【摘要】：目的(1)了解广西部分地区接受高效抗逆转录病毒治疗(HARRT)HIV-1双阳家庭病毒基因亚型分布特征和耐药情况,为了解广西HIV-1毒株传播规律和流行趋势提供依据;同时探索各亚型与HIV-1耐药发生的关系,为更好地开展抗病毒治疗提供参考依据。(2)了解广西部分地区HIV-1双阳家庭病毒不同基因亚型间的细胞嗜性情况,探讨病毒细胞嗜性与疾病感染进程的关系。方法收集2014-2015年在广西南宁市、柳州市、桂林市、贺州市、钦州市和贵港市共6个市经HIV-1确证实验室WB实验确证阳性的HIV-1双阳家庭感染者/患者血样。共收集77例HIV-1 pol区序列用于HIV-1基因亚型和耐药分析;166例HIV-1 env区序列用于HIV-1基因亚型细胞嗜性分析。采用自建基因型耐药检测方法(In-house)和巢式聚合酶链式反应(RT-PCR)方法分别扩增HIV-1 pol区和env区基因序列片段,将扩增产物送至上海生工生物工程有限公司进行测序,测序结果用Sequencher5.2.4软件进行序列拼接和处理,Bio Edit 7.0软件对序列进行比对、剪切以及翻译V3环序列氨基酸,分析顶端四肽类型,使用MEGA5.0软件构建系统进化树;将pol区序列提交美国斯坦福大学的HIV耐药数据库(https://hivdb.stanford.edu)进行耐药突变分析;使用Geno2pheno(coreceptor)2.5在线工具预测使用辅助受体情况,根据V3环氨基酸序列与HXB2参考株序列进行比对,预测相应的毒株使用辅助受体情况。结果(1)77例HIV-1 pol序列中,南宁市26例,柳州市16例,桂林市11例,贺州市8例,钦州市7例,贵港市9例;患者年龄为25-73岁。55.84%的病例是通过家庭外异性传播感染的,32.47%的病例是通过自己的配偶感染上的,其中有9例(11.69%)是通过注射毒品感染的。发现3种基因亚型,分别是CRF01-AE(89.61%)、CRF07-BC(7.79%)和CRF08-BC(2.60%)。共有8例样本出现耐药突变,耐药突变发生率为10.39%,其中1例针对蛋白酶抑制剂(PIs),5例针对非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs),2例出现对核苷类逆转录酶抑制剂(NRTIs)和非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)双重耐药。(2)166例HIV-1 env序列中,发现6种亚型毒株,CRF01-AE 146例,CRF07-BC 9例,CRF08-BC 6例,B亚型1例,C亚型2例,2例非流行重组体(URF)0107亚型。发现4种V3环顶端四肽类型,以GPGQ(75.90%)为主,其余分别为GPGR(10.27%),GPGK(2.1%),GPGH(1.4%)。61.64%的毒株被预测为使用CCR5作为辅助受体,38.36%毒株被预测为使用CXCR4作为辅助受体。结论(1)广西部分地区HIV-1双阳家庭病毒基因亚型以CRF01-AE为主要流行株,主要存在异性性传播人群中;其次是CRF07-BC型毒株,主流行在静脉吸毒人群中。(2)广西部分地区抗病毒治疗的HIV-1双阳家庭病毒耐药发生率耐属于中度流行(3)HIV-1双阳家庭病毒存在对NRTIs和NNRTIs类药物双重耐药情况,应加大对正在治疗HIV/AIDS病例耐药株流行的监测和检测。(4)广西部分地区HIV-1双阳家庭病毒env基因V3环顶端四肽以GPGQ为主,CRF01-AE、CRF07-BC和CRF08-BC 3种重组毒株的顶端四肽均以GPGQ为主。(5)广西部分地区HIV-1双阳家庭病毒主要表现为巨噬细胞嗜性的非合胞体诱导型,该人群X4嗜性毒株相对其他HIV/AIDS人群占比更高,应当引起关注。
【学位授予单位】：广西医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R512.91
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