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内蒙古沙葱萤叶甲种群的遗传多样性和遗传分化

发布时间:2017-12-14 23:27

  本文关键词:内蒙古沙葱萤叶甲种群的遗传多样性和遗传分化


  更多相关文章: 沙葱萤叶甲 微卫星标记 线粒体COI基因 基因流 单倍型 内蒙古


【摘要】:沙葱萤叶甲Galeruca daurica (Joannis)是一种近年来在内蒙古草原上猖獗成灾的新害虫。本文应用微卫星标记和线粒体COI基因标记对内蒙古沙葱萤叶甲8个地理种群的遗传多样性、基因流和遗传分化等进行分析,以期明确内蒙古沙葱萤叶甲不同地理种群间的遗传多样性及遗传分化。主要研究结果如下:1.应用L16(45)正交试验设计对影响PCR的5种因素(Mg2+、dNTPs、引物、模板和Taq DNA聚合酶)的用量进行筛选,并用最佳反应体系筛选引物。得到最佳反应体系(20μL)为:10 X Buffer (Mg2+ free) 2μL、MgCl2 (25 mmol/L) 1.2 μL、 dNTPs Mixture 1.6 μL、DNA模板1.0μL、primer(10 μmol/L) 0.8μL、Taq聚合酶(;5 U/μL) 0.2 μL、ddH2O 12.4μL;筛选得到能够稳定性扩增的5对引物:Dviz13,Dba08, Dviz12, Mv-MS11和Ls-A121。2.应用5对微卫星引物分析了内蒙古沙葱萤叶甲8个地理种群的遗传多样性。8个地理种群在5个微卫星位点的等位基因数为10-18,有效等位基因数为9.2796-16.0388,多态信息含量值为0.6760~0.8985,期望杂合度为0.3430~0.5284,说明所选5个微卫星位点均为高度多态性位点。8个种群的期望杂合度为0.2216~0.3701,平均值为0.2680;种群间遗传分化系数为0.1244-0.4116,平均值为0.2521;种群间基因流为0.3574~1.7596,平均值为0.9622。8个地理种群根据遗传距离聚为3个分支,遗传距离与地理距离呈显著的正相关关系(r=0.4854,P=0.0180)。本研究结果表明:沙葱萤叶甲种群遗传多样性低,不同地理种群之间基因流较小,遗传分化程度高;沙葱萤叶甲迁移能力弱和地理阻碍可能是限制其基因交流和导致遗传高度分化的主要原因。3.测定了采自内蒙古8个地理种群的197头沙葱萤叶甲的线粒体COl基因417bp序列。在所分析的197个COI序列中,共有43个变异位点和62个单倍型,其中2个单倍型为各种群共享,每个种群具有3个及以上的独享单倍型。总种群的单倍型多态度指数Hd为0.9466,不同地理种群单倍型多态度Hd在0.8889~0.9600之间。总群体固定系数FST为0.0315,基因流Nm为15.37。中性检验结果不显著(Tajima's D=-1.6300,0.10P0.05),说明内蒙古沙葱萤叶甲在较近的历史时期内没有出现种群扩张现象。分子变异分析(AMOVA)结果表明,沙葱萤叶甲的遗传分化主要来自种群内部(96.34%),而种群间未发生明显的遗传分化。各种群间遗传分化程度与地理距离无显著相关性。不同地理种群的单倍型在中介网络图上散布在不同的分布群中,未形成明显的地理分布格局。
【学位授予单位】:内蒙古农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:S812.6

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本文编号:1289761

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