鸡长链非编码RNA发掘及组织特异性表达分析

发布时间：2018-03-03 14:47

  本文选题：鸡　切入点：RNA-seq　出处：《东北农业大学学报》2016年07期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lnc RNA)是一类长度大于200个核苷酸、缺少蛋白编码功能的RNA。lnc RNA可从多层面调控基因表达,影响表型性状。鸡作为重要经济动物和模式生物,lnc RNA研究相对滞后。为加快鸡lnc RNA研究进展,利用公共数据库(如NCBI-SRA等)中鸡高通量转录组测序(RNA-seq)数据,通过生物信息学方法发掘8 040条鸡lnc RNA,发现大量组织特异性表达lnc RNA,为鸡lnc RNA功能研究奠定基础。
[Abstract]:Long chain noncoding RNA(Long non-coding RNAs are a class of RNA.lnc RNA, which is more than 200 nucleotides in length and lacks the function of protein coding to regulate gene expression from multiple levels. Chicken, as an important economic animal and model organism, lagged behind in the study of phenotypic traits. In order to accelerate the progress of chicken lnc RNA research, high throughput transcriptome sequencing RNA-seq data from public databases (such as NCBI-SRA, etc.) were used. 8 040 chicken lnc RNAs were discovered by bioinformatics, and a large number of tissue-specific lnc RNAs were found, which laid a foundation for the study of chicken lnc RNA function.
【作者单位】： 农业部鸡遗传育种重点实验室黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室东北农业大学动物科学技术学院;
【基金】：国家863计划项目(2013AA102501) 现代农业产业技术体系建设专项资金资助项目(CARS-42) 国家自然科学基金(31472088)
【分类号】：S831

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