基于TP0136蛋白异质性建立一种新的苍白密螺旋体分子分型方法

发布时间：2021-08-01 19:20

　　目的基于苍白密螺旋体属（TP）TP0136蛋白的异质性,建立一种新的TP分子分型方法。方法从GenBank中查询9株梅毒苍白密螺旋体（TPA）、3株雅司苍白密螺旋体（TPE）、1株未分类的类人猿密螺旋体（FB）和1株地方密螺旋体（TEN）的TP0136开放阅读框（ORF）氨基酸序列并进行多重序列比对,得出TP0136蛋白分子分型结果。利用建立的TP0136蛋白分子分型方法,对2015年1月至2018年12月南方医科大学皮肤病医院收集的23株TPA临床分离株进行分类,并将分型结果与传统的Arp/Tpr/TP0548三基因分型方法进行比较。结果 TP0136蛋白在不同种TP株中具有高度异质性,根据TP0136氨基酸序列,TPE、FB和TEN分为Ⅰ～Ⅳ 4个亚型,TPA分为Ⅴ～Ⅹ 6个亚型,TPA临床株分为Ⅶ、Ⅸ、Ⅹ、Ⅺ 4个亚型。通过TPA传统的三基因分型方法可将23株TPA临床株分为13D/d、14D/f、14D/g、15D/f、16A/e 5型。将TP0136分型法与传统分型法相结合,可将上述临床株进一步细分为10型,其中14D/f型应用TP0136分型法可进一步分为3个亚型。结论 T... 

【文章来源】：中华皮肤科杂志. 2020,53(07)北大核心CSCD

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【参考文献】：
期刊论文
[1]梅毒螺旋体的基因分型与临床意义[J]. 刘进权,许卜方,胡文龙,王千秋.  中华微生物学和免疫学杂志. 2018 (06)
[2]三基因分型法检测梅毒螺旋体基因型别[J]. 彭锐锐,尹跃平,魏万惠,王红春,张津萍,陈祥生.  中华皮肤科杂志. 2011 (11)



本文编号：3316102