河北省鼠疫菌CRISPR基因分型及流行病学分析

发布时间：2021-06-16 18:03

　　目的对河北省鼠疫菌株进行规律聚集间隔短回文重复序列CRISPR)基因分型。方法利用聚合酶链式反应（PCR）,采用3对CRISPR引物,对河北省分离的128株鼠疫菌进行扩增,测定扩增产物核酸序列并进行分析,确定河北省菌株CRISPR基因型。结果 128株鼠疫菌在3个CRISPR位点上有8种间隔序列,包括al、a2、a3、b1、b2、c1、c2、c3,分为2个基因型。118株鼠疫菌株为Cb2型,另外10株鼠疫菌均为新基因型（命名为Cc△1型）。结论通过CRISPR分析显示河北省鼠疫菌株遗传进化比较稳定,建立了CRISPR基因库,为鼠疫菌种群遗传进化和鼠疫防控的研究提供参考。 

【文章来源】：中华卫生杀虫药械. 2020,26(04)

【文章页数】：3 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 菌株来源
    1.2 仪器设备
    1.3 试剂
    1.4 引物及实验方法
    1.5 基因测序
    1.6 数据分析
2 结果
    2.1 河北菌株的间隔序列及其阵列结果
    2.2 河北菌株CRISPR分型结果
    2.3 基于基因分型结果的流行病学分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]2017年河北长爪沙鼠疫源地鼠疫菌的生态及差异区段分型研究[J]. 杨晓燕,杜国义,刘合智,史献明,闫东,陈永明,周松,王海峰,胡乐乐.  中华卫生杀虫药械. 2019(03)
[2]云南省鼠疫耶尔森菌规律成簇间隔短回文重复序列分型[J]. 杨光璨,石丽媛,郭英,张蓉,董珊珊,崔志刚,李伟,王鹏.  中华流行病学杂志. 2014 (08)
[3]鼠疫耶尔森氏菌的进化研究:从系统发育学到系统发育基因组学[J]. 崔玉军,宋亚军,杨瑞馥.  中国科学:生命科学. 2013(01)
[4]河北省鼠疫自然疫源地内自然染疫蚤的研究[J]. 刘合智,刘满福,李玉贵.  中国媒介生物学及控制杂志. 2005(03)
[5]河北省康保鼠疫自然疫源地动物流行病学调查分析[J]. 李玉贵,孔祥骊,李振海,冯禄,吴晓明,刘焕文,董国润,王钢元,王惠孝,张彩虹.  中国媒介生物学及控制杂志. 1992(02)



本文编号：3233535