22?■???-Hap?15?■?-?Ha

序列,单倍型,马鹿,控制区


aP?13??f?,?Hap?5??Hap?10^,?,???一_h_^P?sHap?12?MaP?6?A_t?#H?P?8?P??:3Hr??二,,J5?y?\m\?1一,丄8、"ap'丄?i丄??i…?丨丨-V?丨…4?,,apl。/??(A)?(B)?(C)??10?samples?〇?XFG???MLK?@?HLK???LPS???HLW?O?GG???FJY?@?DDCi???WBSK???SDO?O?HTL?參?SBSK??1?sample??图3-3阿拉善马鹿基于线粒体控制区(A)、Cytfc?(B)及二者的联合序列(C)构建的单倍型网络??图。圆形的面积代表单倍型的频次,饼图代表共享单倍型,黑点代表缺失的单倍型??Fig.?3-3?Haplotype?network?for?Alashan?red?deer?based?on?D-loop?(A),?Cyt?b?(B),?and?the?united?sequences??(C).?The?size?of?each?circle?represents?the?frequency?of?haplotypes,?the?pie?chart?is?shared?haplotypes,?and??small?black?dotes?represent?missing?haplotypes??遗传分化(Fst)值是评估地理群间遗传分化的指标。Wright?(1978)将Fw值分为??4个等级,当Fst小于0.05时,可认为地理群间遗传分化很弱,当介于0.05和0.15之??间时,分化水平为中等,当Fst介于0.15到0.25间时,遗传分化水平较大,

【参考文献】:
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本文编号:2985745

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