大湄公河次流域间日疟原虫裂殖子表面蛋白MSP1 42 和MSP7基因的遗传多样性

发布时间：2021-06-10 15:06

　　目的:明确大湄公河次流域间日疟原虫红内期候选抗原Pvmsp1₄₂和Pvmsp7基因的遗传多样性,充分了解潜在疫苗基因特点,为研发有效疟疾疫苗提供信息。方法:在征求病人同意后采取间日疟原虫镜检阳性患者指尖血制成滤纸血片晾干保存。样本按照干血斑试剂说明书提取gDNA,以提取的gDNA为模板经巢式PCR鉴定间日疟原虫阳性样本,扩增Msp3α片段并进行酶切鉴定,确保寄生虫虫株是单克隆。共得到143例样本,其中包括中国安徽45例,中缅边境50例以及泰国样本48例。采用巢式PCR扩增Pvmsp1₄₂和八个Pvmsp7基因并测序。采用MEGA7.0,DnaSP6.10.1对本研究中测序基因序列以及从GenBank中下载的其他流行区的相应基因序列进行多态性分析,中性检验以及F_ST检验;Network5.0和PHYLOVIZ 2.0软件用于单倍体型分析。MEGA7.0和在线软件iTOL用于进化树分析,STRUCTURE v2.3.4软件用于群体遗传结构分析。结果:1、Pvmsp1₄₂:中缅边境、泰国和柬埔寨三个疟疾流... 

【文章来源】：中国医科大学辽宁省

【文章页数】：62 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

Pvmsp7基因在三个地区样本的采集和扩增并测序成功的数量

不同疟疾流行区Pvmsp142基因多态性滑动窗口图

中缅边境、泰国和柬埔寨分离株Pvmsp142基因序列中性检验A：Pvmsp1基因序列Tajima’sD检验的滑动窗口分析图；B：Pvmsp1基因序列Fu&Li’sD*


本文编号：3222602