7个猪品种IBSP基因结构变异SV13的群体分析

发布时间：2018-04-02 19:26

  本文选题：地方猪品种　切入点：结构变异　出处：《畜牧与兽医》2017年04期

【摘要】：应用Hiseq 2000平台测定了香猪的全基因组序列,从中发现整合素结合涎蛋白(IBSP)基因内含子4中存在结构变异,命名为SV13,为了进一步探究SV13在猪群体中的分布,采用PCR技术检测了7个猪品种的SV13基因型。7个猪品种群体中均存在DD、DA和AA三种基因型,对纯合的DD和AA基因型测序,明确D等位基因缺失了227 bp。香猪、可乐猪和糯谷猪群体以DD为优势基因型,大白猪以AA基因型为主,6个地方猪品种群体中D的基因频率明显高于大白猪品种(P0.01),香猪和大白猪群体基因型频率处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P0.05)。SV13可以作为辅助鉴别6个地方猪品种和大白猪的分子标记。
[Abstract]:The whole genome sequence of Xiang pig was determined by using Hiseq 2000 platform. The structural variation in intron 4 of integrin binding sialoprotein sialoprotein gene was found, named SV13, in order to further explore the distribution of SV13 in pig population.The SV13 genotypes of 7 pig breeds were detected by PCR technique. The homozygous DD and AA genotypes were sequenced and the D allele was found to be lacking 227 BP.DD was the dominant genotype in Xiang pig, cola pig and waxy pig population.The frequency of D gene in 6 local pig populations was significantly higher than that in large white pig breeds (P0.01G). The genotype frequency of Xiang pig and big white pig population was in the state of Hardy-Weinberg imbalance. SV13 could be used as an assistant to identify 6 places.Molecular markers of pig breeds and large white pigs.
【作者单位】： 贵州大学生命科学学院;贵州大学农业生物工程研究院;贵州大学动物科学学院;
【基金】：国家高技术研究发展计划(863计划)(2013AA102-503) 贵州省农业攻关项目(黔科合NY[2013]3073号) 贵州大学研究生创新基金(研农2016003) 贵州省“百”层次创新型人才项目(黔科合人才2016-4012号) 国家自然科学基金(31672390)
【分类号】：S828

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本文编号：1701776