外源谷胱甘肽促进牛体外受精胚胎发育的机制
本文关键词:外源谷胱甘肽促进牛体外受精胚胎发育的机制
更多相关文章: 牛 谷胱甘肽 体外受精胚胎 抗氧化 转录组测序
【摘要】:在胚胎的体外培养过程中会有氧自由基(reactive oxygen species,ROS)的产生,正常情况下胞内产生和清除ROS的量会维持平衡状态,然而这种状态一旦遭到破坏就会使胞内积累过多的ROS,过量的ROS会损伤细胞,影响胚胎的发育能力。抗氧化剂谷胱甘肽(glutathione,GSH)能清除ROS,由ROS带来的氧化应激不能损伤到胚胎,最终对胚胎的体外发育和胚胎质量都能有所提高。然而,外源GSH如何进入体外培养的胚胎内,并有效清除ROS的机制并不清楚,因此本文采用胚胎工程、细胞生物学、分子生物学和转录组学方法揭示外源GSH的转运及其对胞内ROS的作用机制,及GSH处理对胚胎转录组水平的影响,为胚胎体外生产效率的提高提供理论基础。牛体外受精胚胎培养液中添加3毫摩尔每升(mmol/L,mM)GSH后继续培养到7天,分别统计各阶段的胚胎发育率及囊胚总细胞数;同时,测定受精后8h、18h、24h和32h胚胎内的ROS和GSH含量。采用酶联免疫测定受精后8h、18h、24h和32h胚胎中GSH运输和再合成相关酶(GGT、GGT、5-OPase、GCLC、GCLM和GSS)的活性,及其在基因的mRNA表达水平。结果,GSH添加后,卵裂率及囊胚率明显提高;细胞内ROS含量降低,GSH升高。此外,添加GSH后发现在受精32h时,GGT的mRNA表达量上升,GCLC和GSS的mRNA表达水平下降;在受精后18h时,GGCT的mRNA表达量下降,5-OPase和GCLM的表达量上升。与GSH转运和再合成相关的4种酶的活性也发生了相应的改变。其中,在受精后18h,γ-GCS的活性显著增高(P0.05),GGCT活性则显著降低(P0.05);在受精后32h,GGT的活性显著升高(P0.05),GSS的活性显著降低(P0.05)。说明添加GSH能显著提高体外胚胎发育能力。采用Illumina平台对8-16细胞期和桑椹期的牛体外受精胚胎,进行测序;筛选出差异基因进行功能注释和代谢途径分析;采用定量PCR对十个基因的表达水平进行检测,以验证测序结果的准确性;在获得的新转录本中挑选3组进行RNA和蛋白结构的预测。在对OOSP1,THAP9等10个基因的定量检测、测序结果的质量评价(碱基错误率、Q20、Q30、GC含量)、reads与牛基因组的比对及其在基因组的分布统计分析,均说明该测序结果准确、可靠。与已知的转录本相比,4个新转录本中均发现不同长度的新外显子;预测的蛋白结构中除包含各自的保守结构域(丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶的催化结构域、MAD同源结构域)外,还发现2个新的蛋白结构域(低复杂区、dwarfins蛋白家族B结构域)。在培养液中添加GSH能导致胚胎转录谱的变化,显著提高胚胎的体外发育能力。
【关键词】:牛 谷胱甘肽 体外受精胚胎 抗氧化 转录组测序
【学位授予单位】:河北工程大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:S823
【目录】:
- 缩略词(Abbreviation)5-7
- 摘要7-9
- Abstract9-14
- 第一章 文献综述14-23
- 1.1 早期胚胎发育14-15
- 1.2 谷胱甘肽在胚胎发育中的作用15-16
- 1.3 转录组测序的研究现状16
- 1.4 基因功能验证及新转录本功能预测16-21
- 1.4.1 生物信息学分析17-18
- 1.4.2 分子生物学技术18-20
- 1.4.3 蛋白水平分析20
- 1.4.4 表型分析20-21
- 1.5 本研究的目的意义21-23
- 第二章 谷胱甘肽对分裂前胚胎发育的影响23-36
- 2.1 试验材料23-24
- 2.1.1 试验材料23
- 2.1.2 主要仪器和设备23-24
- 2.1.3 主要试剂和耗材24
- 2.2 实验方法24-29
- 2.2.1 主要溶液的配制24-25
- 2.2.2 卵母细胞的采集和体外成熟培养25
- 2.2.3 体外受精25
- 2.2.4 体外培养25
- 2.2.5 囊胚总细胞数计算25-26
- 2.2.6 卵母细胞和合子内GSH、ROS含量的检测26
- 2.2.7 qRT-PCR检测基因表达情况26-28
- 2.2.8 与GSH转运合成相关酶的活性测定28-29
- 2.3 实验结果与分析29-33
- 2.3.1 谷胱甘肽对胚胎发育的影响29-30
- 2.3.2 对内源性GSH、ROS的影响30-31
- 2.3.3 对谷胱甘肽转运合成相关基因的影响31-32
- 2.3.4 对谷胱甘肽转运合成相关酶的影响32-33
- 2.4 讨论33-36
- 第三章 转录组测序质量评估36-42
- 3.1 实验材料36
- 3.1.1 实验材料36
- 3.1.2 主要仪器和设备36
- 3.1.3 主要试剂和耗材36
- 3.2 实验方法36-37
- 3.2.1 建库测序36-37
- 3.2.2 测序质量的控制37
- 3.3 实验结果与分析37-41
- 3.3.1 测序数据的质量情况汇总37-39
- 3.3.2 READS与参考基因组比对情况39-40
- 3.3.3 READS在参考基因组不同区域的分布情况40-41
- 3.4 讨论41-42
- 第四章 新转录本的预测及定量PCR验证42-49
- 4.1 实验材料42
- 4.1.1 实验材料42
- 4.1.2 主要仪器和设备42
- 4.1.3 主要试剂和耗材42
- 4.2 实验方法42-44
- 4.2.1 新转录本的ORF预测和功能预测42-43
- 4.2.2 cDNA的样品制备和定量检测43
- 4.2.3 引物设计及定量验证43-44
- 4.3 实验结果与分析44-48
- 4.3.1 新转录本ORF预测44-45
- 4.3.2 功能结构域预测45-47
- 4.3.3 定量PCR检测结果与转录组比较47-48
- 4.4 讨论48-49
- 第五章 全文总结49-50
- 参考文献50-55
- 致谢55-56
- 作者简介56-57
- 攻读硕士学位期间发表的论文57-58
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