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携带遗传标记的猪圆环病毒2型贵州分离株感染性克隆的构建

发布时间:2018-02-26 15:22

  本文关键词: 猪圆环病毒2型 生物信息学 遗传标记 感染性克隆 iDNA疫苗 出处:《贵州大学》2015年硕士论文 论文类型:学位论文


【摘要】:猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)是无囊膜单股环状负链DNA病毒,基因组大小约为1.8kb,属于圆环病毒科,圆环病毒属。PCV2是引起断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)的主要病原体,可以引起猪圆环病毒相关疾病(PCVAD),其主要症状表现为皮肤苍白、消瘦、腹泻、呼吸障碍、黄疸等症状,发病猪群死亡率高和繁殖障碍等,给养猪业带来了巨大的经济损失。疫苗免疫接种是防控PCV2感染的有效手段,有关PCV2疫苗的研究已成为国内外学者的关注热点。由于近些年来提出的i DNA疫苗具有多项传统疫苗无法比拟的优点,该类疫苗为应用感染性克隆技术构建的新型核酸疫苗,在机体内能够发挥弱毒疫苗和核酸疫苗的双重免疫效果,具有较好的研发前景。本研究应用i DNA疫苗技术构建了一种携带遗传标记的PCV2新型感染性克隆,并对其免疫效果进行了初步研究,初步验证了PCV2 iDNA新型标记疫苗构建策略的正确性,为研究开发PCV2 iDNA标记疫苗奠定了前期基础。主要研究内容如下:1、猪圆环病毒2型GZ-RH1株全基因组遗传特征分析为掌握PCV2 Cap蛋白末端具有赖氨酸延伸特征的GZ-RH1株(JQ809464)的全基因组遗传特征和后续研究提供科学参考,应用生物信息学的方法和工具对其基因的结构和功能、编码蛋白的二级和三级结构、分子系统进化关系以及密码子偏好性等进行了预测和分析。全基因组核苷酸序列分析表明该毒株与先前报道的含有11个ORF框的PCV2毒株(AF027217)相比,ORF8和ORF11缺失,ORF5和ORF10终止密码子提前,其它ORFs则相对较为保守。推导蛋白的预测结果表明:PCV2 GZ-RH1各编码蛋白中除ORF4和ORF9外,其它蛋白均是亲水性蛋白,且仅ORF9编码的蛋白存在信号肽序列;ORF1和ORF2编码蛋白的潜在磷酸化位点与疫苗毒株相比,ORF1较为保守,ORF2则差异较大。编码主要蛋白的二级结构显示,均为混合型蛋白;ORF1、2、3编码蛋白的结构域和功能基序分析显示,除都具有自身蛋白家族的保守结构域外,还预测到一些可能具有特殊功能的结构域,如ORF1编码蛋白的NACHT结构域ORF2编码蛋白的精氨酸富集区;ORF2编码蛋白的三级结构预测结果显示,其和疫苗毒株结构具有较高的相似性。系统进化分析显示,PCV2 GZ-RH1毒株属于PCV2b亚型。ORF2编码蛋白氨基酸位点熵值结果显示,氨基酸变异较大,且含有两个高变区,分别位于第53~91位和185~215位。ORF2基因密码子偏爱性分析显示,昆虫细胞与其密码子偏爱性较为接近,更适合其体外表达。2、携带遗传标记的PCV2感染性克隆的构建及iDNA疫苗的初步研究为构建获得携带遗传标记的猪圆环病毒2型感染性克隆质粒(iDNA),并对其进行PCV2 iDNA疫苗的初步研究,实验以Cap蛋白末端具有赖氨酸延伸特征的PCV2 GZ-RH1株为材料,构建了该毒株的感染性克隆质粒pcDNA3.1(+)-PCV2,并在病毒基因组中引入一个SalⅠ酶切位点作为鉴别拯救病毒的遗传标记。将该感染性克隆质粒转染PK-15传代细胞后,拯救获得的PCV2标记毒株,经盲传10代后毒价可到105.3TCID50/mL,引入的遗传标记能够稳定存在。为进一步评估该PCV2 i DNA候选标记疫苗在昆明小鼠体内的生物学特性,将20只小鼠随机分为4组,实验Ⅰ组肌肉注射100μg PCV2 iDNA候选标记疫苗(质粒pcDNA3.1(+)-PCV2),实验Ⅱ组肌肉注射0.1mL拯救病毒PCV2-RV(104TCID50/mL),实验III组肌肉注射100μg pcDNA3.1(+)空质粒阴性对照组,实验Ⅳ组肌肉注射0.1mL MEM营养液阴性对照组,而后分别于接种后7、14、21、28、35、42d小鼠断尾采血,检测PCV2特异性抗体水平和病毒血症持续时间。结果显示,接种PCV2 iDNA候选标记疫苗和其体外拯救病毒的小鼠特异性抗体水平明显高于对照组,接种后7d即可检测出PCV2阳性抗体且至少可维持42d;经PCR检测证实,PCV2 i DNA候选标记疫苗和其体外拯救病毒均能够在小鼠体内增殖,导致小鼠产生病毒血症的持续时间约28d。上述研究结果表明,本研究所提出的PCV2 iDNA新型标记疫苗的构建策略是可行的,并为进一步研究开发PCV2 i DNA新型标记疫苗奠定了基础。
[Abstract]:......
【学位授予单位】:贵州大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:S852.65

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本文编号:1538574

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