2015-2018年广州地区急性腹泻患者粪便中病毒的检测及其分子流行病学特征

发布时间：2021-05-23 04:34

　　1.研究目的感染性腹泻（简称腹泻）是重要的公共卫生问题,病毒是引起腹泻病的主要原因,了解引起腹泻的病毒种类,认识其流行病学特征,对预防控制腹泻病有重要的科学意义。2.研究方法2.1研究对象、资料及标本采集以广州某综合三甲医院为监测点,收集2015年1月至2018年1月急性腹泻患者及非腹泻对照的粪便标本,同时收集人口学和临床表现资料。2.2肠道病毒检测检测的病毒的种类包括人类轮状病毒（Human Rotavirus,HRV）、人类杯状病毒（Human Calicivirus,HuCV）、人类星状病毒（Human astrovirus,AstV）、人类博卡病毒（Human bocavirus,HBoV）、人类腺病毒（Human adenoviruses,AdV）,尚存在争议的腹泻病毒包括人双埃可病毒（Human parechovirus,HPeV）、爱知病毒（Aichi virus,AiV）、Klassevirus/Salivirus（SaIV）等。2.3宏病毒组学研究用Illumina HiSeq进行高通量测序,经过质控和宿主序列过滤后,与MicroNR、MicroNT数据库进行比对,获... 

【文章来源】：南方医科大学广东省

【文章页数】：179 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
前言
第一章 2015-2018年广州地区腹泻患者常见肠道病毒的检测
    前言
    1. 实验材料和方法
        1.1 研究对象
        1.2 实验材料
        1.3 实验步骤与方法
        1.4 统计学分析
    2. 结果
        2.1 研究对象的基本情况
        2.2 HRV检测结果及其流行特点
        2.3 NOV检测结果及其流行特点
        2.4 SaV检测结果及其流行特点
        2.5 AstV检测结果及其流行特点
        2.6 HPeV检测结果及其流行特点
        2.7 HBoV检测结果及其流行特点
        2.8 AdV检测结果及其流行特点
        2.9 AiV和SaIV检测结果及其流行特点
        2.10 临床特点
    3. 讨论
    4. 本章小结
第二章 腹泻患者粪便的宏病毒组研究
    前言
    1. 实验材料和方法
        1.1 研究对象
        1.2 实验材料
        1.3 实验步骤与方法
    2. 结果
        2.1 研究对象的基本特征
        2.2 宏病毒组学测序结果概况
        2.3 物种分类学注释
        2.4 物种与功能组成分析
        2.5 样本比较分析
        2.6 Circos样本与物种的共线性关系图
        2.7 Ternary三元相图
    3. 讨论
    4. 本章小结
第三章 腹泻患者粪便的肠道细菌群落分析
    前言
    1. 实验材料和方法
        1.1 研究对象
        1.2 实验材料
        1.3 实验步骤与方法
    2. 结果
        2.1 研究对象的基本特征
        2.2 肠道病毒的检出情况
        2.3 微生物群落特征
    3. 讨论
    4. 本章小结
第四章 全文总结、主要创新点和不足
    1. 全文总结
    2. 主要创新点
    3. 研究中存在的不足
    4. 下一步研究计划
参考文献
附录 缩略语词汇表
攻读博士学位期间发表及参与发表的论文
致谢



本文编号：3202293