短膜壳绦虫线粒体全基因组序列测定和DNA多态性研究

发布时间：2017-11-04 20:15

本文关键词：短膜壳绦虫线粒体全基因组序列测定和DNA多态性研究

【摘要】：短膜壳绦虫(Hymenolepis nana)是寄生在人或啮齿动物小肠内的一种常见的人兽共患寄生虫,能够引起膜壳绦虫病。尽管短膜壳绦虫是一种人兽共患寄生虫,并能够在各国引起严重的社会经济问题,但短膜壳绦虫的遗传学、系统学、流行病学和生物学却鲜为人知。短膜壳绦虫病作为一种易于忽视的人兽共患病需引起关注。本研究运用PCR方法扩增了来自中国7个不同地区的短膜壳绦虫样品的线粒体3段基因pnad5,rrnS和atp6,并根据这3段基因进行了核苷酸序列差异和多态性分析。结果显示3段线粒体基因的长度分别是710 bp,704~711 bp和516 bp。pnad5片段的A+T%含量是70.1%~73.5%,rrnS片段的A+T%含量为70.1%~71.7%,而atp6的A+T%含量为76.6%~77.9%。种内差异最小的片段是pnad5,为0~0.7%,atp6种内差异为0~1.4%;rrnS种内差异最大,为0~1.7%。将短膜壳绦虫3段线粒体基因与缩小膜壳绦虫(Hymenolepis diminuta)相应片段进行序列分析,结果显示两者种间差异较大,rrnS片段种间差异为16.1%~17.6%;atp6种间差异为26.5%~27.1%;pnad5片段种间差异最大,为31.6%~31.7%。应用最大简约法对3段基因的拼接序列进行进化分析,结果显示分离自不同地区的短膜壳绦虫聚在一起,仅有张家口样品单独位于一个进化枝上,可见短膜壳绦虫三段线粒体基因进化树中,进化分支与地理分布没有直接的关系,也没有一定的规律可循,来自同一地区的样品不总在同一分支上,此进化分析结果支持了前人对短膜壳绦虫可能是复合种或隐藏种的结论。应用长PCR方法对短膜壳绦虫线粒体全基因进行测序和基因定位。结果显示短膜壳绦虫线粒体全长为13764 bp,一共有36个基因和2个非编码区。其中12为编码线粒体蛋白质基因、2个核糖体基因和22个tRNA基因。所有基因分布在重链上并沿同一个方向进行转录和复制。所有基因排列顺序与其姊妹种缩小膜壳绦虫(H.diminuta)一致。以12个蛋白质编码基因拼接序列应用贝叶斯法、最大似然法和最大简约法进行进化分析,结果显示所用绦虫线粒体基因组序列分为两个明显进化枝,有较高的节点支持。一个是假叶目的双叶槽科(Diphyllobothriidae);另一个是圆叶目。其中圆叶目的带科(Taeniidae)、膜壳科(Hymenolepididae)和复孔科(Dipylidiidae)内分化较为明显,独立分支。本研究测定了短膜壳绦虫线粒体全基因组序列并进行进化分析,为短膜壳绦虫的分子分类学、种群遗传学研究提供了遗传标记,丰富了基因组学的研究内容,对人类短膜壳绦虫疾病的诊断防控都具有重要的意义。
【学位授予单位】：华南农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S852.7

【参考文献】

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