2011-2014年我国部分地区诺如病毒的分子流行病学研究

发布时间：2017-03-29 16:08

  本文关键词：2011-2014年我国部分地区诺如病毒的分子流行病学研究，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：背景诺如病毒(Noroviruses,NoVs)属于杯状病毒科(Caliciviruses)诺如病毒属(Norovirus),是引起全球人类急性胃肠炎暴发流行的重要病因之一,可感染所有年龄组。诺如病毒具有传染性强、变异快和环境中稳定的特点,常在学校、家庭、医院、军队等较封闭场所的人群中引起暴发,也是引起5岁以下婴幼儿腹泻常见的病原,仅次于轮状病毒。发达国家将轮状病毒疫苗纳入免疫规划后,诺如病毒就迅速取代轮状病毒成为引起婴幼儿腹泻的最重要病原。诺如病毒每隔几年就有新的变异株出现,引起全球诺如病毒暴发流行。据报道,诺如病毒在美国每年引起2100万人感染,其中包括190万门诊病例、40万急诊病例、7.1万人住院病例和800人死亡。美国因诺如病毒食源性暴发在医疗费用和生产力损失方面达2亿美元。在发展中国家,诺如病毒导致21.8万5岁以下儿童死亡。随着我国经济水平及病原检测能力的提高,诺如病毒暴发引起了社会和民众的高度关注。2013年1至3月,广州大学城6所学校相继发生诺如病毒疫情,发病人数652人；2014年12月,浙江嘉兴10所学校3所幼儿园发生诺如病毒暴发,发病人数511人。长期的监测研究表明诺如病毒在我国5岁以下儿童腹泻病例的阳性率为10-20%；在成人腹泻中的阳性率为20-40%。由此可见,诺如病毒肠胃炎是包括我国在内的全球性的公共卫生问题。因此,开展诺如病毒分子流行病学研究,了解诺如病毒在我国的流行规律、流行毒株特征,对我国病毒性腹泻的预防控制工作具有重要意义。目的分析2011-2014年我国部分地区5岁以下腹泻住院婴幼儿中诺如病毒的疾病负担、流行特征和分子变异规律,为我国诺如病毒胃肠炎的预防和控制提供基础数据和科学依据。方法1.收集和整理2011年1月至2014年12月四年间19个监测地区19798份5岁以下腹泻住院婴幼儿的人口资料、临床信息及检测结果,应用统计学方法分析我国诺如病毒的流行特征。2.收集2011-2014年我国部分地区1068份5岁以下腹泻住院婴幼儿诺如病毒阳性粪便样本,采用RT-PCR方法扩增诺如病毒聚合酶区基因片段,通过基因测序、序列加工、比对及系统进化分析方法确定聚合酶区诺如病毒基因型别,分析诺如病毒基因特征及流行株变异情况；3.对其中2013-2014年494份诺如病毒阳性毒株,采用RT-PCR方法扩增诺如病毒衣壳蛋白区基因片段,过基因测序、序列加工、比对及系统进化分析方法确定衣壳蛋白区诺如病毒基因型别,并利用聚合酶区和衣壳蛋白共同分析诺如病毒基因特征,确定聚合酶区和衣壳区型别不一致的诺如病毒毒株。结果1.收集2011-2014年我国5岁以下腹泻住院儿童诺如病毒全国共检测样本19798份,阳性3454份,平均检出率为17.5%,2012年度最高,为20.25%,2013年度最低,为14.48%。2011-2014年年我国5岁以下住院腹泻儿童诺如病毒阳性率最高的年龄段依次分别为9-11月(24.01%)、12-17月(24.27%)、12-17月(17.75%)和6-8月(20.28%)。2011-2014四年间第一至第四季度诺如病毒平均检出率分别为20.04%、16.62%、19.87%和15.48%,监测数据表明,2011-2014年我国腹泻住院婴幼儿诺如病毒感染全年均有发生,在2-3月和9月呈现季节高峰,9的高峰(检出率是23.3%)稍高于2-3月(22.5%和21.6%)。2011-2014年诺如病毒检出率在19个监测地区的分布有差异(卡方=542.963,P0.05),其中前三位的分别是福建、江苏和四川,检出率分别为29.71%、26.48%、23.96%,而新疆、湖南、河南这三个地区的检出率较低,分别为11.18%、10.17%、4.03%。其中沿海地区检测样本5809份,阳性样本1189份,阳性率为20.47%；内陆地区检测样本13989份,阳性样本2265份,阳性率为16.19%,沿海地区和内陆地区诺如病毒的检出率有统计学差异(卡方=52.31,P0.05)。北方地区和南方地区诺如病毒检出率存在统计学意义上的差异(卡方=30.678,P0.05),南方地区诺如病毒检出率高于北方地区,沿海南方和内陆南方诺如病毒的检出率也有统计学差异(卡方=22.600,P0.017,a校正=0.017)；沿海南方的诺如病毒检出率高于内陆南方诺如病毒检出率。2.2011-2014年共获得1068个诺如病毒毒株聚合酶区序列,GⅡ占99.3(1060/1068),GⅠ占0.7%(8/1068)。GⅡ.4型为主要检出型别,占58.9%(629/1068)；其次为GⅡ.P12型,占33.3%(356/1068)；其他型别检出率在0.1-3.4%,包括GⅡ.P1、GⅡ.P2、GⅡ.P5、GⅡ.P6、 GⅡ.P7、GⅡ.P13、GⅡ.P16、GⅡ.P17、GⅡ.P21、GⅡ.P22、GⅡ.Pe、GⅡ.Pg、GⅠ. P2、GⅠ.3、 GⅠ.4和GⅠ.6。2011-2014年GⅡ.4型进一步分为三个亚群,GⅡ.P4/DenHaag、GⅡ.P4/New orleans和GⅡ.P4/Sydney 2012。GⅡ.P4/DenHaag变异株在2011-2014年占GⅡ.4型的百分率分别为91.5%、80.4%、16.3%和1.0%；GII.P4/New Orleans变异株所占百分率为8.5%、6.3%、5%和1%;GII.P4/Sydney 2012变异株所占百分率为0、13.3%、78.7%和98%。两个主要检出的基因型GII.P4和GII.P12在不同地区分布有差别,新疆、四川、福建、山西、北京、江苏、广东和广西GII.P4所占的比例高于GII.P12,内蒙古、河北、上海和云南GII.P12的比例高于GII.P4,吉林和安徽GII.P12和GII.P4所占的比例相当。在5岁以下的腹泻住院儿童中,4岁以前的儿童GII.P4所占的比例在53%左右,在各个月龄组相差不大,但是在48-59月龄中没有发现GII.P4基因型。GIl3在5岁以下儿童月龄组中占30%但是在小于5月龄儿童中所占比例较高,在6月以上所占比例较低。3.获得2013-2014年我国部分地区诺如病毒衣壳区基因序列494个,以GⅡ.4型为主,占52.6%,其中GII.4/Sydney2012变异株、GII.4/New orleans变异株和GII.4/DenHaag变异株分别占GⅡ.4的93.5%、5.4%和1.1%。其次是GⅡ.3,占38.5%,其中GII.3-D和GII.3-E变异株分别占Ⅱ.3的8.9%和91.1%；其他型别包括GII.2、GII.5、GII.6、GII.7、GII.9、 GII.13、GII.17、GII.20、GII.21和Ⅱ.22,占0.2%-3.7%。4.获得2013-2014年间486株同时具有聚合酶区和衣壳蛋白区序列的毒株,其中型别一致的毒株共265株,占54.5%,包括GII.17(3株)、GII.21(3株)、GII.6(1株)、GII.22(1株)、GII.7(5株)、GII.4/Sydney 2012变异株(218株)、GII.4/New Orleans变异株(17株)和GII.4/DenHaag变异株(17株)；型别不一致的毒株共221个,占45.4%,主要为GII.P12/GII.3(聚合酶／衣壳区)(177株)。结论1.诺如病毒是引起我国5岁以下儿童住院腹泻的一个重要病原,2011-2014年我国5岁以下腹泻住院儿童诺如病毒检出率为17.5%(3454/19798)。2.诺如病毒主要感染2岁以内儿童,每年的2-3月和9月为病毒感染高峰期,诺如病毒检出率南方高于北方,沿海高于内陆,有统计学差异。3.我国5岁以下住院儿童诺如病毒呈基因多样性,包括4个GI和14个GII基因型,其中GII.P4型为主要流行的基因型,2012年Sydney 2012变异株取代GII.4/DenHaag变异株成为新的流行株；聚合酶区分型中GII.P12是仅次于GII.P4的主要流行株。4.聚合酶区和衣壳蛋白区系统进化分析提示诺如病毒发生重组或混合感染的比例较高。
【关键词】：病毒性腹泻 婴幼儿 诺如病毒 分子流行病学 基因型
【学位授予单位】：中国疾病预防控制中心
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R373.2
【目录】：

• 缩略词表6-7
• 中文摘要7-10
• 英文摘要10-14
• 研究背景14-16
• 材料和方法16-23
• 1 研究目的16
• 2 研究方案16-17
• 3 技术路线17-18
• 4 材料方法18-23
• 研究结果23-37
• 讨论37-40
• 结论40
• 课题的局限性40-41
• 参考文献41-45
• 附录45-60
• 1、综述45-53
• 参考文献50-53
• 2、致谢53-54
• 3、个人简历54-55
• 4、进化树55-60

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