金川牦牛HIF-3A克隆及生物信息学分析

发布时间：2018-01-22 03:17

  本文关键词： 金川牦牛 低氧诱导因子-a 克隆 生物信息学分析　出处：《生物技术》2017年05期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：[目的]克隆金川牦牛低氧诱导因子-3A(HIF-3A)并进行生物信息学的分析。[方法]采用PCR方法从金川牦牛血液中克隆出HIF-3A,通过生物学软件Protparam、SOPMA、ProtScale、NetPhos、SignaIP、TMHMM、PSORTⅡ、Protfun2.2对核酸序列以及蛋白进行分析。[结果]金川牦牛HIF-3A长度为513 bp、ORF为441 bp、一共编码氨基酸146个,相对分子质量为15 729.19 Da,和普通牛的CDS区有8个碱基不同,突变了5个氨基酸,预测无跨膜区域,不存在信号肽序列,主要位于细胞质与线粒体中,有β-转角和α-螺旋。在同源性比较中与牛的同源性达到了97.5%,与其他物种同源性较低。[结论]成功克隆出金川牦牛的HIF-3A基因,且不同属的物种间不具有较高的保守性,为非分泌蛋白。
[Abstract]:[Objective: to clone the hypoxia inducible factor-3 AHIF- 3 A of Jinchuan Yak and analyze it by bioinformatics. [Methods: HIF-3A was cloned from the blood of Jinchuan yak by PCR method. The HIF-3A was cloned from the blood of Jinchuan yak. The HIF-3A was cloned from the blood of Jinchuan yak. The nucleic acid sequence and protein were analyzed by signal IPN TMHMMN PSORT 鈪，

本文编号：1453474