肺结核病血清生物学标志物的筛
发布时间:2021-03-27 09:08
第一部分基于iTRAQ2D LC-MS/MS技术筛选与鉴定肺结核病血清蛋白生物学标志物研究背景:结核病(Tuberculosis, TB)是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis, MTB)引起的一种严重危害人类健康的慢性呼吸道传染病,以肺结核病最为常见。结核分枝杆菌的致病性与细菌增殖引起的炎症反应、以及机体产生迟发型变态反应损伤相关。尽管直接观察与短程治疗(DOTS)战略的扩展及大量资金的投入,提高了治疗完成率,但疾病的诊断仍然是全球结核病控制的主要障碍,结核病仍是发病率和死亡率最高的感染性疾病之一。疾病的早期诊断和及时治疗对结核病的有效控制至关重要,是控制传染源,遏制结核病流行的最重要措施。延误诊断则导致疾病加重,增大死亡的风险,促进结核病的传播。目前临床上肺结核病的诊断方法有多种,但是鲜有改善结核病诊断的新技术,使得结核病诊断方法陈旧。机体感染结核分枝杆菌后,通过固有免疫和获得性免疫抵御病原菌,在相互作用过程中可能会引起宿主机体的病理生理改变,可以通过检测这种变化,寻找肺结核病的早期诊断方法。血清具有易获得、非侵入性、对疾病的反应快速等优点,是疾病生...
【文章来源】:浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:125 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
肺结核病的发病及免疫保护机制
由RUN1,RUN2表示。iTRAQ标记样本的质谱图以依赖于信息采集(IDA)模式获得。从400-1500 M/Z扫描观察分析获得前20最强母离子而后进行MS/MS。子离子光谱的质量范围在100-2000 m/z,低质量离子的Q2过渡设置为2秒,使iTRAQ报告离子(丨13、114、115和116 m/z)的强度增强利于定量。iTRAQ报告离子峰面积的比值反映样本中肽和蛋白质的相对丰度。
理过程(23% ),刺激反应过程(15% )和代谢过程(10% )。STRING软件构建蛋白-蛋白相互作用网络图见图1.4。另外,根据蛋白差异倍数、是否有商品化试劍盒和生物信息分析,蹄选3个蛋白MMP9、S100A9和SOD3进行后续验证。MMP9蛋白在健康对照组/TB组、肺炎组/TB组和肺癌组/TB组比值分别为0.56、0.56 和 0.47; S100A9 为 0.56、0.39 和 0.61; SOD3 为 0.49、0.58 和 0.56。MMP9、S100A9和S0D3蛋白鉴定与定量的MS/MS图谱见图1.5。A Cellular component D['* \ 一 KRT7SU L I —MM \ iM\ j tumw CI \l,__ ACTBB .MoJecularfunction \广、\ — ? ^ T/7* \ ■fJllhllC ■?%?> 广、KBT?} \ I?i5w ) — 一一 M / 口I aiBolnUi Uu?d*c? ?tftvtrt flipA /\ J ?tT^BtpcTMi trtnMs ?SiooA< / \C Biological process 7pf43mbti,h>pe?l *d%mHm? Molopcal r?vilattM ^-^KHT6C? fdiuUi roupoAMt ctfiBUSiioB at bi<^?v? flNl --^SI<i6dA^ ? \?t?Jbli*BimolkKalujiue tMk ^^S003 \? kukiMivsM ptotms 004■>n?liKdWai eipsiatl piocat‘rcqmn* 1? HinBlvt图1.4差异蛋白的生物信息学分析。Fig. 1.4 Bio informatics analysis of the differentially expressed proteins. (A)Cellular component. (B) Molecular function. (C) Biological process. (D) The networkof proteins was analyzed by String software.
【参考文献】:
期刊论文
[1]Ficolins and infectious diseases[J]. Yushan Ren,Quanquan Ding,Xiaolian Zhang. Virologica Sinica. 2014(01)
[2]第四次全国结核病流行病学抽样调查报告[J]. 全国结核病流行病学抽样调查技术指导组. 中华结核和呼吸杂志. 2002(01)
本文编号:3103246
【文章来源】:浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:125 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
肺结核病的发病及免疫保护机制
由RUN1,RUN2表示。iTRAQ标记样本的质谱图以依赖于信息采集(IDA)模式获得。从400-1500 M/Z扫描观察分析获得前20最强母离子而后进行MS/MS。子离子光谱的质量范围在100-2000 m/z,低质量离子的Q2过渡设置为2秒,使iTRAQ报告离子(丨13、114、115和116 m/z)的强度增强利于定量。iTRAQ报告离子峰面积的比值反映样本中肽和蛋白质的相对丰度。
理过程(23% ),刺激反应过程(15% )和代谢过程(10% )。STRING软件构建蛋白-蛋白相互作用网络图见图1.4。另外,根据蛋白差异倍数、是否有商品化试劍盒和生物信息分析,蹄选3个蛋白MMP9、S100A9和SOD3进行后续验证。MMP9蛋白在健康对照组/TB组、肺炎组/TB组和肺癌组/TB组比值分别为0.56、0.56 和 0.47; S100A9 为 0.56、0.39 和 0.61; SOD3 为 0.49、0.58 和 0.56。MMP9、S100A9和S0D3蛋白鉴定与定量的MS/MS图谱见图1.5。A Cellular component D['* \ 一 KRT7SU L I —MM \ iM\ j tumw CI \l,__ ACTBB .MoJecularfunction \广、\ — ? ^ T/7* \ ■fJllhllC ■?%?> 广、KBT?} \ I?i5w ) — 一一 M / 口I aiBolnUi Uu?d*c? ?tftvtrt flipA /\ J ?tT^BtpcTMi trtnMs ?SiooA< / \C Biological process 7pf43mbti,h>pe?l *d%mHm? Molopcal r?vilattM ^-^KHT6C? fdiuUi roupoAMt ctfiBUSiioB at bi<^?v? flNl --^SI<i6dA^ ? \?t?Jbli*BimolkKalujiue tMk ^^S003 \? kukiMivsM ptotms 004■>n?liKdWai eipsiatl piocat‘rcqmn* 1? HinBlvt图1.4差异蛋白的生物信息学分析。Fig. 1.4 Bio informatics analysis of the differentially expressed proteins. (A)Cellular component. (B) Molecular function. (C) Biological process. (D) The networkof proteins was analyzed by String software.
【参考文献】:
期刊论文
[1]Ficolins and infectious diseases[J]. Yushan Ren,Quanquan Ding,Xiaolian Zhang. Virologica Sinica. 2014(01)
[2]第四次全国结核病流行病学抽样调查报告[J]. 全国结核病流行病学抽样调查技术指导组. 中华结核和呼吸杂志. 2002(01)
本文编号:3103246
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