肝泡型包虫病侵及胆道患者胆汁外泌体microRNA的检测及生物信息学分析
发布时间:2021-09-05 13:00
目的检测肝泡型包虫病侵及胆道患者胆汁中外泌体microRNA(miRNA)的表达情况,探索差异miRNA对靶基因的调控机制。方法收集自2017年8月-2018年10月就诊于青海大学附属医院的12例肝泡型包虫病患者胆汁样本,观察组(有胆道受侵表现)与对照组(无胆道受侵表现)各6例。经超速离心法提取、Western Blot鉴定两组胆汁中的外泌体结构,采用Trizol法提取外泌体总RNA,再经miRNA表达谱芯片实验检测并寻找差异表达的miRNA。根据差异miRNA预测胆道侵犯靶基因,并进行通路富集分析。结果观察组与对照组比较,共有74个差异表达的miRNAs,其中9个表达上调,65个表达下调(|Fold Change|> 2)。经Pathway分析,靶基因主要富集在肿瘤发生、磷脂酰肌醇信号系统、PTEN等通路中(FDR <0.05)。经GO注释及富集分析,靶基因主要富集在基因抑制的正向调控、调控细胞分化等生物过程(FDR <0.05)。结论建立肝泡型包虫病合并胆道侵犯胆汁中外泌体差异miRNA表达谱,可作为泡型包虫病侵及胆道的生物学标志物,初步阐释了肝泡型包虫病侵及胆道...
【文章来源】:临床肝胆病杂志. 2020,36(09)北大核心
【文章页数】:5 页
【部分图文】:
Western Blot检测外泌体特异性蛋白结果
各样本信号强度分布曲线
各样本相对对数信号强度箱线图
【参考文献】:
期刊论文
[1]Exosome及其他胞外囊泡在病原微生物中的研究进展[J]. 贺平,袁东亚,吴忠道. 中国病原生物学杂志. 2017(04)
[2]原发性肝癌侵犯胆道的ERCP特征[J]. 王锦波,何振平,陈维亮. 实用医药杂志. 2004(11)
本文编号:3385395
【文章来源】:临床肝胆病杂志. 2020,36(09)北大核心
【文章页数】:5 页
【部分图文】:
Western Blot检测外泌体特异性蛋白结果
各样本信号强度分布曲线
各样本相对对数信号强度箱线图
【参考文献】:
期刊论文
[1]Exosome及其他胞外囊泡在病原微生物中的研究进展[J]. 贺平,袁东亚,吴忠道. 中国病原生物学杂志. 2017(04)
[2]原发性肝癌侵犯胆道的ERCP特征[J]. 王锦波,何振平,陈维亮. 实用医药杂志. 2004(11)
本文编号:3385395
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