安徽省艾滋病重点监测人群的HCV基因型分布特征调查

发布时间：2017-10-11 08:26

  本文关键词：安徽省艾滋病重点监测人群的HCV基因型分布特征调查

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【摘要】：目的阐明安徽省艾滋病重点监测人群(DUS、MSM、FSW、STD、DRV、MPO、PRG、YST)的HCV基因型分布特征,分析并比较不同人群的HCV基因型分布是否存在差异;阐述安徽省HCV基因型在人群的性别、年龄和感染途径等社会人口学特征中的分布差异性,为分析HCV传播和流行提供科学依据。方法本研究采取横断面调查的方法,南北中共选取芜湖、安庆、宿州、阜阳、合肥五个地级市为调查点;根据全国艾滋病哨点监测方案,在2012年至2014年4月1日-6月30日期间分别采用滚雪球(DUS和MSM)、分层比例抽样和动态监测(FSW)、动态监测(STD、DRV、PRG)、网络招募(MSM)和分阶段整群抽样(YST)5种不同抽样方法对监测人群进行HCV抗体筛查。本研究芜湖市共筛查6098人,抗-HCV阳性37人,从中收集样本28份血清;安庆市共筛查4421人,抗-HCV阳性24人,从中收集样本22份血清;宿州市共筛查2216人,抗-HCV阳性18人,从中收集样本13份血清;阜阳市共筛查3784人,抗-HCV阳性48人,从中收集样本35份血清;合肥市共筛查9700人,抗-HCV阳性291人,从中收集样本265份血清。将2012-2014年全部HCV抗体阳性者共363份血清进行RT-PCR检测,提取RNA并对其扩增,扩增产物进行测序后用于基因比对及分型。所有监测人群的招募对象在进行知情同意后,进行匿名问卷调查。另外,本研究还收集合肥和滁州医院门诊及住院病例抗-HCV阳性血浆进行核酸检测,并对其基本信息进行登记。血清学检测包括HCVRNA的提取和扩增;分子生物学包括HCV核酸扩增产物测序和基因型分型。测定序列拼接使用Contig Express/Chromas Pro和Bio Edit软件;基因型判别通过运用Mega6.0的临近法与Genbank中的标准株全基因序列比对,共同构建HCV NS5B和CE2区段系统进化树。调查资料运用Epi Data 3.1建立数据库,录入数据,采用SPSS17.0软件进行统计分析,统计分析方法主要包括频数分布、正态性检验、χ2检验和方差分析。结果1.筛查艾滋病重点监测人群共26219人,抗-HCV阳性共418人,其中DUS 1770人(抗-HCV阳性286人)、FSW 4648人(抗-HCV阳性39人)、STD4866人(抗-HCV阳性32人)、MSM 2871(抗-HCV阳性21人)、DRV 813人(抗-HCV阳性2人)、MPO 3209人(抗-HCV阳性23人)、PRG 4000人(抗-HCV阳性12人)、YST 4042人(抗-HCV阳性3人),抗体阳性率分别为16.16%(DUS)、0.84%(FSW)、0.66%(STD)、0.73%(MSM)、0.25%(DRV)、0.72%(MPO)、0.30%(PRG)和0.07%(YST)。本研究从中共收集363份血清,对各类人群HCV抗体阳性标本进行核酸检测,共检出核酸阳性214份(DUS 152份、FSW 22份、STD 17份、MSM 9份、MPO 9份、PRG 4份和DRV 1份),YST未检出HCV核酸阳性。核酸检出率分别为57.36%(DUS)、70.59%(FSW)、76.19%(STD)、66.67%(MSM)、100%(DRV)、45.00%(MPO)、44.44%(PRG)和0.00%(YST)。所收集的16份抗-HCV阳性血浆,共检出核酸8份。2.研究结果显示,DUS人群中HCV单独基因型共有八种,混合基因型三种,各型所占比例分别为:3b型39.47%、3a型21.71%、1b型11.84%、6n型9.21%、6a型6.58%、6u型3.29%、2a型2.63%和1a型0.66%,混合型1b/3b型和2a/3b型均占1.32%,3a/3b型占1.35%;FSW人群中HCV基因型共有五种,所占比例分别是1b型56.52%,6a型21.74%,3a型13.04%,2a和3b亚型,均为4.35%;MSM人群中有三种HCV基因型,1b型75.00%,2a和6a亚型具有相同比例,均占12.50%;STD人群中也检出三种HCV基因型,各型所占比例分别为1b型70.59%,6a型23.53%和6n型5.88%;DRV人群中仅检出1份HCV RNA阳性标本,HCV基因型为1b亚型;MPO人群中检出两种HCV基因型,分别为1b型55.56%和2a型44.44%;PRG人群中共检出4例,1a型2例,占50.00%,3a和6a各检出1例,均占25.00%;GP人群中也检出两种HCV基因型,分别为1b型75.00%和2a型25.00%。研究中未发现4、5和7型三种基因型。3.正确HCV基因分型且性别资料明确的149份吸毒人群样本中,男性100名,以3b型为主,其次为3a型,分别占38.00%和22.00%,6型和1型也占相当大比例,分别为21.00%和15.00,混合型仅检出1份;女性49名,也以3b型为主,3a型次之,所占比例分别为44.90%和22.45%,6型和混合型所占比例较小,分别为14.29%和10.20%。丙肝患者中男性3名,女性5名,以1b型(37.5%)为主,其次是2a(62.5%)型。由于研究例数限制及监测人群的特点,仅对吸毒人群(DUS)和丙型肝炎患者(GP)的157份样本进行HCV基因型的性别特征进行汇总分析,经确切概率检验,HCV基因型在两种人群性别中的分布无统计学差异(F=9.589,P0.05)。4.吸毒人群HCV基因型在年龄上的分布特征表现为:45岁年龄组的不同HCV基因型所占的比例分别为3b型(37.21%)、3a(22.48%)、6型(20.16%)1型(13.18%)和混合型(4.65%),2a亚型所占比例最小(2.33%);≥45岁年龄组的HCV基因型所占的比例分别为,3b型(60.00%)、3a型(20.00%)、6型(10.00%)和1型(10.00%),混合基因型在该年龄组没有检出。HCV基因型在吸毒人群两个年龄组中的总体分布差异无统计学意义(χ2=6.159,P0.05);但感染3型在两年龄组中均有较高比例,混合基因型仅见于低年龄组。FSW、STD、MSM人群中小于45岁年龄组的HCV基因型分布以1b型为主(28份),其次为6型(10份);45岁及以上年龄组的HCV基因型只有1型(3份)和6型(1份),2型和3型在该年龄组中未检测出。DRV、MPO、PRG和GP人群中小于45岁年龄组的HCV基因型分布以1b型(7份)为主,2a型次之(3份),3b型在该年龄组中未检测出;45岁及以上年龄组的HCV基因型仅有1b(7份)和2a(3份)亚型,3型和6型在该年龄组中均未检测出。以上分析可以看出,1型在除吸毒人群以外的7类人群的两年龄组中均有较高比例;但6型仅在FSW、STD、MSM人群的两年龄组有较高比例,且2型和3型在高年龄组中未检测出;2a型仅在DRV、MPO、PRG和GP人群的两年龄组中有较高比例,而3型和6型在高年龄组中均未检测出。年龄(计量资料)满足正态分布,平均年龄(35.4±9.46)岁,采用单因素方差分析,差异不具有统计学意义(F=1.012,P0.05)。5.219份抗-HCV阳性人群中,68.04%有吸毒传播史,21.92%为性传播,10.05%来自其他感染途径如输血和其他不明原因的传播路径。经确切概率检验,HCV基因型在不同感染途径中的分布存在统计学差异(F=98.046,P0.01)。吸毒途径传播中HCV基因型主要为3(3a/3b)型和6(6a/6n/6u),分别占62.42%和18.79%,其次是1型(1a/1b)(12.75%),2a型占有较小比例(2.01%);经性接触传播包括FSW、MSM和STD人群,其HCV基因型分布以1型为主(64.58%),其次为6型(22.92%),2型和3型也占有一定比例,分别为4.17%和8.33%;其他感染途径包括DRV、PRG、GP和MPO三类人群,主要为输血和不明原因的传播,其HCV基因型主要以1型(63.64%)和2型(27.27%)为主,3型(4.55%)和6型(4.55%)均占较小比例。6.HCV NS5B区测出216份序列,C/E2区测出178份,两区同测出172份,165份样本两区测出分型结果一致,可以确定基因型,基因分型总体一致率为95.93%(165/172);7份两区测出分型结果不一致,混合基因型分别为1b/3b混合型2份、3a/3b混合型3份和2a/3b混合型2份。结论安徽省艾滋病重点监测人群中流行的HCV单独基因亚型有1a、1b、2a、3a、3b、6a、6n和6u共8种,目前尚未见安徽省对1a型、3型、6型及混合型的文献报道;本研究未发现4、5和7型三种基因型。不同人群中基因型分布具有明显差异,DUS人群中主要流行的HCV基因型为3b型;性接触人群(FSW、MSM、STD)中主要流行的基因型为1b型和6型(6a、6n和6u),其他人群(MPO、GP和DRV)中基因型分布主要为1b和2a亚型。HCV基因型的不同人群的性别无明显差异,但其年龄差异较明显,且不同感染途径的基因型分布具有显著差异。
【关键词】：肝炎病毒 丙肝 高危人群 一般人群 基因型 基因分型
【学位授予单位】：安徽医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R512.91
【目录】：

• 中英文缩略词表6-7
• 中文摘要7-11
• 英文摘要11-17
• 1 前言17-23
• 2 研究目的、对象和方法23-37
• 2.1 研究目的23
• 2.2 研究对象23-27
• 2.3 研究内容27
• 2.4 研究方法与步骤27-31
• 2.5 基因分型及构建进化树31-34
• 2.6 数据录入及分析34-35
• 2.7 质量控制35-36
• 2.8 技术路线图36-37
• 3 研究结果37-50
• 3.1 艾滋病重点监测人群检测概况37-38
• 3.2 不同人群HCV基因型分布的流行病学特征38-48
• 3.3 HCV NS5B区与C/E2区基因分型结果比较48-50
• 4 讨论50-54
• 5 结论54-55
• 参考文献55-62
• 附录62-63
• 致谢63-65
• 文献综述65-78
• 参考文献71-78
• 附件178-103
• 附件2103

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前5条

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本文编号：1011507