安徽省诺如病毒G II.4/Sydney 2012变异株分子特征分析

发布时间：2021-02-23 15:36

　　目的了解安徽省某高校一起急性胃肠炎暴发疫情的病原体基因分型和分子特征。方法采用实时荧光定量PCR法（Real-time PCR）对6份粪便/肛拭子标本检测诺如病毒核酸,检出的阳性标本经传统RT-PCR扩增衣壳蛋白区（ORF2）部分序列、基因测序和型别鉴定,利用Clustal X 2.0和Mega 6.0软件对测定序列进行核苷酸同源性比对和构建基因进化和亲缘性关系树。结果检出4份标本诺如病毒核酸阳性,阳性率为66.67%（4/6）;基因序列比对和进化亲缘性关系显示:诺如病毒基因型为GII.4型;2毒株序列之间核苷酸同源性为100%;与2014²015年上海株、香港株核酸同源性最高,均为100%;与2012澳大利亚Sydney株（JX459908）同源性为99.6%;与上海和香港两地区毒株亲缘性关系最近,聚为独立一簇,同属GII.4/Sydney 2012分支。结论引发该起急性胃肠炎暴发的病原体为GII.4型诺如病毒,且属于GII.4 Sydney 2012变异株。 

【文章来源】：安徽预防医学杂志. 2016,22(06)

【文章页数】：4 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 标本来源
    1.2 核酸抽提和Real-time PCR检测
    1.3 RT-PCR扩增和序列测定
    1.4 序列比对和进化分析
2 结果
    2.1 Real-time PCR检测
    2.2 普通RT-PCR扩增和序列测定及提交
    2.3 ORF2区核苷酸同源性比较
    2.4 ORF2区基因进化树与亲缘性分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]一起水源性诺如病毒引起的急性胃肠炎疫情的调查分析[J]. 汪金生,孙琴,曹孟婵,李贤相,史永林,金爱武.  安徽预防医学杂志. 2016(02)
[2]安徽省诺如病毒胃肠炎暴发的分子病原学特征研究[J]. 史永林,孔翔羽,靳淼,方金才,施旭东,胡万富.  中华实验和临床病毒学杂志. 2015 (04)
[3]一起校园诺如病毒暴发疫情调查分析[J]. 夏俊瑞,吴金菊,姜凌,代金龙,张文艳.  安徽预防医学杂志. 2015(04)
[4]2011-2012年安徽省哨点医院婴幼儿病毒性腹泻分子流行病学特征[J]. 史永林,查震球,胡万富,吴家兵,王建军.  中华疾病控制杂志. 2014(06)
[5]新型GⅡ.4诺如病毒重组株感染疫情的分子流行病学研究[J]. 宋灿磊,袁佳春,曹志城,李澜,钟海明,朱建明,高霞.  中华预防医学杂志. 2013 (12)
[6]江苏省近期急性胃肠炎暴发中诺如病毒分子特征分析[J]. 付建光,艾静,靳淼,刘成,沙丹,姚萍,吴斌,祁贤,鲍昌俊,朱叶飞,汤奋扬.  中华流行病学杂志. 2013 (08)



本文编号：3047821