Sdr家族成员Bbp的配体结合与结构研究

发布时间：2020-07-13 19:49

【摘要】：金黄色葡萄球菌是一种广泛存在于人体和动物体中的机会性致病菌,隶属于葡萄球菌属。引起的疾病包括毛囊炎、脓包病、心内膜炎、肺炎、脓毒性关节炎、骨髓炎、转移性感染等。金黄色葡萄球菌的致病能力取决于它的毒力因子,包括表面蛋白、细胞毒素、蛋白酶、脂肪酶、凝固酵素等。金黄色葡萄球菌通过自身的表面蛋白介导的粘附机制附着到宿主细胞,这一起始步骤被认为是感染宿主细胞的重要环节。金黄色葡萄球菌的表面粘附蛋白被称为MSCRAMMs(Microbial Surface Components Recognizing Adhesive Matrix Molecules)。Sdr家族作为MSCRAMMs中一类重要的蛋白,它们采取相似的结构组织方式。其重要特征是含有一段丝氨酸-天冬氨酸二肽(Serine-Aspartate,SD)重复区。在蛋白的N端是一段信号肽序列;紧接着是配体结合区A区域和SD重复序列;羧基端的片段包含细胞壁锚定区、跨膜区及一系列带正电荷的氨基酸残基。一些蛋白在其A区域与SD重复序列之间有2-5个不等的B结构域。研究得最多的是配体结合区A区域,它包含N1、N2和N3三个结构域。Bbp作为Sdr家族成员之一,发现于骨骼组织和牙质中。其晶体结构和配体结合机制尚未见报道。我们通过X射线晶体学的方法解析了Bbp的晶体结构及其与配体的复合物晶体结构。从Bbp晶体结构中可发现,N2和N3结构域分别采取类似于IgG折叠的方式,两个结构域之间作用比较松散;Bbp-Fgα复合物结构中,配体的结合在N2和N3结构域之间,Bbp C端发生重排,并延伸到N2结构域中。从而我们解释了配体结合的DLL模型及补充特点。通过与已报道的Sdr家族其他蛋白的晶体结构进行比对,发现它们C端的延伸都有相似性;相对保守的氨基酸在配体识别和结合上都发挥着重要作用。综上所述,我们利用结构生物学、分子生物学及生物化学等多种手段对于Bbp蛋白进行了结构解析和配体结合的机制分析,对Sdr家族中其它蛋白的研究和识别配体机制起到了补充和推动作用,同时也为研究潜在的拮抗剂和抗体提供了理论基础。
【学位授予单位】：清华大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R378.11;S852.611

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 任均田,张弛 ,林祥通;配体结合分析的某些进展[J];国外医学(放射医学分册);1985年02期

2 任均田,李振甲;配体结合分析的某些进展[J];国外医学.临床生物化学与检验学分册;1986年04期

3 宝福凯;整合素与配体结合的特征决定细胞游走速度[J];生理科学进展;1998年01期

4 刘志国,江会峰,屈伸;VLDL-受体的配体结合结构域结构分析[J];生物信息学;2003年01期

5 曹旭;林东海;;附睾特异分泌蛋白Lipocalin13的原核表达和纯化及其与配体结合特性的分析[J];药物生物技术;2010年02期

6 刘志国,屈伸,宗义强,邓耀祖,冯宗忱;VLDL-R中配体结合重复序列的结合特性及结构分析[J];华中科技大学学报(医学版);2004年05期

7 王文宁;翁经纬;张明杰;;PSD-95-PDZ12的动力学性质及其对配体结合的调节[J];生物物理学报;2009年S1期

8 张磬,叶玉珍,丁达夫;甾体激素受体功能特异性的结构基础[J];生物物理学报;2001年04期

9 李秀峰,曾衍钧,赵红,庄逢源;受体与配体结合的动力学研究进展[J];力学进展;2000年04期

10 邓诣群,朱振宇,马涧泉,薛红;A型γ-氨基丁酸受体α1亚基Cys~(166)-Leu~(296)片段的配体结合和结构性质[J];中国生物化学与分子生物学报;2002年03期

相关会议论文 前3条

1 樊迪;刘振明;金宏威;张亮仁;张礼和;;基于配体结合模式的辅酶A结合蛋白的分类方法研究[A];第十届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2009年

2 王文宁;翁经纬;张明杰;;PSD-95-PDZ12的动力学性质及其对配体结合的调节[A];第十一次中国生物物理学术大会暨第九届全国会员代表大会摘要集[C];2009年

3 陈海峰;;天然无规蛋白在配体结合下的折叠机制[A];第十一届全国计算（机）化学学术会议论文摘要集[C];2011年

相关博士学位论文 前6条

1 林昕;基于活性探针分子对代谢型γ-氨基丁酸受体激活机制的研究[D];华中科技大学;2012年

2 林昕;基于活性探针分子对代谢型γ-氨基丁酸受体激活机制的研究[D];华中科技大学;2010年

3 龚洲;非编码RNA折叠与动力学的模拟研究[D];华中科技大学;2012年

4 余长缨;Ⅰ.PPARγ与小分子以及相关受体蛋白的相互作用研究 Ⅱ. SARS冠状病毒刺突蛋白免疫片段的热力学和动力学研究[D];中国海洋大学;2004年

5 杨曦;人Fcα/μR配体结合位点研究[D];北京协和医学院;2012年

6 黄思罗;C族G蛋白偶联受体激活机制的精细研究[D];华中科技大学;2009年

相关硕士学位论文 前4条

1 张馨月;Sdr家族成员Bbp的配体结合与结构研究[D];清华大学;2015年

2 刘宝山;PDB结构中结晶水分子在蛋白质与配体结合中作用的量子计算研究[D];山东师范大学;2009年

3 张利娜;小鼠FcγRIII线性配体结合表位的鉴定[D];中国农业科学院;2009年

4 黄浩;APJ受体的生物信息学分析及药物靶点虚拟筛选[D];南华大学;2011年

本文编号：2753898