猪带绦虫14-3-3基因家族生物信息学分析

发布时间：2024-12-01 08:10

　　 目的 14-3-3基因家族广泛存在于真核生物体内,参与重要的生命活动过程,且与多种疾病的发生密切相关,本研究旨在进一步了解猪带绦虫14-3-3蛋白家族的序列特征和分类情况。方法采用生物信息学方法对猪带绦虫全基因组的14-3-3基因进行序列分析,包括外显子和内含子组成情况及其编码氨基酸基本特性、并进行蛋白二级结构和三级结构特征、亚细胞定位与系统进化树分析。结果对猪带绦虫全基因组蛋白质数据库进行搜索,获得6个14-3-3蛋白序列。序列分析显示,所有14-3-3基因均具有典型14-3-3结构域,蛋白分子质量介于26.88×103～29.33×10～3之间,等电点范围为4.76～5.12;基因结构分析表明其中1个蛋白基因具有1个内含子,3个蛋白基因具有2个内含子,2个蛋白基因具有3个内含子;系统进化分析显示,猪带绦虫14-3-3蛋白系统进化树主要分为4个进化枝,其中第Ⅱ进化枝包含3个蛋白成员,其它3个蛋白分别位于不同的进化枝上;三级结构预测6个14-3-3蛋白具有较为相似的蛋白结构,均以二聚体的形式存在,每个单体都包含9个反向平行的α-螺旋。结论生物信息学预测猪带绦虫含有6个位于不同进化枝的1...

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【部分图文】：

图１猪带绦虫１４－３－３基因编码氨基酸序列比对Ｆｉｇ．１ＭｕｌｔｉｐｌｅａｌｉｇｎｍｅｎｔｓｏｆｔｈｅＴ．ｓｏｌｉｕｍ１４－３－３ａｍｉｎｏａｃｉｄｓｅｑｕｅｎｃｅｓ

（ｐＩ）均显酸性，为酸性蛋白特征，等电点的范围在４．７６～５．１２之间。ＴｓＭ＿００１１６２７００和ＴｓＭ＿０００７４７５００的不稳定指数（Ｉｎｓｔａｂｉｌｉｔｙｉｎｄｅｘ）＜４０，为稳定蛋白；其他４个蛋白不稳定指数均＞４０，为不稳定蛋白。５个蛋白的脂溶指数均＜１００，为亲水蛋白....

图２猪带绦虫１４－３－３家族基因结构Ｆｉｇ．２ＧｅｎｅｓｔｒｕｃｔｕｒｅｄｉａｇｒａｍｏｆｔｈｅＴ．ｓｏｌｉｕｍ１４－３－３ｇｅｎｅｆａｍｉｌｙ

性为１９．９３％。在Ｎ－端和Ｃ－端均具有较高的变异性，ＴｓＭ＿０００２６００００与其它蛋白的差异性较大，在其结构域的中间位置有１１个氨基酸的片段插入。５基因结构利用在线分析软件ＧＳＤＳ分析猪带绦虫１４－３－３基因结构，结果见图２。该基因家族均由外显子和内含子组成，符合真核生物１４....

本文编号：4013811