2008～2014年中国6省市流行的人呼吸道合胞病毒B亚型G蛋白编码基因特征分析

发布时间：2021-08-29 05:13

　　人呼吸道合胞病毒（Human respiratory syncytial virus,HRSV）是引起婴幼儿下呼吸道感染的主要病原体之一。HRSV粘附蛋白（Attachment glycoprotein,G）是病毒膜表面糖蛋白,介导保护性免疫,是抗HRSV抗体和疫苗等的研究热点之一。为研究2008～2014年中国HRSV B亚型G蛋白编码基因的基因特征,于2008～2014年收集的363份HRSV阳性临床标本或病毒株中挑选89份代表株进行G蛋白编码基因全长核苷酸序列的扩增和测序,使用Sequencher 5.0进行序列的编辑,使用MEGA 5.0进行序列比对和亲缘关系进化树构建以及氨基酸变异分析。89份代表株分别挑选自中国北京、吉林、广东、河北、湖南、陕西6省市发热呼吸道感染患者鼻咽拭子或病毒分离株,基因型包括BA9、BA10、BAc、BA、CB1及SAB4,覆盖我国近年流行的优势基因型。亲缘关系分析显示,89株代表株可以分为6个分支,同一基因型G蛋白编码基因核苷酸序列荟聚为一个分支;89份代表株之间的核苷酸（氨基酸）遗传距离为0.03（0.04）,与原型株CH-18537株的核苷酸（... 

【文章来源】：病毒学报. 2019,35(02)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
材料与方法
    1核酸提取及阳性标本基因型别鉴定
    2代表株挑选及G基因的获得
    3生物信息学分析
    4数据整理及统计学分析
结果
    1标本来源及临床信息
    2亲缘关系分析
    3氨基酸变异分析
讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]2008～2014年中国8省市流行的人呼吸道合胞病毒A亚型G蛋白编码基因全长序列分析[J]. 宋金华,王慧玲,石晶,崔爱利,杨子峰,孙利伟,于德山,张蕾,张红,张燕,许文波.  病毒学报. 2017(06)



本文编号：3369979