福建省2015～2018年风疹病毒分子流行病学特征
发布时间：2021-01-17 07:15
风疹病毒（Rubella virus,RV）的分子流行病学监测是控制和消除风疹的重要途径。为了解福建省2015～2018年流行RV的变异特征,并探讨其流行规律,本研究收集2015～2018年福建省风疹病例咽拭子标本并开展病毒分离,采用RT-PCR方法扩增RV的E1基因739个核苷酸片段并进行序列测定,随后与WHO的13个基因型的32条RV参考株序列比对进行基因型别鉴定,并与GenBank数据库中2010年以来国内外流行1E和2B基因型RV代表株进行比对分析。最终从2015～2018年279例风疹病例中共分离获得113株RV毒株,基因型别鉴定结果显示,25株为2B基因型,88株为1E基因型,后者均来自2018年。2B基因型RV存在4个进化分支（Cluster 1～4）,福建省2B基因型RV毒株均属于Cluster1分支,与国内多数省份流行情况一致。1E基因型RV存在6个进化分支（Lineage 0～5）,福建省1E基因型RV毒株属于Lineage 5b分支,不同于我国2018年之前流行的1E基因型RV毒株（Lineage1）,两者之间的核苷酸和氨基酸遗传距离分别是0.035～0.050和...
【文章来源】：病毒学报. 2020,36(06)北大核心
【文章页数】：10 页
【部分图文】：
2015～2018年福建省风疹病毒（RV）与WHO各基因型参考株构建的基因亲缘性关系树
1E基因型RV在24个国家流行过，但Rivailler P等[8]发现，1E基因型RV分布区域具有地区特征，全球1E基因型RV可分成5个分支（Lineage 0～4），其中Lineage 0和Lineage 1主要在中国大陆，为中国所特有，这与朱贞等[9]提出的Cluster A和Cluster B相一致。Lineage 2分支分布在东亚国家，Lineage3分支主要在突尼斯发现，Lineage 4分支分布在东非和西亚等国。2018年福建株同上述分支代表株构建系统进化树，发现福建株同中国香港和日本RV共同位于独立的一个拓扑结构Lineage 5分支上，其中福建株位于Lineage 5b分支。福建株同以往中国本土流行的1E基因型RV相差较大，核苷酸遗传距离在0.035～0.050，提示外来输入的可能性大。日本在2012～2018年有散在分布Lineage 5a分支RV，并且从2018年起在日本境内出现风疹大流行[16]，同年分离的日本病毒株同福建株共位于Lineage 5b分支，高度同源，提示2018年福建省1E基因型RV由日本输入的可能性较大。RV的E1蛋白基因全长1 484bp，编码481aa，组成胞外区（aa1～452），跨膜螺旋区（aa453～468）和胞内区（aa469～481）。从晶体结构来看，E1蛋白属于典型的II类融合蛋白，由三个蛋白结构域（Domain I～III）组成三聚体结构[17]。从蛋白功能来看，aa81～109属于融合肽，介导病毒与宿主细胞的融合[18]；蛋白上存在多个病毒抗原决定簇（aa221～239、aa234～252、aa254～285、aa280～287、aa385～393、aa412～419)[19‐21]，介导细胞和体液免疫反应；并且存在多个血凝结合位点（aa214～240、aa245～285)[22]。WHO推荐的E1基因739个核苷酸片段可推导246个氨基酸，位于E1蛋白的aa159～404。与中国疫苗株BRDII相比，福建株中有一株出现D241→N241，其余RV在上述重要氨基酸位点均未改变。由于aa241位于抗原决定簇上，D241N是否会影响机体抗原抗体反应，尚待研究。不论何种基因型，福建株在A333位点发生突变频次最高，2B基因型呈现A333→V333（同标准株Anhui.CHN‐0.00‐2‐2B一致），1E基因型呈现A333→T333。A333位于E1蛋白Domain I和Domain III连接结构上，A333T使得疏水性的丙氨酸被亲水性的苏氨酸替代，可能会导致其连接结构的改变，从而影响E1蛋白结构及功能。
【参考文献】：
期刊论文
[1]福建省实施风疹疫苗免疫规划前后风疹流行特征变化[J]. 陈致飞,周勇,杨秀惠,陈俊磊,李东,张苏晗,潘伟毅. 中国疫苗和免疫. 2019(01)
[2]2017年福建省1起2B基因型风疹暴发的病原学分析[J]. 陈致飞,李东,陈丹红,张苏晗,郑凝旋,潘伟毅,周勇,杨秀惠. 中国疫苗和免疫. 2018(06)
[3]中国大陆流行的风疹病毒的变异变迁规律研究[J]. 朱贞,蔡茹,崔爱利,张燕,毛乃颖,许松涛,姬奕昕,王慧玲,张盛,许文波,吴宏伟. 病毒学报. 2017(01)
[4]北京市2015年风疹病毒发现2B基因型流行株[J]. 于霞丽,陈萌. 中华微生物学和免疫学杂志. 2016 (03)
本文编号：2982430
【文章来源】：病毒学报. 2020,36(06)北大核心
【文章页数】：10 页
【部分图文】：
2015～2018年福建省风疹病毒（RV）与WHO各基因型参考株构建的基因亲缘性关系树
1E基因型RV在24个国家流行过，但Rivailler P等[8]发现，1E基因型RV分布区域具有地区特征，全球1E基因型RV可分成5个分支（Lineage 0～4），其中Lineage 0和Lineage 1主要在中国大陆，为中国所特有，这与朱贞等[9]提出的Cluster A和Cluster B相一致。Lineage 2分支分布在东亚国家，Lineage3分支主要在突尼斯发现，Lineage 4分支分布在东非和西亚等国。2018年福建株同上述分支代表株构建系统进化树，发现福建株同中国香港和日本RV共同位于独立的一个拓扑结构Lineage 5分支上，其中福建株位于Lineage 5b分支。福建株同以往中国本土流行的1E基因型RV相差较大，核苷酸遗传距离在0.035～0.050，提示外来输入的可能性大。日本在2012～2018年有散在分布Lineage 5a分支RV，并且从2018年起在日本境内出现风疹大流行[16]，同年分离的日本病毒株同福建株共位于Lineage 5b分支，高度同源，提示2018年福建省1E基因型RV由日本输入的可能性较大。RV的E1蛋白基因全长1 484bp，编码481aa，组成胞外区（aa1～452），跨膜螺旋区（aa453～468）和胞内区（aa469～481）。从晶体结构来看，E1蛋白属于典型的II类融合蛋白，由三个蛋白结构域（Domain I～III）组成三聚体结构[17]。从蛋白功能来看，aa81～109属于融合肽，介导病毒与宿主细胞的融合[18]；蛋白上存在多个病毒抗原决定簇（aa221～239、aa234～252、aa254～285、aa280～287、aa385～393、aa412～419)[19‐21]，介导细胞和体液免疫反应；并且存在多个血凝结合位点（aa214～240、aa245～285)[22]。WHO推荐的E1基因739个核苷酸片段可推导246个氨基酸，位于E1蛋白的aa159～404。与中国疫苗株BRDII相比，福建株中有一株出现D241→N241，其余RV在上述重要氨基酸位点均未改变。由于aa241位于抗原决定簇上，D241N是否会影响机体抗原抗体反应，尚待研究。不论何种基因型，福建株在A333位点发生突变频次最高，2B基因型呈现A333→V333（同标准株Anhui.CHN‐0.00‐2‐2B一致），1E基因型呈现A333→T333。A333位于E1蛋白Domain I和Domain III连接结构上，A333T使得疏水性的丙氨酸被亲水性的苏氨酸替代，可能会导致其连接结构的改变，从而影响E1蛋白结构及功能。
【参考文献】：
期刊论文
[1]福建省实施风疹疫苗免疫规划前后风疹流行特征变化[J]. 陈致飞,周勇,杨秀惠,陈俊磊,李东,张苏晗,潘伟毅. 中国疫苗和免疫. 2019(01)
[2]2017年福建省1起2B基因型风疹暴发的病原学分析[J]. 陈致飞,李东,陈丹红,张苏晗,郑凝旋,潘伟毅,周勇,杨秀惠. 中国疫苗和免疫. 2018(06)
[3]中国大陆流行的风疹病毒的变异变迁规律研究[J]. 朱贞,蔡茹,崔爱利,张燕,毛乃颖,许松涛,姬奕昕,王慧玲,张盛,许文波,吴宏伟. 病毒学报. 2017(01)
[4]北京市2015年风疹病毒发现2B基因型流行株[J]. 于霞丽,陈萌. 中华微生物学和免疫学杂志. 2016 (03)
本文编号：2982430
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/chuanranbingxuelunwen/2982430.html
最近更新
教材专著
