宏基因组二代测序技术在鉴别结核性脑膜炎病原体中的应用

发布时间：2020-07-05 14:36

【摘要】：研究背景宏基因组二代测序(Metagenomic next generation sequencing,mNGS)是对样本中的总DNA或RNA进行测序后再通过生物信息分析软件全面鉴定细菌、病毒、真菌、寄生虫等病原体,它提供的是一种无偏的分析方法,理论上可识别所有序列已知的病原体。2014年Wilson等报道了 mNGS检测用于诊断严重联合免疫缺陷症患者钩体病的案例,正式开启了 mNGS检测临床应用的大门。2015年Perlejewski等及2016年Guan等报道了 mNGS检测在诊断中枢神经系统病毒感染中的应用。2016年Yao等报道了 mNGS检测在诊断李斯特杆菌性脑膜脑炎的应用。2018年He等报道了 mNGS检测用于诊断免疫功能低下患者的创伤弧菌感染。此外,2017年Salzberg等在一项招募了 11名可疑中枢神经系统(Central nervous system,CNS)感染患者的小型队列研究中,脑组织和脊髓的活检也成功地应用到了 mNGS技术。2018年,一项对99例小儿细菌性脑膜炎患者脑脊液mNGS结果的回顾性分析,发现有10种不同的细菌病原体。同年,一项针对511个来自感染性疾病患者的样本的大型前瞻性研究表明,mNGS技术对病原体的敏感性高于病原体培养,且其结果受抗生素使用影响较小。2018年Fan等报道了 mNGS在神经型布鲁氏菌病及神经型囊尾蚴病诊断中的应用。2018年Ai等将肝组织和外周血样本同时进行mNGS检测,最后诊断了局部肝结核。研究方法mNGS技术在临床上应用广泛,越来越多的病例报道证明了其在感染性疾病诊断中所发挥的重要作用,但其在结核性脑膜炎(Tuberculous meningitis,TBM)诊断中的应用尚不清楚。目前临床上用于诊断TBM的方法有:脑脊液细菌培养、抗酸染色、PCR检查、Xpert MTB/RIF法、mNGS检测等,脑脊液结核分枝杆菌培养是TBM诊断的金标准,但最快也需要两到四周才有结果。然而,mNGS检测在TBM患者诊断中的应用研究甚少。本中心自2015到2018年共送检130例脑脊液mNGS检测标本,其中患者最终为结核性脑膜炎的共17例,因此本文回顾分析了这17例TBM患者的mNGS和常规检测方法的结果,并以细菌性脑膜炎、隐球菌性脑膜炎以及病毒性脑膜脑炎患者为mNGS阳性对照,以自身免疫性脑炎一例为mNGS阴性对照,来进行mNGS与常规检测方法敏感度、特异度等的比较。结果mNGS检测结果中显示的结核分枝杆菌复合群(Mycobacteriumtuberculosis complex,MBTC)包括结核分枝杆菌(M.tuberculosis)、非洲分枝杆菌(M.africanum)、牛分枝杆菌(M.bovis)、坎那分枝杆菌(M.canettii)。mNGS检测结果阳性病例共发现13例,其中有12例检出结核分枝杆菌复合群。结核性脑膜炎的传统检测方法包括:脑脊液结核分枝杆菌培养、抗酸染色和PCR检查。其中,结核分枝杆菌培养结果阳性1例,PCR结果阳性3例,抗酸染色阳性8例,有4个病例mNGS检测阴性而抗酸染色结果为阳性,一个患者最终诊断为TBM合并隐球菌性脑膜炎。结论mNGS 比传统检测方法更敏感,mNGS检测与抗酸染色联合应用可提高中枢神经系统感染性疾病的检出率。本研究提示mNGS检测可促进脑脊液中MTB的识别,并可作为临床疑诊TBM的常规诊断方法。
【学位授予单位】：南方医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：R529.3

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 赵忠勤;;脑脊液与血浆生化指标比值对结核性脑膜炎与化脓性脑膜炎的鉴别意义[J];中国冶金工业医学杂志;2018年06期

2 邵华;;在护理结核性脑膜炎患者时采用优质护理的效果观察[J];中国医药指南;2018年33期

3 李薇;白洪忠;李军霞;李敬;孟艺哲;陈颜强;;结核性脑膜炎合并血行播散性肺结核患者35例临床分析[J];中国医刊;2019年02期

4 汪晓凤;陈南晖;;结核性脑膜炎的诊疗进展[J];中国临床新医学;2019年06期

5 程艳;;结核性脑膜炎护理中应用细节护理的临床价值分析[J];中国医药指南;2019年20期

6 张伟芳;;探讨细节护理在结核性脑膜炎护理中的应用效果[J];中国实用医药;2019年15期

7 吕春艳;;协同护理对结核性脑膜炎患者临床效果观察[J];中国冶金工业医学杂志;2019年04期

8 张培泽;郑俊峰;付亮;李天品;袁星燎;刘厚明;邓国防;;Xpert MTB/RIF Ultra诊断结核性脑膜炎的价值[J];结核病与肺部健康杂志;2019年01期

9 杨秀兰;王玉清;李萍;姜红;;结核性脑膜炎好转期并癫痫3例护理体会[J];青海医药杂志;2017年07期

10 李磊;;结核性脑膜炎脑脊液腺苷脱氨酶检测的临床意义及应用价值[J];中国医药指南;2018年03期

相关会议论文 前10条

1 卢楠;;结核性脑膜炎患者行脑室-腹腔分流术护理及效果影响[A];中国防痨协会第32届全国学术大会暨首届中国防痨科技奖颁奖大会论文汇编[C];2018年

2 宋春香;;细节护理在结核性脑膜炎护理中的应用分析[A];中华医学会结核病学分会2019年全国结核病学术大会论文汇编[C];2019年

3 张聪;孟翠华;;一例肺结核合并结核性脑膜炎患者的护理[A];中华医学会结核病学分会2019年全国结核病学术大会论文汇编[C];2019年

4 陈叶红;;22例结核性脑膜炎的护理[A];中华医学会结核病学分会2019年全国结核病学术大会论文汇编[C];2019年

5 赵雪瑶;韩利军;;重症结核性脑膜炎临床诊治探讨[A];中华医学会结核病学分会2019年全国结核病学术大会论文汇编[C];2019年

6 张培泽;郑俊峰;付亮;李天品;袁星燎;刘厚明;邓国防;;Xpert MTB/RIF Ultra检测诊断结核性脑膜炎的价值[A];中华医学会结核病学分会2019年全国结核病学术大会论文汇编[C];2019年

7 赵跃;何俊瑛;卜晖;尹化;邹月丽;;石家庄地区结核性脑膜炎的住院资料分析[A];7th中华医学会神经病学分会全国中青年神经病学学术大会暨第十届全国神经系统感染性疾病与脑脊液细胞学学术大会论文汇编[C];2014年

8 钟代曲;;一例重症结核性脑膜炎患者的护理[A];中华医学峰会暨中华医学会神经病学分会第八届全国中青年神经病学学术会议论文汇编[C];2015年

9 邹月丽;田亚楠;钱丽花;何俊瑛;;两种新技术对结核性脑膜炎诊断的应用[A];7th中华医学会神经病学分会全国中青年神经病学学术大会暨第十届全国神经系统感染性疾病与脑脊液细胞学学术大会论文汇编[C];2014年

10 徐仿成;黄磊;王尚培;;结核性脑膜炎早期脑脊液炎症性细胞因子水平的初步研究[A];7th中华医学会神经病学分会全国中青年神经病学学术大会暨第十届全国神经系统感染性疾病与脑脊液细胞学学术大会论文汇编[C];2014年

相关重要报纸文章 前10条

1 河北省胸科医院结核三科主任 陈素丽 整理 孔令杰 何雅倩;防治结核病别入四大误区[N];保健时报;2017年

2 杭州 李凫坚;认识结核性脑膜炎[N];家庭医生报;2004年

3 晓风;腰穿放夜及鞘注新法结核性脑膜炎疗程缩短一半[N];大众卫生报;2000年

4 广西梧州市民主路44-2号诊所 周杰;“大方”治疗结核性脑膜炎一得[N];民族医药报;2003年

5 吉林省结核病医院主管护师 于英杰;结核性脑膜炎：密切观察病情变化[N];医药经济报;2010年

6 本报记者 朱晓京　胡晓震;留心疑似症状 谨防结核性脑膜炎[N];沈阳日报;2010年

7 王敏;结核性脑膜炎的诊断[N];农村医药报（汉）;2008年

8 主任医师 容小翔;结核性脑膜炎会影响小儿智力吗[N];卫生与生活报;2008年

9 东城结核病防治所;预防小儿结核性脑膜炎[N];医药养生保健报;2008年

10 张齐龙;结核性脑膜炎病人如何早发现[N];家庭医生报;2008年

相关博士学位论文 前7条

1 荆玮;异烟肼在肺结核和结核性脑膜炎患者中的群体药代动力学研究[D];北京市结核病胸部肿瘤研究所;2019年

2 孙峰;利奈唑胺治疗危重结核性脑膜炎的临床研究[D];复旦大学;2014年

3 陈沛冬;脑脊液置换加鞘注异烟肼及地塞米松在结核性脑膜炎治疗中的价值—荟萃分析[D];复旦大学;2012年

4 魏有东;结核性脑膜炎的潜在体液生物标志物研究[D];重庆医科大学;2014年

5 陈西;脑微血管内皮细胞抗结核分枝杆菌感染的分子机制及结核分枝杆菌跨越血脑屏障体外模型的初步研究[D];华中农业大学;2015年

6 邹月丽;结核性脑膜炎早期诊断的相关性研究[D];河北医科大学;2015年

7 刘菲;一.干扰素释放试验对于结核性脑膜炎的诊断价值以及诊断模型的建立 二.结核性脑膜炎差异miRNA的初步筛选[D];北京市结核病胸部肿瘤研究所;2014年

相关硕士学位论文 前10条

1 陈映丽;宏基因组二代测序技术在鉴别结核性脑膜炎病原体中的应用[D];南方医科大学;2019年

2 郭斌;Let-7b在结核性脑膜炎脑脊液外泌体中表达水平的研究[D];郑州大学;2018年

3 卜欣欣;新疆地区结核性脑膜炎的临床特点和预后因素分析[D];新疆医科大学;2018年

4 尹洋;122例结核性脑膜炎误诊漏诊临床分析[D];遵义医学院;2018年

5 杨毅;神经重症监护室中结核性脑膜炎并发消化道出血的风险因素及预后影响[D];重庆医科大学;2018年

6 冯俊;95例成人结核性脑膜炎临床分析[D];南昌大学;2018年

7 葛思慧;Xpert MTB/RIF技术在结核性脑膜炎早期诊断中的临床价值[D];山西医科大学;2018年

8 黎永艺;结核性脑膜炎评分标准的临床适用性评价及结脑预后影响因素的分析[D];广西医科大学;2017年

9 郑明明;结核性脑膜炎病情与LTA4H基因多态性、LTB4、LXA4的相关性研究[D];河北医科大学;2017年

10 李X毅;154例结核性脑膜炎患者临床特征及预后影响因素研究[D];重庆医科大学;2017年

本文编号：2742734