山羊地方性鼻内肿瘤病毒Shaanxi株前病毒全基因组克隆及生物信息学分析
发布时间:2018-02-28 11:00
本文关键词: 山羊 地方性鼻内肿瘤病毒 全基因克隆 生物信息学分析 出处:《中国预防兽医学报》2017年01期 论文类型:期刊论文
【摘要】:为研究山羊地方性鼻内肿瘤病毒(ENTV)Shaanxi株前病毒全基因组序列,本研究根据Gen Bank中收录的ENTV前病毒基因组序列设计5对引物,通过PCR方法从肿瘤组织中分段扩增获得了ENTV前病毒全基因组的5个片段,测序并分析。结果显示该病毒基因组全长7 275 bp,包含相互重叠的gag-pro-pol-env编码区及5'端非编码区;ENTV Shaanxi株基因组全序列与NC004994.2、AY197548.2、ENTV-SC株(HM104174.1)核苷酸同源性分别为89%、89%、99%。本研究为ENTV的分子生物学特性研究提供资料,为进一步研究其检测方法与致病机理奠定了基础。
[Abstract]:For the study of goat enzootic nasal tumor virus (ENTV) Shaanxi provirus genome sequence, according to the Gen Bank ENTV included before the virus genome sequence of 5 pairs of primers were designed by the method of PCR from tumor tissue sections was obtained before ENTV virus 5 fragments of the genome sequencing and analysis results. The virus genome is 7275 BP, including overlapping gag-pro-pol-env encoding and 5'encoding non end zone; genomic ENTV Shaanxi nucleotide sequence with NC004994.2, AY197548.2, ENTV-SC strains (HM104174.1) nucleotide homology were 89%, 89%, 99%. this study provided data for the study of molecular biology of ENTV, which laid the foundation for the further research on the detection method and the pathogenic mechanism.
【作者单位】: 西北农林科技大学动物医学院;
【基金】:陕西省农业科技创新与攻关项目(2016NY-092) 陕西省重点产业创新链项目(2016KTZDNY02-06) 西北农林科技大学试验示范站(基地)科技成果推广项目(TGZX2015-32)
【分类号】:S852.654
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