志贺菌中整合子及ISCR1携带情况及其与耐药性的关系

发布时间：2017-05-27 15:03

  本文关键词：志贺菌中整合子及ISCR1携带情况及其与耐药性的关系，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：细菌性痢疾(简称菌痢)以志贺菌为病原体,从发现至今已有百余年的历史,是常见急性肠道传染病,也是我国最常见的感染性腹泻之一,居于法定传染病发病率的第3位。每年的发病患者数接近50万,发病率居37种监测感染性疾病的前几位,对公众健康造成严重威胁[1]。近年来我国经济迅猛发展,人民生活水平日益提高,菌痢的发病率呈现逐年下降趋势,但由于志贺菌型繁多易变迁,且菌型之间无交叉免疫,及耐药菌株的不断产生,使得细菌性痢疾的发生和流行仍较严重。抗生素的应用为临床中治疗细菌性痢疾带来类福音,但是随着长时间大量的使用,甚至滥用,志贺菌耐药率逐年上升,并呈现多重耐药趋势。对其耐药机制的研究发现,整合子及插入序列共同区(ISCR)作为一种可移动元件,与志贺菌属耐药率上升及多重耐药趋势的出现密切相关[2]。整合子基本结构主要由5'保守区(5'conserved segment,5'CS)、3'保守区(3'conserved segment,3'CS)和两者之间的可变区(variable region)组成。整合子5'CS包括int I、att I和Pant,分别编码整合酶、整合子重组位点和整合子可变区启动子;可变区包括不同数量和类型的基因盒,其中大部分是耐药基因盒,被称之为多种耐药基因的储存库,目前已发现有70余种[3];3’CS区则因整合子类型不同而异。目前已被分为10类,相关研究表明,1类、2类整合子与志贺菌的多重耐药现象密切相关[4]。ISCR作为一类新型的可移动遗传元件,不需要特异识别即可移动任何邻近的细菌DNA序列,它是通过和整合子序列的相互作用把基因加到系统中,从而使得整个耐药基因组件能从一个细菌的细胞转移到另一个细菌细胞当中[5]。根据其氨基酸序列以及同源性的不同,目前,ISCR家族已发现有24个成员。研究发现,肠杆菌科细菌中以ISCR1常见,并且ISCR1的下游与许多耐药基因相连,如氨基糖苷类耐药基因(arm A,rmt B)、喹诺酮类耐药基因qnr、β-内酰胺类耐药基因和氯霉素类耐药基因(cat AⅡ)等;其对目前已有的抗感染方案,尤其是对抗革兰阴性菌感染的方案造成严重威胁。研究目的:为了解天津地区志贺菌临床株1类、2类整合子及ISCR1携带情况并分析其与耐药性的关系。材料与方法:收集2009-2013年分离自天津医科大学第二医院、天津市儿童医院和天津医科大学总医院3所三级甲等医院肠道门诊就诊患者的粪便标本中志贺菌,共计159株,采用生化及血清凝集法鉴定其血清学分群,采用K-B纸片扩散法对14种临床常用抗生素进行药敏试验,分析并比较志贺菌不同血清型对不同抗菌药物的耐药率。通过PCR基因扩增技术对1、2类整合子及ISCR1在志贺菌中的分布情况、携带的耐药基因盒的种类及与耐药的相关性进行研究,分析并比较不同血清群整合酶的携带情况及其与耐药性的关系。实验结果:159株志贺菌中,宋内志贺菌106株,占66.67%,福氏志贺菌53株,占33.33%。159株志贺菌的多重耐药率为90.57%,其中,福氏志贺菌对四环素的耐药率最高88.68%,其次是链霉素81.13%、氯霉素及SMZco均为56.60%;多重耐药率75.47%。宋内志贺菌对氨苄西林的耐药率最高97.17%,其次是SMZco95.28%、四环素83.96%和庆大霉素76.42%;多重耐药率98.11%。未发现对亚胺培南耐药的菌株。1类整合子阳性118株,其中典型1类整合子23株,共有5种基因盒,分别为aad A2、aad A1、dfrⅠ、blaoxa-10及blaoxa-1;非典型1类整合子95株,基因包括int I1、aad A、blaoxa-1和IS1等;2类整合子阳性89株,其基因盒有dfr A1、satl及aad A1;1类、2类整合子同时阳性的菌株70株。未发现ISCR1阳性菌株。整合子阳性菌株中多重耐药率高于整合子阴性菌株(91.97%vs 81.81%)。实验结论:近几年来本市三所医院收集的志贺菌以宋内志贺菌和福氏志贺菌为主,且宋内志贺菌为主要流行菌株;多重耐药率达90.57%;其中,福氏志贺菌多重耐药率75.47%,宋内志贺菌多重耐药率98.11%。1、2类整合子在志贺菌中广泛存在且与其的多重耐药现象相关。本研究中未发现ISCR1阳性的志贺菌菌株。
【关键词】：志贺菌属 整合子 插入序列共同区 多重耐药 移动元件
【学位授予单位】：天津医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R446.5;R516.4
【目录】：

• 中文摘要4-6
• Abstract6-9
• 缩略语/符号说明9-10
• 前言10-14
• 研究现状、成果10-13
• 研究目的、方法13-14
• 一、志贺菌血清学鉴定及药敏特征14-25
• 1.1 对象和方法14-17
• 1.1.1 材料14-15
• 1.1.2 试验与方法15-17
• 1.2 结果17-21
• 1.2.1 志贺菌血清学鉴定17
• 1.2.2 药敏结果17-21
• 1.3 讨论21-24
• 1.4 小结24-25
• 二、志贺菌整合子、ISCR1携带情况及其与耐药性的关系25-41
• 2.1 材料与方法25-29
• 2.1.1 材料25-26
• 2.1.2 方法26-29
• 2.2 实验结果29-37
• 2.2.1 整合子检测结果29-32
• 2.2.2 整合子与志贺菌耐药和多耐药的相关性分析32-37
• 2.2.3 插入序列共同区分布情况37
• 2.3 讨论37-40
• 2.4 小结40-41
• 结论41-42
• 参考文献42-48
• 发表论文和参加科研情况说明48-49
• 综述 志贺菌耐药性与整合子及ISCR1关系的简述49-56
• 综述参考文献52-56
• 致谢56

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前3条

1 赵嘉咏;罗琦;李孟磊;黄丽莉;夏胜利;;河南省细菌性痢疾病原学特征研究[J];疾病监测;2010年12期

2 王俊;祁伟;吴瑾;王淑香;郭文学;马艳红;;天津地区志贺菌耐药性及整合子携带调查[J];天津医药;2011年05期

3 徐彩萍;张颖华;陈秀华;刘芸;丁克颖;;129株志贺菌血清分型及耐药性分析[J];职业与健康;2013年06期

  本文关键词：志贺菌中整合子及ISCR1携带情况及其与耐药性的关系，由笔耕文化传播整理发布。

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本文编号：400301