广西融水并殖吸虫种型基因差异的分子生物学研究
发布时间:2020-09-08 09:41
目的:对广西融水并殖吸虫进行分子生物学鉴定,并揭示其亲缘种之间的基因差异和遗传分化。方法:提取融水大囊、小囊肺吸虫成虫的基因组DNA,应用PCRdesn软件设计特异引物对其进行基因体外克隆并测出其rRNA ITS2的基因序列,通过GenBank的Blast程序进行基因的同源性比较,通过Primer Premier软件和PHYLIP软件的NEIGHBOR程序进行基因序列的基因差异比较和基因进化树的构建。结果:基因同源性比较结果显示,融水大囊、小囊肺吸虫成虫的ITS2基因同源性:Identities=100%(389/389),Score=748 bits;大囊肺吸虫成虫与斯氏狸殖吸虫、巨睾并殖吸虫的ITS2基因同源性分别为:Identities=100%(334/334),Score=662 bits;Identities=91%(308/336),Score=436bits;小囊肺吸虫成虫与斯氏狸殖吸虫、巨睾并殖吸虫的ITS2基因同源性分别为:Identities=99%(360/361),Score=710 bits;Identities=92%(334/363),Score=484 bits;基因序列的基因差异比较显示,大囊、小囊肺吸虫成虫与斯氏狸殖吸虫ITS2基因的碱基差异位点为0,与P.miyazakii、P.ohirai、Pharinasutai、P.kellicotti、P.mexicanus、P.siamensis、P.westermani、P.heterotremus、P.macrorchis的ITS2基因碱基差异位点分别为0、28、26、28、33、 — — 35、25、20、28;基因进化树显示,融水大囊、小囊肺吸虫成虫与斯 氏狸殖吸虫处在遗传树的同一位置,与巨罪并殖吸虫的遗传树距离 却较远。结论:根据基因同源性分类标准和比较结果,认为融水大 囊、小囊肺吸虫成虫和斯氏狸殖吸虫1*亚基因高度同源:大囊、小 ‘囊肺吸虫成虫与巨睾并殖吸虫1*SZ基因同源:根据基因序列基因差 异比较结果,认为大囊、小囊肺吸虫成虫与斯氏狸殖吸虫三者没有 明显基因差异,与巨睾并殖吸虫的基因差异明显;根据基因进化树 结果,大囊、小囊肺吸虫成虫和斯氏狸殖吸虫三者没有明显遗传分 化,与巨睾并殖吸虫的遗传分化则较明显;其它亲缘种中,宫崎并 殖吸虫与斯氏狸殖吸虫的亲缘关系最近。综合基因同源性比较结果。 基因序列基因差异比较结果和基因进化树结果,认为融水大囊肺吸 虫成虫、小囊肺吸虫成虫和斯氏狸殖吸虫为同一物种,小囊肺吸虫 成虫并非巨睾并殖吸虫。
【学位单位】:广西医科大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2002
【中图分类】:R346
本文编号:2814022
【学位单位】:广西医科大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2002
【中图分类】:R346
【参考文献】
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本文编号:2814022
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