牛乳头状瘤病毒贵州株L1基因克隆及生物信息学分析

发布时间：2017-10-23 10:03

  本文关键词：牛乳头状瘤病毒贵州株L1基因克隆及生物信息学分析

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【摘要】：为分析牛乳头状瘤病毒贵州株(BPV-GZ01株)L1基因的分子特征,预测其编码蛋白的生物学功能,本试验对BPV-GZ01株L1基因进行PCR扩增、克隆及序列测定。应用生物信息学相关软件及方法对BPV-GZ01株L1基因进行序列分析,并对其编码蛋白进行二级结构、三级结构、B细胞表位、保守结构域、跨膜结构域和信号肽预测。结果显示,L1基因序列全长为1 494bp,编码497个氨基酸;与BPV2、BPV2-SW01、BPV2-AKS01、BPV13、BPV1株相应序列核苷酸同源性分别为99.1%、99.8%、99.4%、87.6%和82.8%,氨基酸同源性分别为98.6%、99.4%、98.4%、94.4%和91.3%;系统进化树显示,BPV-GZ01株与BPV2-SW01株亲缘关系最近;L1蛋白二级结构以无规则卷曲、β-折叠和α-螺旋区域所占比例较大,预测此蛋白可能存在6个B细胞优势抗原表位,无跨膜区域,无信号肽区域;三级结构呈弯曲状螺旋结构。本研究结果将为贵州省BPV免疫诊断及核酸疫苗研究提供理论依据。
【作者单位】： 贵州大学动物科学学院;贵州省动物疫病研究室;贵州省畜禽遗传资源管理站;
【关键词】： 牛乳头状瘤病毒 L基因 生物信息学分析 蛋白结构预测
【基金】：贵州省农业委员会科技专项《动物疫病防控能力提升专项》(黔农财[2015]149号) “贵州省动物疫病防控与兽医公共卫生保障科技创新人才团队”(黔科合人才团队[2015]4016号) 贵州省黔南州社会发展科技重大计划项目《喀斯特石漠化林草牧综合治理技术研究与示范》[黔南社发科(20140325)] 贵州现代肉牛产业技术体系专项(GZCYTX2015-0302-02)
【分类号】：S852.65
【正文快照】： contain 6potential antigen epitopes.And no transmembrane domains and no signal peptide werefound.The tertiary structure of L1protein was curved spiral structure.These results provided atheoretical basis for immunologic diagnosis and further research of n

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本文编号：1082798