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新疆维吾尔族人群白介素23受体基因单核苷酸多态性和拷贝数变异与肺结核易感性的相关性研究

发布时间:2020-10-28 09:53
   目的:探讨白细胞介素(IL)-23受体基因单核苷酸多态性和拷贝数变异与新疆维吾尔族人群肺结核和耐药肺结核易感性的相关性。方法:采用配对病例对照的研究方法,以2013年10月至2014年4月新疆喀什地区肺科医院收治的250例新疆维吾尔族痰结核分枝杆菌培养阳性的肺结核患者(病例组)和同期250名健康体检者(对照组)为研究对象,采用SNaPshot技术检测IL-23受体基因全部外显子及部分邻近内含子区的13个单核苷酸多态性位点的基因型,同时采用Taqman实时PCR检测IL-23受体基因第11外显子区的基因拷贝数,分析其基因型、等位基因、单体型和拷贝数变异与肺结核和耐药肺结核易感性的关系。结果:IL-23受体基因的rs10889677和rs7518660与新疆维吾尔族人群肺结核的易感性相关(OR=1.53,95%CI 1.01-2.31;OR=6.25,95%CI 3.85-10.00),rs11465802与耐药肺结核的发生相关(OR=2.90,95%CI 1.69~4.98);其第11外显子区的拷贝数增加与肺结核易感性相关(χ2=10.475,P=0.0012,OR=2.611,95%CI:1.437~4.744);且在对照组中基于单倍体水平IL-23R的CNV与rs10889677和rs7518660之间的LD关系进行分析,研究结果显示,其r2均0.01,表明CNV与这两个SNPs之间仅存在非常弱的LD。结论:IL-23受体基因的rs10889677和rs7518660可能是新疆维吾尔族人群肺结核发生的危险因素,rs11465802可能是耐药肺结核发生的危险因素;IL-23受体基因第11外显子的拷贝数增加可能是肺结核发生的独立的危险因素。本研究结果为活动性肺结核高危人群的识别提供了参考资料,对研究IL-23受体基因拷贝数变异在复杂疾病和IL-23受体基因相关性疾病中的作用具有重要的指导价值。
【学位单位】:新疆医科大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2015
【中图分类】:R521
【部分图文】:

柱状图,病例,柱状图,对照组


采用内参RnaseP的Ct值标化IL23R基因的Ct值,W计算每个标本的Act值烟??6)。病例组与对照组之间的Act值具有显著性差异(尸=0.0002),表明两组之间正-23民??基因的拷贝数(中位数)具有显著性差异(图7)。两组么间的比-23民的各种拷贝数??(1-4拷贝)分布频率比较也显示两姐之间的拷贝数分布具有显著性差异(户=0.001,??图7;於0.01,表8)。研究结果湿示,病例姐中心23民基因的拷贝数变异(CNV)的??分布频率明显高于对照组<0.0001,表9)。进一步分析显示,病例组中正-23民基??因的拷巧数增加的分布频率明显高于对照组(AC泛-1,P=0.0012,表10)。??研究结果表明,位于比-23民基因外显子11的拷贝数变异(CNV)是肺结核发生的??危险因素(戶<0.0001,饼??95%C/2.875(1.655-4.994)隶9),具有该位点CNV的个体??发生肺结核的风险是拷贝正常的个体的2.的5倍。进一步分析显示,位于正-23民基??因外最子11的拷巧数増加是肺结核发生的危险因素(f=〇.〇〇12.??2.611(1.437-4.744)

柱状图,病例,柱状图,对照组


采用内参RnaseP的Ct值标化IL23R基因的Ct值,W计算每个标本的Act值烟??6)。病例组与对照组之间的Act值具有显著性差异(尸=0.0002),表明两组之间正-23民??基因的拷贝数(中位数)具有显著性差异(图7)。两组么间的比-23民的各种拷贝数??(1-4拷贝)分布频率比较也显示两姐之间的拷贝数分布具有显著性差异(户=0.001,??图7;於0.01,表8)。研究结果湿示,病例姐中心23民基因的拷贝数变异(CNV)的??分布频率明显高于对照组<0.0001,表9)。进一步分析显示,病例组中正-23民基??因的拷巧数增加的分布频率明显高于对照组(AC泛-1,P=0.0012,表10)。??研究结果表明,位于比-23民基因外显子11的拷贝数变异(CNV)是肺结核发生的??危险因素(戶<0.0001,饼??95%C/2.875(1.655-4.994)隶9),具有该位点CNV的个体??发生肺结核的风险是拷贝正常的个体的2.的5倍。进一步分析显示,位于正-23民基??因外最子11的拷巧数増加是肺结核发生的危险因素(f=〇.〇〇12.??2.611(1.437-4.744)
【参考文献】

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本文编号:2859931

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