肺结核病中CircRNA的表达及作用的初步研究

发布时间：2023-02-19 14:58

　　目的:本课题通过筛选肺结核病患者与对照人群全血样本之间差异表达的circRNA及mRNA并在人群中进行大样本的验证,确定相关生物标志物,并且通过结合miRNA的筛查及验证以期在分子水平解释结核感染的机制。方法:收集新疆地区肺结核患者3例及对照组3例全血标本,利用全转录组测序技术进行测序,获得circRNA表达谱及mRNA表达谱。根据P值以及FC值初步确定候选基因;收集新疆地区肺结核病患者83例,同时期收集同地区健康对照者90例,进行RT-qPCR验证;并且分析40例其他肺部疾病患者差异基因的表达量,以分析其与研究组的相关性。接着利用miRNA芯片将差异circRNA与mRNA结果进行关联,以期找到与结核感染有关的基因及通路。结果:1)全转录组测序结果显示差异表达的circRNA 835个,其中249个表达上调,586个表达下调。差异mRNA1218个,其中430个上调,788个下调;miRNA芯片筛选,其中上调的有76个,下调的miRNA有92个;2)对差异mRNA进行GO、Pathway富集分析;3)对筛选出的4个有显著差异的circRNA进行RT-qPCR验证,结果表明肺结核组中h...

【文章页数】：85 页

【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
前言
研究内容与方法
    1 研究对象
        1.1 病例组纳入和排除标准
        1.2 健康对照组纳入和排除标准
        1.3 其他肺部疾病组纳入排除标准
    2 内容与方法
        2.1 实验主要试剂
        2.2 实验主要仪器
        2.3 实验方法
        2.4 实验原理
    3 质量控制
        3.1 数据录入的质量控制
        3.2 芯片检测的质量控制
        3.3 RNA检测的质量控制
        3.4 逆转录过程的质量控制
        3.5 PCR反应的质量控制
    4 统计方法
        4.1 差异基因功能分析统计方法
        4.2 信号通路富集分析方法
        4.3 RT-qPCR数据分析方法
        4.4 ROC曲线的绘制
结果
讨论
小结
致谢
参考文献
附录
综述
    参考文献
攻读硕士学位期间发表的学术论文
导师评阅表



本文编号：3746433